概括
基因ID 6885
Symbol MAP3K7
同义词 mekk7 | tak1 | tgf1a
描述 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7
参考 MIM:602614|HGNC:HGNC:6859|ENSEMBL:ENSG00000135341|HPRD:04011|Vega:Otthumg0000000015217
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6q15
Pascal P值 0.066
Sherlock P值 0.221
胎儿β -0.352
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP Genome-wide Association Study GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 This dataset includes 2,104 probes/CpGs associated with SZ patients (n=108) compared to 136 controls at Bonferroni-adjusted P < 0.05. 1
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.0024

第一节遗传学和表观遗传学注释

@Differentially methylated gene

探测 染色体 位置 Nearest gene p(dis) beta(dis) fdr(dis) Study
cg01087382 6 91297190 MAP3K7 9E-8 -0.019 2.06E-5 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

Not available

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
ZBTB10 0.89 0.93
SPIRE1 0.89 0.94
IL17RD 0.89 0.88
Med13 0.88 0.93
RCOR1 0.88 0.91
ZNF192 0.87 0.88
CCNG2 0.87 0.90
BMPR1A 0.87 0.90
RBM12 0.87 0.92
RBM15 0.87 0.91
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
AIFM3 -0.65 -0.74
FXYD1 -0.63 -0.84
S100B -0.63 -0.80
AF347015.31 -0.63 -0.82
HLA-F -0.63 -0.70
C5orf53 -0.63 -0.69
MT-CO2 -0.62 -0.83
TSC22D4 -0.62 -0.74
AF347015.27 -0.62 -0.79
AF347015.33 -0.62 -0.79

第三节。基因本体论注释

Molecular function 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0000287 magnesium ion binding IEA -
去:0004708 MAP激酶激酶活性 IEA -
去:0005515 protein binding IEA -
去:0005515 protein binding IPI 15075345
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0004674 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 IEA -
去:0004713 蛋白酪氨酸激酶活性 IEA -
去:0004709 MAP激酶激酶激酶活性 塔斯 9466656
GO:0016740 transferase activity IEA -
去:0016301 kinase activity IEA -
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000165 MAPKKK级联 IEA -
去:0001525 血管生成 IEA -
GO:0002726 T细胞因子的阳性调节 小鬼 15125833
去:0001841 神经管形成 IEA -
GO:0006468 蛋白氨基酸磷酸化 IEA -
GO:0007252 I-kappaB phosphorylation IEA -
GO:0007250 NF-kappab诱导激酶活性的激活 小鬼 15125833
GO:0007179 转化生长因子β受体信号通路 IEA -
GO:0007179 转化生长因子β受体信号通路 塔斯 9466656
去:0043066 凋亡的负调节 IEA -
GO:0050852 T细胞受体信号通路 nas 15125833
GO:0050870 T细胞激活的阳性调节 我知道了 15125833
GO:0032743 positive regulation of interleukin-2 production 小鬼 15125833
GO:0043123 positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB cascade IEA -
去:0046330 JNK级联的积极调节 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005829 细胞质 EXP 9162092|9744859|10066798
|12609980

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
ACTG1 行为|ACTG |DFNA20 |DFNA26 actin, gamma 1 - HPRD 14743216
卡德 - 卡氨酰磷酸合成酶2,天冬氨酸经氨基甲基酶和二氢状蛋白酶酶 - HPRD 14743216
CALM3 PHKD |PHKD3 钙调蛋白3(磷酸化酶激酶,三角洲) - HPRD 14743216
CDC37 P50CDC37 细胞分裂周期37同源物(S. cerevisiae) - HPRD 14743216
CHUK ikbka |ikk-alpha |ikk1 |ikka |nfkbika |TCF16 conserved helix-loop-helix ubiquitous kinase - HPRD,Biogrid 10187861
cltc CHC |CHC17 |CLH-17 |cltcl2 |HC |KIAA0034 网状蛋白,重链(HC) - HPRD 14743216
达斯 DKFZp781B11202 | MGC111579 aspartyl-tRNA合成酶 - HPRD 14743216
DDX5 DKFZP686J01190 |G17P1 |HLR1 |hump68 |P68 死亡(ASP-GLU-ALA-ASP)盒多肽5 - HPRD 14743216
DNAJA1 DJ-2 | DjA1 | HDJ2 | HSDJ | HSJ2 | HSPF4 | hDJ-2 DNAJ(HSP40)同源物,亚家族A,成员1 - HPRD 14743216
E2F4 E2F-4 E2F transcription factor 4, p107/p130-binding E2F4与MAP3K7启动子相互作用。 绑定 15782160
EEF1A1 CCS-3 |CCS3 |EEF-1 |EEF1A |ef-tu |EF1A |FLJ25721 |graf-1ef |HNGC:16303 |leng7 | MGC102687 | MGC131894 | MGC16224 | PTI1 | eEF1A-1 eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 1 - HPRD 14743216
ENO1 eno1l1 |MBP-1 |MPB1 |nne |pph 烯醇酶1,(alpha) - HPRD 14743216
EPRS DKFZp313B047 | EARS | GLUPRORS | PARS | PIG32 | QARS | QPRS 谷氨酰基 - 丙酰基-TRNA合成酶 - HPRD 14743216
FKBP5 FKBP51|FKBP54 | MGC111006 | P54 | PPIase | Ptg-10 FK506结合蛋白5 - HPRD 14743216
flna ABP-280 |ABPX |DKFZP434P031 |fln |fln1 |FMD |MNS |NHBP |OPD |OPD1 | OPD2 Filamin A,α(肌动蛋白结合蛋白280) - HPRD 14743216
fos AP-1 | C-FOS v-fos FBJ murine osteosarcoma viral oncogene homolog - HPRD 11397816
HGS HRS |ZFYVE8 hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substrate - HPRD,Biogrid 11397816
HIST1H4I H4/m | H4FM | H4M 组蛋白簇1,H4i - HPRD 14743216
HSP90AA1 FLJ31884 | HSP86 | HSP89A | HSP90A | HSP90N | HSPC1 | HSPCA | HSPCAL1 | HSPCAL4 | HSPN | Hsp89 | Hsp90 | LAP2 热休克蛋白90KDAα(胞质),A类成员1 - HPRD 14743216
HSP90AB1 D6S182 | FLJ26984 | HSP90-BETA | HSP90B | HSPC2 | HSPCB 热休克蛋白90KDAα(胞质),B类成员1 - HPRD 14743216
HSPA1B FLJ54328 | HSP70-1B | HSP70-2 | HSPA1A heat shock 70kDa protein 1B - HPRD 14743216
HSPA1L HSP70-1L | HSP70-HOM | HSP70T | hum70t heat shock 70kDa protein 1-like - HPRD 14743216
HSPA5 BIP | FLJ26106 | GRP78 | MIF2 热休克70KDA蛋白5(葡萄糖调节蛋白,78KDA) - HPRD 14743216
HSPA8 HSC54 | HSC70 | HSC71 | HSP71 | HSP73 | HSPA10 | LAP1 | MGC131511 | MGC29929 | NIP71 heat shock 70kDa protein 8 - HPRD 14743216
HSPA9 CSA | GRP75 | HSPA9B | MGC4500 | MOT | MOT2 | MTHSP75 | PBP74 | mot-2 热休克70KDA蛋白9(lortalin) - HPRD 14743216
IARS FLJ20736 |IARS1 |ILRS |Pro0785 异戊酸-TRNA合成酶 - HPRD 14743216
MAP2K4 jnkk |jnkk1 |MAPKK4 |MEK4 |MKK4 |prkmk4 |sek1 |SERK1 mitogen-activated protein kinase kinase 4 - HPRD 12556533
MAP2K6 MAPKK6 |mek6 |MKK6 |prkmk6 |SAPKK3 mitogen-activated protein kinase kinase 6 - HPRD,Biogrid 11460167
MAP3K14 ftdcr1b |HS |hsnik |尼克 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 14 - HPRD,Biogrid 10094049
MAP3K5 ASK1 | MAPKKK5 | MEKK5 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 5 - HPRD,Biogrid 10921914
MAP3K7 tak1 |TGF1A mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 重构的复合物 Biogrid 9556573
MAP3K7IP1 3'-tab1 |MGC57664 |TAB1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 interacting protein 1 - HPRD,Biogrid 10838074
MAP3K7IP1 3'-tab1 |MGC57664 |TAB1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 interacting protein 1 TAK1的未指定同工型与TAB1相互作用。这种相互作用是基于未指定物种与人类TAB1的TAK1之间的相互作用建模的。 绑定 9878061
MAP3K7IP1 3'-tab1 |MGC57664 |TAB1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 interacting protein 1 - HPRD 10838074|14743216
MAP3K7IP2 FLJ21885 |KIAA0733 |TAB2 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 interacting protein 2 - HPRD,Biogrid 11259596
MAP3K7IP2 FLJ21885 |KIAA0733 |TAB2 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 interacting protein 2 - HPRD 11259596|14743216
MAP3K7IP3 MGC45404 | NAP1 | TAB3 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 interacting protein 3 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 14633987|14670075
MAP4K1 HPK1 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶激酶1 - HPRD,Biogrid 10224067
MAP4K4 FLH21957 |FLJ10410 |FLJ20373 |FLJ90111 |HGK |KIAA0687 |尼克 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶激酶4 - HPRD,Biogrid 10807933
MAPK8 JNK | JNK1 | JNK1A2 | JNK21B1/2 | PRKM8 | SAPK1 有丝分裂原激活的蛋白激酶8 - HPRD 11865055
NAIP Birc1 |FLJ18088 |FLJ42520 |FLJ58811 |NLRB1 |psinaip NLR家族,凋亡抑制蛋白 - HPRD 11865055
NRIP1 FLJ77253 |RIP140 核受体相互作用蛋白1 - HPRD 9556573
nudt21 CFIM25 |CPSF5 |DKFZP686H1588 nudix(核苷二磷酸链接部分X)-Type基序21 - HPRD 14743216
PEBP1 HCNP | PBP | PEBP | RKIP 磷脂酰乙醇胺结合蛋白1 - HPRD,Biogrid 11585904
PELI3 MGC35521 佩里诺同源物3(果蝇) - HPRD 12874243
PPM1B MGC21657 | PP2C-beta-X | PP2CB | PP2CBETA | PPC2BETAX 蛋白质磷酸酶1B(以前为2C),镁依赖性β同工型 - HPRD,Biogrid 11104763
PPM1L MGC132545 |MGC132547 |pp2c-epsilon |pp2ce |PPM1状 protein phosphatase 1 (formerly 2C)-like - HPRD 12556533
RPLP0 L10E |MGC111226 |MGC88175 |P0 |prlp0 |RPP0 核糖体蛋白,大,P0 - HPRD 14743216
RPS3 FLJ26283 | FLJ27450 | MGC87870 ribosomal protein S3 - HPRD 14743216
ruvbl1 ECP54 |ino80h |NMP238 |Pontin |Pontin52 |RVB1 |tih1 |TIP49 |TIP49A ruvb样1(大肠杆菌) - HPRD 14743216
ruvbl2 CGI-46 | ECP51 | INO80J | REPTIN | RVB2 | TIH2 | TIP48 | TIP49B ruvb样2(大肠杆菌) - HPRD 14743216
Smad6 HsT17432 | MADH6 | MADH7 SMAD家庭成员6 - HPRD,Biogrid 10748100
Smad7 CRCS3 | FLJ16482 | MADH7 | MADH8 SMAD家庭成员7 - HPRD,Biogrid 12589052
STRADB ALS2CR2 |Cals-21 |Ilpip |ilpipa |MGC102916 |Papk |Pro1038 STE20-related kinase adaptor beta - HPRD,Biogrid 12048196
TNFRSF11A CD265 |feo |loh18cr1 |ODFR |Ofe |OPTB7 |Osts |PDB2 |等级|Trancer tumor necrosis factor receptor superfamily, member 11a, NFKB activator - HPRD,Biogrid 11809792
TRAF2 MGC:45012 |陷阱|陷阱3 TNF receptor-associated factor 2 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 14633987
TRAF2 MGC:45012 |陷阱|陷阱3 TNF receptor-associated factor 2 - HPRD 14743216
TRAF3IP2 ACT1 | C6orf2 | C6orf4 | C6orf5 | C6orf6 | CIKS | DKFZp586G0522 | MGC3581 TRAF3相互作用蛋白2 - HPRD 12089335
TRAF6 MGC:3310 |RNF85 TNF受体相关因子6 - HPRD,Biogrid 10094049
tuba3c tuba2 |BA408E5.3 微管蛋白,α3C - HPRD 14743216
tubb2a TUBB | TUBB2 | dJ40E16.7 微管蛋白,β2A - HPRD 14743216
tubb2b DKFZP566F223 |FLJ98847 |MGC8685 |tubb-paralog |BA506K6.1 微管蛋白,β2B - HPRD 14743216
tubb4 tubb5 |beta-5 tubulin, beta 4 - HPRD 14743216
XIAP API3 | BIRC4 | ILP1 | MIHA | XLP2 X-linked inhibitor of apoptosis - HPRD,Biogrid 12048196


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg mapk信号通路 267 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg wnt信号通路 151 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg粘附交界处 75 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG TOLL LIKE RECEPTOR SIGNALING PATHWAY 102 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG NOD LIKE RECEPTOR SIGNALING PATHWAY 62 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg钻机我喜欢受体信号通路 71 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg t细胞受体信号通路 108 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg Leishmania感染 72 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA ALK PATHWAY 37 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta FAS途径 30 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA MAPK PATHWAY 87 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta NTHI途径 24 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta NFKB途径 23 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta P38MAPK途径 40 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta IL1R途径 33 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta TGFB途径 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA PAR1 PATHWAY 37 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta TNFR1途径 29 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta收费途径 37 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Wnt途径 26 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST TUMOR NECROSIS FACTOR PATHWAY 29 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST P38 MAPK PATHWAY 37 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST JNK MAPK PATHWAY 40 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID BCR 5 Pathway 65 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P38 MKK3 6PATHWAY 26 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid wnt非规范途径 32 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PS1途径 46 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL1途径 34 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TNF途径 46 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID BMP PATHWAY 42 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TCR JNK途径 14 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CMYB途径 84 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID EPHRINB REV PATHWAY 30 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TGFBR途径 55 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Trif介导的TLR3信号传导 74 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME DOWNSTREAM SIGNALING EVENTS OF B CELL RECEPTOR BCR 97 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B细胞中NF Kappab的反应组激活 64 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B细胞受体BCR的反应组信号传导 126 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TCR SIGNALING 54 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome下游TCR信号传导 37 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Tak1通过磷酸化和激活IKKS复合物激活NFKB 23 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TLR级联反应组MAP激酶激活 50 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome JNK C Jun激酶磷酸化和激活人Tak1介导的激活 16 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome激活的TA​​K1介导P38 MAPK激活 18 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ILS的Reactome信号传导 107 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome IL1信号传导 39 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Traf6在TLR7 8或9激活上介导的NFKB和MAP激酶的诱导 77 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NFKB和MAP激酶激活由TLR4信号传导介导 72 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Traf6介导的TAK1复合物的诱导 14 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome myd88 mal级联反应于质膜发起 83 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome先天免疫系统 279 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome激活的TLR4信号传导 93 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome收费受体级联 118 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ADAPTIVE IMMUNE SYSTEM 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NOD1 2 SIGNALING PATHWAY 30 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组核苷酸结合结构域富含受体NLR信号通路富含亮氨酸重复途径 46 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GARY CD5 TARGETS DN 431 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MULLIGHAN NPM1 MUTATED SIGNATURE 1 UP 276 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 341 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dittmer PTHLH靶向DN 73 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌群集1 121 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射5的响应5 147 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应 134 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM MYCN AMPLIFICATION TARGETS DN 103 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
liang造血细胞数大与微小的DN 45 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SPIELMAN LYMPHOBLAST EUROPEAN VS ASIAN DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Haslinger B Cll具有6q21删除 20 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee老化新皮层DN 80 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯对trabectedin dn的反应 271 175 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 393 244 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍林引用1个目标2向上 17 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Riggins他莫昔芬抵抗DN 220 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 17 181 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
萨森对促性腺营养蛋白的反应 91 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasson对Forskolin的反应 90 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMAD1和SMAD5 DN抑制Pangas肿瘤 157 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PURBEY TARGETS OF CTBP1 NOT SATB1 DN 448 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 Match method
mir-10 455 462 1A,M8 HSA-MIR-10A uacccuguagauccgaauuugug
HSA-MIR-10B uacccuguagaaccgaauuugu
mir-103/107 128 134 1A HSA-MIR-103 agcagcauuguacggcuauga
HSA-MIR-107 agcagcauuguacgggcuauca
miR-141/200a 84 90 1A HSA-MIR-141 UAACACUGUCUGGUAAAGAUGG
HSA-MIR-200A UAACACUGUCUGGUAACGAUGU
mir-143 399 406 1A,M8 HSA-MIR-143 ugagaugaagcacuguagcuca
mir-339 454 460 m8 HSA-MIR-339 ucccuccuccaggagcuca