基因页:MAP3K7
概括?
基因ID | 6885 |
Symbol | MAP3K7 |
同义词 | mekk7 | tak1 | tgf1a |
描述 | mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 |
参考 | MIM:602614|HGNC:HGNC:6859|ENSEMBL:ENSG00000135341|HPRD:04011|Vega:Otthumg0000000015217 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6q15 |
Pascal P值 | 0.066 |
Sherlock P值 | 0.221 |
胎儿β | -0.352 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | Genome-wide Association Study | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | This dataset includes 2,104 probes/CpGs associated with SZ patients (n=108) compared to 136 controls at Bonferroni-adjusted P < 0.05. | 1 |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:0.0024 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
Differentially methylated gene
探测 | 染色体 | 位置 | Nearest gene | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | Study |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg01087382 | 6 | 91297190 | MAP3K7 | 9E-8 | -0.019 | 2.06E-5 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![Not available](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MAP3K7_DE_GTEx.png)
基因expression during devlopment (BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
Top co-expressed genes in brain regions
Top 10 positively co-expressed genes | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | Spearman's Correlation |
ZBTB10 | 0.89 | 0.93 |
SPIRE1 | 0.89 | 0.94 |
IL17RD | 0.89 | 0.88 |
Med13 | 0.88 | 0.93 |
RCOR1 | 0.88 | 0.91 |
ZNF192 | 0.87 | 0.88 |
CCNG2 | 0.87 | 0.90 |
BMPR1A | 0.87 | 0.90 |
RBM12 | 0.87 | 0.92 |
RBM15 | 0.87 | 0.91 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | Spearman's Correlation |
AIFM3 | -0.65 | -0.74 |
FXYD1 | -0.63 | -0.84 |
S100B | -0.63 | -0.80 |
AF347015.31 | -0.63 | -0.82 |
HLA-F | -0.63 | -0.70 |
C5orf53 | -0.63 | -0.69 |
MT-CO2 | -0.62 | -0.83 |
TSC22D4 | -0.62 | -0.74 |
AF347015.27 | -0.62 | -0.79 |
AF347015.33 | -0.62 | -0.79 |
第三节。基因本体论注释
Molecular function | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0000287 | magnesium ion binding | IEA | - | |
去:0004708 | MAP激酶激酶活性 | IEA | - | |
去:0005515 | protein binding | IEA | - | |
去:0005515 | protein binding | IPI | 15075345 | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
去:0004674 | 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 | IEA | - | |
去:0004713 | 蛋白酪氨酸激酶活性 | IEA | - | |
去:0004709 | MAP激酶激酶激酶活性 | 塔斯 | 9466656 | |
GO:0016740 | transferase activity | IEA | - | |
去:0016301 | kinase activity | IEA | - | |
Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0000165 | MAPKKK级联 | IEA | - | |
去:0001525 | 血管生成 | IEA | - | |
GO:0002726 | T细胞因子的阳性调节 | 小鬼 | 15125833 | |
去:0001841 | 神经管形成 | IEA | - | |
GO:0006468 | 蛋白氨基酸磷酸化 | IEA | - | |
GO:0007252 | I-kappaB phosphorylation | IEA | - | |
GO:0007250 | NF-kappab诱导激酶活性的激活 | 小鬼 | 15125833 | |
GO:0007179 | 转化生长因子β受体信号通路 | IEA | - | |
GO:0007179 | 转化生长因子β受体信号通路 | 塔斯 | 9466656 | |
去:0043066 | 凋亡的负调节 | IEA | - | |
GO:0050852 | T细胞受体信号通路 | nas | 15125833 | |
GO:0050870 | T细胞激活的阳性调节 | 我知道了 | 15125833 | |
GO:0032743 | positive regulation of interleukin-2 production | 小鬼 | 15125833 | |
GO:0043123 | positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB cascade | IEA | - | |
去:0046330 | JNK级联的积极调节 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005829 | 细胞质 | EXP | 9162092|9744859|10066798 |12609980 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
Interactors | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ACTG1 | 行为|ACTG |DFNA20 |DFNA26 | actin, gamma 1 | - | HPRD | 14743216 |
卡德 | - | 卡氨酰磷酸合成酶2,天冬氨酸经氨基甲基酶和二氢状蛋白酶酶 | - | HPRD | 14743216 |
CALM3 | PHKD |PHKD3 | 钙调蛋白3(磷酸化酶激酶,三角洲) | - | HPRD | 14743216 |
CDC37 | P50CDC37 | 细胞分裂周期37同源物(S. cerevisiae) | - | HPRD | 14743216 |
CHUK | ikbka |ikk-alpha |ikk1 |ikka |nfkbika |TCF16 | conserved helix-loop-helix ubiquitous kinase | - | HPRD,Biogrid | 10187861 |
cltc | CHC |CHC17 |CLH-17 |cltcl2 |HC |KIAA0034 | 网状蛋白,重链(HC) | - | HPRD | 14743216 |
达斯 | DKFZp781B11202 | MGC111579 | aspartyl-tRNA合成酶 | - | HPRD | 14743216 |
DDX5 | DKFZP686J01190 |G17P1 |HLR1 |hump68 |P68 | 死亡(ASP-GLU-ALA-ASP)盒多肽5 | - | HPRD | 14743216 |
DNAJA1 | DJ-2 | DjA1 | HDJ2 | HSDJ | HSJ2 | HSPF4 | hDJ-2 | DNAJ(HSP40)同源物,亚家族A,成员1 | - | HPRD | 14743216 |
E2F4 | E2F-4 | E2F transcription factor 4, p107/p130-binding | E2F4与MAP3K7启动子相互作用。 | 绑定 | 15782160 |
EEF1A1 | CCS-3 |CCS3 |EEF-1 |EEF1A |ef-tu |EF1A |FLJ25721 |graf-1ef |HNGC:16303 |leng7 | MGC102687 | MGC131894 | MGC16224 | PTI1 | eEF1A-1 | eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 1 | - | HPRD | 14743216 |
ENO1 | eno1l1 |MBP-1 |MPB1 |nne |pph | 烯醇酶1,(alpha) | - | HPRD | 14743216 |
EPRS | DKFZp313B047 | EARS | GLUPRORS | PARS | PIG32 | QARS | QPRS | 谷氨酰基 - 丙酰基-TRNA合成酶 | - | HPRD | 14743216 |
FKBP5 | FKBP51|FKBP54 | MGC111006 | P54 | PPIase | Ptg-10 | FK506结合蛋白5 | - | HPRD | 14743216 |
flna | ABP-280 |ABPX |DKFZP434P031 |fln |fln1 |FMD |MNS |NHBP |OPD |OPD1 | OPD2 | Filamin A,α(肌动蛋白结合蛋白280) | - | HPRD | 14743216 |
fos | AP-1 | C-FOS | v-fos FBJ murine osteosarcoma viral oncogene homolog | - | HPRD | 11397816 |
HGS | HRS |ZFYVE8 | hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substrate | - | HPRD,Biogrid | 11397816 |
HIST1H4I | H4/m | H4FM | H4M | 组蛋白簇1,H4i | - | HPRD | 14743216 |
HSP90AA1 | FLJ31884 | HSP86 | HSP89A | HSP90A | HSP90N | HSPC1 | HSPCA | HSPCAL1 | HSPCAL4 | HSPN | Hsp89 | Hsp90 | LAP2 | 热休克蛋白90KDAα(胞质),A类成员1 | - | HPRD | 14743216 |
HSP90AB1 | D6S182 | FLJ26984 | HSP90-BETA | HSP90B | HSPC2 | HSPCB | 热休克蛋白90KDAα(胞质),B类成员1 | - | HPRD | 14743216 |
HSPA1B | FLJ54328 | HSP70-1B | HSP70-2 | HSPA1A | heat shock 70kDa protein 1B | - | HPRD | 14743216 |
HSPA1L | HSP70-1L | HSP70-HOM | HSP70T | hum70t | heat shock 70kDa protein 1-like | - | HPRD | 14743216 |
HSPA5 | BIP | FLJ26106 | GRP78 | MIF2 | 热休克70KDA蛋白5(葡萄糖调节蛋白,78KDA) | - | HPRD | 14743216 |
HSPA8 | HSC54 | HSC70 | HSC71 | HSP71 | HSP73 | HSPA10 | LAP1 | MGC131511 | MGC29929 | NIP71 | heat shock 70kDa protein 8 | - | HPRD | 14743216 |
HSPA9 | CSA | GRP75 | HSPA9B | MGC4500 | MOT | MOT2 | MTHSP75 | PBP74 | mot-2 | 热休克70KDA蛋白9(lortalin) | - | HPRD | 14743216 |
IARS | FLJ20736 |IARS1 |ILRS |Pro0785 | 异戊酸-TRNA合成酶 | - | HPRD | 14743216 |
MAP2K4 | jnkk |jnkk1 |MAPKK4 |MEK4 |MKK4 |prkmk4 |sek1 |SERK1 | mitogen-activated protein kinase kinase 4 | - | HPRD | 12556533 |
MAP2K6 | MAPKK6 |mek6 |MKK6 |prkmk6 |SAPKK3 | mitogen-activated protein kinase kinase 6 | - | HPRD,Biogrid | 11460167 |
MAP3K14 | ftdcr1b |HS |hsnik |尼克 | mitogen-activated protein kinase kinase kinase 14 | - | HPRD,Biogrid | 10094049 |
MAP3K5 | ASK1 | MAPKKK5 | MEKK5 | mitogen-activated protein kinase kinase kinase 5 | - | HPRD,Biogrid | 10921914 |
MAP3K7 | tak1 |TGF1A | mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 | 重构的复合物 | Biogrid | 9556573 |
MAP3K7IP1 | 3'-tab1 |MGC57664 |TAB1 | mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 interacting protein 1 | - | HPRD,Biogrid | 10838074 |
MAP3K7IP1 | 3'-tab1 |MGC57664 |TAB1 | mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 interacting protein 1 | TAK1的未指定同工型与TAB1相互作用。这种相互作用是基于未指定物种与人类TAB1的TAK1之间的相互作用建模的。 | 绑定 | 9878061 |
MAP3K7IP1 | 3'-tab1 |MGC57664 |TAB1 | mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 interacting protein 1 | - | HPRD | 10838074|14743216 |
MAP3K7IP2 | FLJ21885 |KIAA0733 |TAB2 | mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 interacting protein 2 | - | HPRD,Biogrid | 11259596 |
MAP3K7IP2 | FLJ21885 |KIAA0733 |TAB2 | mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 interacting protein 2 | - | HPRD | 11259596|14743216 |
MAP3K7IP3 | MGC45404 | NAP1 | TAB3 | mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 interacting protein 3 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 14633987|14670075 |
MAP4K1 | HPK1 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶激酶1 | - | HPRD,Biogrid | 10224067 |
MAP4K4 | FLH21957 |FLJ10410 |FLJ20373 |FLJ90111 |HGK |KIAA0687 |尼克 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶激酶4 | - | HPRD,Biogrid | 10807933 |
MAPK8 | JNK | JNK1 | JNK1A2 | JNK21B1/2 | PRKM8 | SAPK1 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶8 | - | HPRD | 11865055 |
NAIP | Birc1 |FLJ18088 |FLJ42520 |FLJ58811 |NLRB1 |psinaip | NLR家族,凋亡抑制蛋白 | - | HPRD | 11865055 |
NRIP1 | FLJ77253 |RIP140 | 核受体相互作用蛋白1 | - | HPRD | 9556573 |
nudt21 | CFIM25 |CPSF5 |DKFZP686H1588 | nudix(核苷二磷酸链接部分X)-Type基序21 | - | HPRD | 14743216 |
PEBP1 | HCNP | PBP | PEBP | RKIP | 磷脂酰乙醇胺结合蛋白1 | - | HPRD,Biogrid | 11585904 |
PELI3 | MGC35521 | 佩里诺同源物3(果蝇) | - | HPRD | 12874243 |
PPM1B | MGC21657 | PP2C-beta-X | PP2CB | PP2CBETA | PPC2BETAX | 蛋白质磷酸酶1B(以前为2C),镁依赖性β同工型 | - | HPRD,Biogrid | 11104763 |
PPM1L | MGC132545 |MGC132547 |pp2c-epsilon |pp2ce |PPM1状 | protein phosphatase 1 (formerly 2C)-like | - | HPRD | 12556533 |
RPLP0 | L10E |MGC111226 |MGC88175 |P0 |prlp0 |RPP0 | 核糖体蛋白,大,P0 | - | HPRD | 14743216 |
RPS3 | FLJ26283 | FLJ27450 | MGC87870 | ribosomal protein S3 | - | HPRD | 14743216 |
ruvbl1 | ECP54 |ino80h |NMP238 |Pontin |Pontin52 |RVB1 |tih1 |TIP49 |TIP49A | ruvb样1(大肠杆菌) | - | HPRD | 14743216 |
ruvbl2 | CGI-46 | ECP51 | INO80J | REPTIN | RVB2 | TIH2 | TIP48 | TIP49B | ruvb样2(大肠杆菌) | - | HPRD | 14743216 |
Smad6 | HsT17432 | MADH6 | MADH7 | SMAD家庭成员6 | - | HPRD,Biogrid | 10748100 |
Smad7 | CRCS3 | FLJ16482 | MADH7 | MADH8 | SMAD家庭成员7 | - | HPRD,Biogrid | 12589052 |
STRADB | ALS2CR2 |Cals-21 |Ilpip |ilpipa |MGC102916 |Papk |Pro1038 | STE20-related kinase adaptor beta | - | HPRD,Biogrid | 12048196 |
TNFRSF11A | CD265 |feo |loh18cr1 |ODFR |Ofe |OPTB7 |Osts |PDB2 |等级|Trancer | tumor necrosis factor receptor superfamily, member 11a, NFKB activator | - | HPRD,Biogrid | 11809792 |
TRAF2 | MGC:45012 |陷阱|陷阱3 | TNF receptor-associated factor 2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 14633987 |
TRAF2 | MGC:45012 |陷阱|陷阱3 | TNF receptor-associated factor 2 | - | HPRD | 14743216 |
TRAF3IP2 | ACT1 | C6orf2 | C6orf4 | C6orf5 | C6orf6 | CIKS | DKFZp586G0522 | MGC3581 | TRAF3相互作用蛋白2 | - | HPRD | 12089335 |
TRAF6 | MGC:3310 |RNF85 | TNF受体相关因子6 | - | HPRD,Biogrid | 10094049 |
tuba3c | tuba2 |BA408E5.3 | 微管蛋白,α3C | - | HPRD | 14743216 |
tubb2a | TUBB | TUBB2 | dJ40E16.7 | 微管蛋白,β2A | - | HPRD | 14743216 |
tubb2b | DKFZP566F223 |FLJ98847 |MGC8685 |tubb-paralog |BA506K6.1 | 微管蛋白,β2B | - | HPRD | 14743216 |
tubb4 | tubb5 |beta-5 | tubulin, beta 4 | - | HPRD | 14743216 |
XIAP | API3 | BIRC4 | ILP1 | MIHA | XLP2 | X-linked inhibitor of apoptosis | - | HPRD,Biogrid | 12048196 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg mapk信号通路 | 267 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg wnt信号通路 | 151 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg粘附交界处 | 75 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG TOLL LIKE RECEPTOR SIGNALING PATHWAY | 102 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG NOD LIKE RECEPTOR SIGNALING PATHWAY | 62 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg钻机我喜欢受体信号通路 | 71 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg t细胞受体信号通路 | 108 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg Leishmania感染 | 72 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BIOCARTA ALK PATHWAY | 37 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta FAS途径 | 30 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BIOCARTA MAPK PATHWAY | 87 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta NTHI途径 | 24 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta NFKB途径 | 23 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta P38MAPK途径 | 40 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta IL1R途径 | 33 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta TGFB途径 | 19 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BIOCARTA PAR1 PATHWAY | 37 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta TNFR1途径 | 29 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta收费途径 | 37 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Wnt途径 | 26 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ST TUMOR NECROSIS FACTOR PATHWAY | 29 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ST P38 MAPK PATHWAY | 37 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ST JNK MAPK PATHWAY | 40 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID BCR 5 Pathway | 65 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID P38 MKK3 6PATHWAY | 26 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pid wnt非规范途径 | 32 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID PS1途径 | 46 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID IL1途径 | 34 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID TNF途径 | 46 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID BMP PATHWAY | 42 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID TCR JNK途径 | 14 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CMYB途径 | 84 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID EPHRINB REV PATHWAY | 30 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID TGFBR途径 | 55 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Trif介导的TLR3信号传导 | 74 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME DOWNSTREAM SIGNALING EVENTS OF B CELL RECEPTOR BCR | 97 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
B细胞中NF Kappab的反应组激活 | 64 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
B细胞受体BCR的反应组信号传导 | 126 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME TCR SIGNALING | 54 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome下游TCR信号传导 | 37 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Tak1通过磷酸化和激活IKKS复合物激活NFKB | 23 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TLR级联反应组MAP激酶激活 | 50 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome JNK C Jun激酶磷酸化和激活人Tak1介导的激活 | 16 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome激活的TAK1介导P38 MAPK激活 | 18 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ILS的Reactome信号传导 | 107 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome IL1信号传导 | 39 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Traf6在TLR7 8或9激活上介导的NFKB和MAP激酶的诱导 | 77 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome NFKB和MAP激酶激活由TLR4信号传导介导 | 72 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Traf6介导的TAK1复合物的诱导 | 14 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome myd88 mal级联反应于质膜发起 | 83 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome先天免疫系统 | 279 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome激活的TLR4信号传导 | 93 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome收费受体级联 | 118 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME ADAPTIVE IMMUNE SYSTEM | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME NOD1 2 SIGNALING PATHWAY | 30 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 | 270 | 204 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组核苷酸结合结构域富含受体NLR信号通路富含亮氨酸重复途径 | 46 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GARY CD5 TARGETS DN | 431 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MULLIGHAN NPM1 MUTATED SIGNATURE 1 UP | 276 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1签名3 | 341 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dittmer PTHLH靶向DN | 73 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌群集1 | 121 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rashi对电离辐射5的响应5 | 147 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应 | 134 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KIM MYCN AMPLIFICATION TARGETS DN | 103 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
liang造血细胞数大与微小的DN | 45 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SPIELMAN LYMPHOBLAST EUROPEAN VS ASIAN DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Haslinger B Cll具有6q21删除 | 20 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee老化新皮层DN | 80 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯对trabectedin dn的反应 | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 | 393 | 244 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍林引用1个目标2向上 | 17 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Riggins他莫昔芬抵抗DN | 220 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 17 | 181 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
萨森对促性腺营养蛋白的反应 | 91 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sasson对Forskolin的反应 | 90 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMAD1和SMAD5 DN抑制Pangas肿瘤 | 157 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PURBEY TARGETS OF CTBP1 NOT SATB1 DN | 448 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Section VI. microRNA annotation
miRNA family | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | Match method | |||
mir-10 | 455 | 462 | 1A,M8 | HSA-MIR-10A | uacccuguagauccgaauuugug |
HSA-MIR-10B | uacccuguagaaccgaauuugu | ||||
mir-103/107 | 128 | 134 | 1A | HSA-MIR-103脑 | agcagcauuguacggcuauga |
HSA-MIR-107脑 | agcagcauuguacgggcuauca | ||||
miR-141/200a | 84 | 90 | 1A | HSA-MIR-141 | UAACACUGUCUGGUAAAGAUGG |
HSA-MIR-200A | UAACACUGUCUGGUAACGAUGU | ||||
mir-143 | 399 | 406 | 1A,M8 | HSA-MIR-143脑 | ugagaugaagcacuguagcuca |
mir-339 | 454 | 460 | m8 | HSA-MIR-339 | ucccuccuccaggagcuca |