基因页面:TAF11
总结吗?
| GeneID | 6882年 |
| 象征 | TAF11 |
| 同义词 | 德国:15243 | PRO2134 | TAF2I | TAFII28 |
| 描述 | 着重结合蛋白11个相关因素 |
| 参考 | MIM: 600772|HGNC: HGNC: 11544|运用:ENSG00000064995|HPRD: 15980|织女:OTTHUMG00000014556 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 6 p21.31 |
| 帕斯卡假定值 | 0.201 |
| 夏洛克假定值 | 0.562 |
| 胎儿β | 0.531 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 3 |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 3 |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.033 | |
| GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.04433 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg13028789 | 6 | 34856920 | ANKS1A; TAF11 | 5.64 e-5 | -0.372 | 0.022 | DMG: Wockner_2014 |
| cg00215801 | 6 | 34855797 | TAF11; ANKS1A | 6.94 e-5 | -0.332 | 0.024 | DMG: Wockner_2014 |
| cg02691355 | 6 | 34855834 | TAF11 | 9.21平台以及 | -0.013 | 1.11 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs802402 | chr7 | 90615513 | TAF11 | 6882年 | 0.05 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0003677 | DNA结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 9045704 | |
| 去:0016251 | 一般的RNA聚合酶II转录因子的活动 | 助教 | 9695952 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006355 | 依赖dna的转录调节 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006367 | 从RNA聚合酶II启动子转录起始 | 经验值 | 8946909 | |
| 去:0006368 | RNA RNA聚合酶II发起人的伸长 | 经验值 | 9405375 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005654 | 核浆 | 经验值 | 1939271|2449431|8946909 |
|
| 去:0005669 | 转录因子TFIID复杂 | 艾达 | 14580349 |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
| 扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| CPSF1 | CPSF160 | HSU37012 | P / cl.18 | 乳沟和聚腺苷酸化特定因素160 kda | 在体外 | BioGRID | 9311784 |
| GTF2B | TF2B | TFIIB | IIB通用转录因子 | Co-purification 重新组成复杂 |
BioGRID | 9159119 |
| GTF2E1 | 菲| TF2E1 | TFIIE-A | 通用转录因子国际教育协会多肽1α56 kda | Co-purification 重新组成复杂 |
BioGRID | 9159119 |
| GTF2F1 | BTF4 | RAP74 | TF2F1 | TFIIF | 通用转录因子IIF多肽74 kda | Co-purification 重新组成复杂 |
BioGRID | 9159119 |
| POLR2A | MGC75453 | POLR2 | POLRA | RPB1 | RPBh1 | RPO2 | RPOL2 | RpIILS | hRPB220 | hsRPB1 | DNA聚合酶(RNA) II(导演)多肽,220 kda | Co-purification 重新组成复杂 |
BioGRID | 9159119 |
| RELA | MGC131774 | NFKB3 | p65 | v-rel reticuloendotheliosis病毒致癌基因相同器官(禽流感) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9584164 |
| TAF12 | TAF2J | TAFII20 | TAF12 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,20 kda | - - - - - - | HPRD | 7729427 |
| TAF13 | MGC22425 | TAF2K | TAFII18 | TAF13 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,18 kda | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7729427|9695952 |
| TAF15 | Npl3 | RBP56 | TAF2N | TAFII68 | hTAFII68 | TAF15 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,68 kda | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 |
BioGRID | 9488465 |
| TAF5 | TAF2D | TAFII100 | TAF5 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,100 kda | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9045704 |
| 真沸点 | GTF2D | GTF2D1 | MGC117320 | MGC126054 | MGC126055 | SCA17 | TFIID | TATA盒结合蛋白 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7729427 |
| TRIM24 | PTC6 | RNF82 | TF1A | TIF1 | TIF1A | TIF1ALPHA | hTIF1 | 三方motif-containing 24 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9632676 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG基底转录因子 | 36 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME RNA聚合酶II转录 | 105年 | 54 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME RNA聚合酶II转录前启动和启动子 | 41 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME转录 | 210年 | 127年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME RNA聚合酶II PRE转录事件 | 61年 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME艾滋病毒感染 | 207年 | 122年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME艾滋病毒生命周期 | 125年 | 69年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME艾滋病毒生命周期的后期阶段 | 104年 | 61年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BORCZUK恶性间皮瘤起来 | 305年 | 185年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| TIEN肠道益生菌24小时 | 557年 | 331年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 林格伦膀胱癌集群3 | 329年 | 196年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA XPRSS INT网络 | 168年 | 103年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652年 | 1023年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA BRCA2 PCC网络 | 423年 | 265年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA ATM PCC网络 | 1442年 | 892年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779年 | 480年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA BRCA为中心的网络 | 117年 | 72年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿斯顿重度抑郁症DN | 160年 | 110年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王顺铂的反应和XPC DN | 228年 | 146年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病了布莱洛克的 | 1691年 | 1088年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 外邦人紫外线高剂量DN | 312年 | 203年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| WELCSH BRCA1目标了 | 198年 | 132年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DAZARD应对紫外线这些DN | 318年 | 220年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 外邦人响应集群D3 | 61年 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 约翰斯通PARVB目标2 DN | 336年 | 211年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 约翰斯通PARVB目标3 DN | 918年 | 550年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GOBERT少突细胞分化DN | 1080年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |