基因页面:TAF9
总结吗?
GeneID | 6880年 |
象征 | TAF9 |
同义词 | 德国:5067 | STAF31/32 | TAF2G | TAFII-31 | TAFII-32 | TAFII31 | TAFII32 | TAFIID32 |
描述 | 着重结合蛋白相关因素9 |
参考 | MIM: 600822|HGNC: HGNC: 11542|运用:ENSG00000085231|运用:ENSG00000273841|HPRD: 15983|织女:OTTHUMG00000099359织女:OTTHUMG00000187252 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 5 q13.2 |
帕斯卡假定值 | 0.817 |
夏洛克假定值 | 0.975 |
胎儿β | -0.467 |
eGene | 前扣带皮层BA24 迈尔斯的顺式和反式 |
支持 | CompositeSet |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
认为:Fromer_2014 | 全外显子组测序分析 | 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
TAF9 | chr5 | 68660837 | G | 一个 | NM_001015891 NM_001015892 NM_003187 NM_016283 |
。 p.243A > V p.243A > V 。 |
intronic 错义 错义 intronic |
精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
snp_a - 1983537 | 0 | TAF9 | 6880年 | 0.12 | 反式 | |||
rs9885507 | 5 | 68579196 | TAF9 | ENSG00000085231.9 | 4.29318 e-6 | 0.04 | 85793年 | gtex_brain_ba24 |
rs71622282 | 5 | 68579200 | TAF9 | ENSG00000085231.9 | 4.30593 e-6 | 0.04 | 85789年 | gtex_brain_ba24 |
rs34487969 | 5 | 68579204 | TAF9 | ENSG00000085231.9 | 4.2618 e-6 | 0.04 | 85785年 | gtex_brain_ba24 |
rs13356824 | 5 | 68579208 | TAF9 | ENSG00000085231.9 | 4.29314 e-6 | 0.04 | 85781年 | gtex_brain_ba24 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ECHDC2 | 0.57 | 0.54 |
MXRA8 | 0.53 | 0.52 |
LCAT | 0.51 | 0.57 |
NLRX1 | 0.51 | 0.59 |
GSX1 | 0.51 | 0.34 |
EML3 | 0.51 | 0.55 |
A2ML1 | 0.50 | 0.59 |
SLC12A4 | 0.50 | 0.60 |
BCAN | 0.49 | 0.57 |
C9orf61 | 0.49 | 0.59 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TBR1 | -0.43 | -0.33 |
KLHL1 | -0.42 | -0.30 |
RLBP1L1 | -0.42 | -0.39 |
SOX5 | -0.42 | -0.28 |
AFF3 | -0.42 | -0.33 |
SEMA3A | -0.41 | -0.32 |
XPR1 | -0.41 | -0.33 |
DAB1 | -0.41 | -0.28 |
BACH2 | -0.41 | -0.27 |
TIAM2 | -0.41 | -0.33 |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
C7orf64 | DKFZP564O0523 | DKFZp686D1651 | HSPC304 | 64年7号染色体开放阅读框 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
CEBPB | C / EBP-beta | CRP2 | IL6DBP | |圈MGC32080 | NF-IL6 | TCF5 | CCAAT /增强子结合蛋白(C / EBP),β | - - - - - - | HPRD | 10821850 |
DRAP1 | NC2-alpha | DR1-associated蛋白1(α-代数余子式2) | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
EEF1A1 | CCS-3 | CCS3 | EEF-1 | EEF1A | EF-Tu | EF1A | FLJ25721 | GRAF-1EF | HNGC: 16303 | LENG7 | MGC102687 | MGC131894 | MGC16224 | PTI1 | eEF1A-1 | 真核翻译延长因子1α1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
ELF3 | EPR-1 | ERT | ESE-1 | ESX | E74-like因子3 (ets域转录因子,epithelial-specific) | - - - - - - | HPRD | 10821850 |
GTF2B | TF2B | TFIIB | IIB通用转录因子 | - - - - - - | HPRD | 7597030 |
HCFC1 | CFF | HCF-1 | HCF1 | HFC1 | MGC70925 | VCAF | 宿主细胞因子C1 (VP16-accessory蛋白质) | - - - - - - | HPRD | 7597030|10821850 |
HSF1 | HSTF1 | 热休克转录因子1 | - - - - - - | HPRD | 11005381 |
HSF1 | HSTF1 | 热休克转录因子1 | - - - - - - | HPRD | 10821850 |
KAT2B | CAF P P / CAF | | | PCAF | K(赖氨酸)乙酰转移酶2 b | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 12660246 |
MLL | 1 | CXXC7 | FLJ11783 | HRX | HTRX1 | KMT2A | MLL / GAS7 | MLL1A | TET1-MLL | TRX1 | 骨髓/淋巴或mixed-lineage白血病(trithorax同系物,果蝇) | - - - - - - | HPRD | 10821850 |
MYC | bHLHe39 |原癌基因 | v-myc myelocytomatosis病毒致癌基因相同器官(禽流感) | 亲和力Capture-Western Co-purification 重新组成复杂 |
BioGRID | 12660246 |
NFATC2 | KIAA0611 | NFAT1 | NFATP | 核转录因子激活t细胞,细胞质,calcineurin-dependent 2 | - - - - - - | HPRD | 10821850 |
RPS14 | EMTB | 核糖体蛋白S14系列 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
SF3B3 | KIAA0017 | RSE1 | SAP130 | SF3b130 | STAF130 | 剪接因子3 b亚基130 kda | - - - - - - | HPRD | 11564863 |
TAF5 | TAF2D | TAFII100 | TAF5 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,100 kda | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9045704 |
TAF6 | DKFZp781E21155 | MGC: 8964 | TAF2E | TAFII70 | TAFII80 | TAFII85 | TAF6 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,80 kda | TAF9与TAF6交互。 | 绑定 | 15601843 |
TAF6 | DKFZp781E21155 | MGC: 8964 | TAF2E | TAFII70 | TAFII80 | TAFII85 | TAF6 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,80 kda | - - - - - - | HPRD | 7597030|7667268 |15601843 |
TAF6L | FLJ11136 | MGC4288 | PAF65A | TAF6-like RNA聚合酶II, p300 / CBP-associated因子(PCAF)相关因素,65 kda | - - - - - - | HPRD | 9674425 |
真沸点 | GTF2D | GTF2D1 | MGC117320 | MGC126054 | MGC126055 | SCA17 | TFIID | TATA盒结合蛋白 | Co-purification | BioGRID | 9153318 |
TP53 | FLJ92943 | LFS1 | TRP53 | p53 | 肿瘤蛋白质p53 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7761466 |
TP53 | FLJ92943 | LFS1 | TRP53 | p53 | 肿瘤蛋白质p53 | - - - - - - | HPRD | 7761466|7809597 |11278372 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG基底转录因子 | 36 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID MYC活性途径 | 79年 | 62年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID MYC通路 | 25 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID P53下游通路 | 137年 | 94年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME RNA聚合酶II转录 | 105年 | 54 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME RNA聚合酶II转录前启动和启动子 | 41 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME转录 | 210年 | 127年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME RNA聚合酶II PRE转录事件 | 61年 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME艾滋病毒感染 | 207年 | 122年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME艾滋病毒生命周期 | 125年 | 69年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME艾滋病毒生命周期的后期阶段 | 104年 | 61年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUIFFE入侵被腹水DN | 145年 | 91年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迪亚兹慢性MEYLOGENOUS白血病 | 1382年 | 904年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
TIEN肠道益生菌2小时DN | 88年 | 53 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
TIEN肠道益生菌6小时DN | 167年 | One hundred. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
罗德里格斯甲状腺癌分化不良 | 633年 | 376年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
罗德里格斯甲状腺未分化癌 | 722年 | 443年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PROVENZANI转移了 | 194年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ENK紫外线反应表皮DN | 508年 | 354年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NAGY TFTC组件人类 | 19 | 11 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NAGY STAGA组件人类 | 15 | 8 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NAGY PCAF组件人类 | 9 | 7 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SPIELMAN淋巴母细胞欧洲和亚洲的DN | 584年 | 395年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652年 | 1023年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779年 | 480年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
布伊泰尔特说光动力治疗压力 | 811年 | 508年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
魏MYCN目标与E箱 | 795年 | 478年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SCHAEFFER前列腺癌发展6人力资源 | 176年 | 115年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
鲜明的前额叶皮层22 q11删除DN | 517年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
酒井法子肿瘤浸润的单核细胞DN | 81年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
谢泼德粉碎和燃烧突变 | 197年 | 110年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GOLDRATH稳态扩散 | 171年 | 102年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿尔茨海默病DN布莱洛克的 | 1237年 | 837年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
王顺铂的反应和XPC DN | 228年 | 146年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
对紫外线C0 SESTO回应 | 107年 | 72年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KRIGE TOSEDOSTAT反应6小时 | 953年 | 554年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KRIGE应对TOSEDOSTAT 24小时DN | 1011年 | 592年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
西方肾上腺皮质肿瘤了 | 294年 | 199年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米利伪足趋触性了 | 518年 | 299年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
开罗肝母细胞癌类了 | 605年 | 377年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
古铁雷斯多发性骨髓瘤起来 | 35 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
么时间响应黄体酮集群11 | 103年 | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
WHITFIELD细胞周期G1 | 148年 | 95年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN PILON KLF1目标 | 1972年 | 1213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
约翰斯通PARVB目标3 DN | 918年 | 550年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN FEVR CTNNB1目标 | 553年 | 343年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |