总结吗?
GeneID 6880年
象征 TAF9
同义词 德国:5067 | STAF31/32 | TAF2G | TAFII-31 | TAFII-32 | TAFII31 | TAFII32 | TAFIID32
描述 着重结合蛋白相关因素9
参考 MIM: 600822|HGNC: HGNC: 11542|运用:ENSG00000085231|运用:ENSG00000273841|HPRD: 15983|织女:OTTHUMG00000099359织女:OTTHUMG00000187252
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 5 q13.2
帕斯卡假定值 0.817
夏洛克假定值 0.975
胎儿β -0.467
eGene 前扣带皮层BA24
迈尔斯的顺式和反式
支持 CompositeSet

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
认为:Fromer_2014 全外显子组测序分析 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。

部分即遗传学和表观遗传学注释

@认为表

基因 染色体 位置 裁判 Alt 成绩单 AA变化 突变类型 筛选 CG46 特征 研究
TAF9 chr5 68660837 G 一个 NM_001015891
NM_001015892
NM_003187
NM_016283

p.243A > V
p.243A > V
intronic
错义
错义
intronic
精神分裂症 认为:Fromer_2014

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
snp_a - 1983537 0 TAF9 6880年 0.12 反式
rs9885507 5 68579196 TAF9 ENSG00000085231.9 4.29318 e-6 0.04 85793年 gtex_brain_ba24
rs71622282 5 68579200 TAF9 ENSG00000085231.9 4.30593 e-6 0.04 85789年 gtex_brain_ba24
rs34487969 5 68579204 TAF9 ENSG00000085231.9 4.2618 e-6 0.04 85785年 gtex_brain_ba24
rs13356824 5 68579208 TAF9 ENSG00000085231.9 4.29314 e-6 0.04 85781年 gtex_brain_ba24

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
ECHDC2 0.57 0.54
MXRA8 0.53 0.52
LCAT 0.51 0.57
NLRX1 0.51 0.59
GSX1 0.51 0.34
EML3 0.51 0.55
A2ML1 0.50 0.59
SLC12A4 0.50 0.60
BCAN 0.49 0.57
C9orf61 0.49 0.59
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
TBR1 -0.43 -0.33
KLHL1 -0.42 -0.30
RLBP1L1 -0.42 -0.39
SOX5 -0.42 -0.28
AFF3 -0.42 -0.33
SEMA3A -0.41 -0.32
XPR1 -0.41 -0.33
DAB1 -0.41 -0.28
BACH2 -0.41 -0.27
TIAM2 -0.41 -0.33

第四部分,注释蛋白质间交互作用

扶少团团员 别名B 官方全名B 实验 PubMed ID
C7orf64 DKFZP564O0523 | DKFZp686D1651 | HSPC304 64年7号染色体开放阅读框 2台混合动力 BioGRID 16169070
CEBPB C / EBP-beta | CRP2 | IL6DBP | |圈MGC32080 | NF-IL6 | TCF5 CCAAT /增强子结合蛋白(C / EBP),β - - - - - - HPRD 10821850
DRAP1 NC2-alpha DR1-associated蛋白1(α-代数余子式2) 2台混合动力 BioGRID 16189514
EEF1A1 CCS-3 | CCS3 | EEF-1 | EEF1A | EF-Tu | EF1A | FLJ25721 | GRAF-1EF | HNGC: 16303 | LENG7 | MGC102687 | MGC131894 | MGC16224 | PTI1 | eEF1A-1 真核翻译延长因子1α1 2台混合动力 BioGRID 16169070
ELF3 EPR-1 | ERT | ESE-1 | ESX E74-like因子3 (ets域转录因子,epithelial-specific) - - - - - - HPRD 10821850
GTF2B TF2B | TFIIB IIB通用转录因子 - - - - - - HPRD 7597030
HCFC1 CFF | HCF-1 | HCF1 | HFC1 | MGC70925 | VCAF 宿主细胞因子C1 (VP16-accessory蛋白质) - - - - - - HPRD 7597030|10821850
HSF1 HSTF1 热休克转录因子1 - - - - - - HPRD 11005381
HSF1 HSTF1 热休克转录因子1 - - - - - - HPRD 10821850
KAT2B CAF P P / CAF | | | PCAF K(赖氨酸)乙酰转移酶2 b 亲和力Capture-Western BioGRID 12660246
MLL 1 | CXXC7 | FLJ11783 | HRX | HTRX1 | KMT2A | MLL / GAS7 | MLL1A | TET1-MLL | TRX1 骨髓/淋巴或mixed-lineage白血病(trithorax同系物,果蝇) - - - - - - HPRD 10821850
MYC bHLHe39 |原癌基因 v-myc myelocytomatosis病毒致癌基因相同器官(禽流感) 亲和力Capture-Western
Co-purification
重新组成复杂
BioGRID 12660246
NFATC2 KIAA0611 | NFAT1 | NFATP 核转录因子激活t细胞,细胞质,calcineurin-dependent 2 - - - - - - HPRD 10821850
RPS14 EMTB 核糖体蛋白S14系列 2台混合动力 BioGRID 16189514
SF3B3 KIAA0017 | RSE1 | SAP130 | SF3b130 | STAF130 剪接因子3 b亚基130 kda - - - - - - HPRD 11564863
TAF5 TAF2D | TAFII100 TAF5 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,100 kda - - - - - - HPRD, BioGRID 9045704
TAF6 DKFZp781E21155 | MGC: 8964 | TAF2E | TAFII70 | TAFII80 | TAFII85 TAF6 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,80 kda TAF9与TAF6交互。 绑定 15601843
TAF6 DKFZp781E21155 | MGC: 8964 | TAF2E | TAFII70 | TAFII80 | TAFII85 TAF6 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,80 kda - - - - - - HPRD 7597030|7667268
|15601843
TAF6L FLJ11136 | MGC4288 | PAF65A TAF6-like RNA聚合酶II, p300 / CBP-associated因子(PCAF)相关因素,65 kda - - - - - - HPRD 9674425
真沸点 GTF2D | GTF2D1 | MGC117320 | MGC126054 | MGC126055 | SCA17 | TFIID TATA盒结合蛋白 Co-purification BioGRID 9153318
TP53 FLJ92943 | LFS1 | TRP53 | p53 肿瘤蛋白质p53 - - - - - - HPRD, BioGRID 7761466
TP53 FLJ92943 | LFS1 | TRP53 | p53 肿瘤蛋白质p53 - - - - - - HPRD 7761466|7809597
|11278372


部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
KEGG基底转录因子 36 24 所有SZGR 2.0基因通路
PID MYC活性途径 79年 62年 所有SZGR 2.0基因通路
PID MYC通路 25 22 所有SZGR 2.0基因通路
PID P53下游通路 137年 94年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME RNA聚合酶II转录 105年 54 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME RNA聚合酶II转录前启动和启动子 41 21 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME转录 210年 127年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME RNA聚合酶II PRE转录事件 61年 32 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME艾滋病毒感染 207年 122年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME艾滋病毒生命周期 125年 69年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME艾滋病毒生命周期的后期阶段 104年 61年 所有SZGR 2.0基因通路
PUIFFE入侵被腹水DN 145年 91年 所有SZGR 2.0基因通路
迪亚兹慢性MEYLOGENOUS白血病 1382年 904年 所有SZGR 2.0基因通路
TIEN肠道益生菌2小时DN 88年 53 所有SZGR 2.0基因通路
TIEN肠道益生菌6小时DN 167年 One hundred. 所有SZGR 2.0基因通路
罗德里格斯甲状腺癌分化不良 633年 376年 所有SZGR 2.0基因通路
罗德里格斯甲状腺未分化癌 722年 443年 所有SZGR 2.0基因通路
PROVENZANI转移了 194年 112年 所有SZGR 2.0基因通路
ENK紫外线反应表皮DN 508年 354年 所有SZGR 2.0基因通路
NAGY TFTC组件人类 19 11 所有SZGR 2.0基因通路
NAGY STAGA组件人类 15 8 所有SZGR 2.0基因通路
NAGY PCAF组件人类 9 7 所有SZGR 2.0基因通路
SPIELMAN淋巴母细胞欧洲和亚洲的DN 584年 395年 所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652年 1023年 所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA CHEK2 PCC网络 779年 480年 所有SZGR 2.0基因通路
布伊泰尔特说光动力治疗压力 811年 508年 所有SZGR 2.0基因通路
魏MYCN目标与E箱 795年 478年 所有SZGR 2.0基因通路
SCHAEFFER前列腺癌发展6人力资源 176年 115年 所有SZGR 2.0基因通路
鲜明的前额叶皮层22 q11删除DN 517年 309年 所有SZGR 2.0基因通路
酒井法子肿瘤浸润的单核细胞DN 81年 51 所有SZGR 2.0基因通路
谢泼德粉碎和燃烧突变 197年 110年 所有SZGR 2.0基因通路
GOLDRATH稳态扩散 171年 102年 所有SZGR 2.0基因通路
阿尔茨海默病DN布莱洛克的 1237年 837年 所有SZGR 2.0基因通路
王顺铂的反应和XPC DN 228年 146年 所有SZGR 2.0基因通路
对紫外线C0 SESTO回应 107年 72年 所有SZGR 2.0基因通路
KRIGE TOSEDOSTAT反应6小时 953年 554年 所有SZGR 2.0基因通路
KRIGE应对TOSEDOSTAT 24小时DN 1011年 592年 所有SZGR 2.0基因通路
西方肾上腺皮质肿瘤了 294年 199年 所有SZGR 2.0基因通路
米利伪足趋触性了 518年 299年 所有SZGR 2.0基因通路
开罗肝母细胞癌类了 605年 377年 所有SZGR 2.0基因通路
古铁雷斯多发性骨髓瘤起来 35 24 所有SZGR 2.0基因通路
么时间响应黄体酮集群11 103年 68年 所有SZGR 2.0基因通路
WHITFIELD细胞周期G1 148年 95年 所有SZGR 2.0基因通路
DN PILON KLF1目标 1972年 1213年 所有SZGR 2.0基因通路
约翰斯通PARVB目标3 DN 918年 550年 所有SZGR 2.0基因通路
DN FEVR CTNNB1目标 553年 343年 所有SZGR 2.0基因通路