总结吗?
GeneID 6908年
象征 真沸点
同义词 GTF2D | GTF2D1 | HDL4 | SCA17 | TFIID
描述 着重结合蛋白
参考 MIM: 600075|HGNC: HGNC: 11588|运用:ENSG00000112592|HPRD: 02511|织女:OTTHUMG00000016084
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 6问
帕斯卡假定值 0.215
夏洛克假定值 0.118
胎儿β 1.038
DMG 1(#研究)
eGene 迈尔斯的顺式和反式

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Jaffe_2016 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 1
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
协会 综合优势比方法(太阳et al . 2008),协会研究 1 链接到SZGene
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,精神分裂症患者,神经 点击显示详细信息

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg11786005 6 170863399 真沸点 2.24 e-9 -0.007 1.73 e-6 DMG: Jaffe_2016

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs9570060 chr13 59754134 真沸点 6908年 0.15 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
GJA4 0.70 0.69
0.68 0.69
FCGRT 0.66 0.68
BGN 0.65 0.69
TIMP1 0.64 0.67
MFSD2 0.61 0.64
TM4SF1 0.61 0.60
S100A11 0.61 0.62
TGFB1 0.59 0.62
ORAI3 0.59 0.62
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
ZMAT2 -0.40 -0.46
CEP63 -0.39 -0.39
C1orf96 -0.38 -0.35
CIR1 -0.36 -0.39
LMO7 -0.36 -0.36
ZRSR2 -0.36 -0.37
GPR22 -0.35 -0.38
KHDRBS3 -0.35 -0.34
PITPNB -0.35 -0.38
RNPC3 -0.35 -0.38

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0003677 DNA结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0003702 RNA聚合酶II转录因子的活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0005488 绑定 国际能源机构 - - - - - -
去:0005515 蛋白结合 新闻学会 1465435|7680771|8006019
|9045704|9748258
|10391676|12040021
|12217962
去:0016251 一般的RNA聚合酶II转录因子的活动 助教 2363050
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0006355 依赖dna的转录调节 国际能源机构 - - - - - -
去:0006367 从RNA聚合酶II启动子转录起始 经验值 8946909
去:0006367 从RNA聚合酶II启动子转录起始 国际能源机构 - - - - - -
去:0006367 从RNA聚合酶II启动子转录起始 助教 2363050
去:0006368 RNA RNA聚合酶II发起人的伸长 经验值 9405375
去:0006350 转录 国际能源机构 - - - - - -
去:0008219 细胞死亡 国际能源机构 - - - - - -
去:0044419 生物种间相互作用 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005634 国际能源机构 - - - - - -
去:0005654 核浆 经验值 1939271|2449431|8946909
去:0005669 转录因子TFIID复杂 艾达 14580349
去:0005669 转录因子TFIID复杂 国际能源机构 - - - - - -

第四部分,注释蛋白质间交互作用

扶少团团员 别名B 官方全名B 实验 PubMed ID
ABT1 hABT1 转录激活的基底1 - - - - - - HPRD 10648625
AHR - - - - - - 芳基碳氢化合物受体 与气道高反应性真沸点。 绑定 15641800
AHR - - - - - - 芳基碳氢化合物受体 - - - - - - HPRD, BioGRID 8794892
基于“增大化现实”技术 AIS | DHTR | HUMARA | KD | NR3C4 | SBMA | SMAX1 |解冻 雄性激素受体 重新组成复杂 BioGRID 9238003
ATF4 CREB-2 | CREB2 | TAXREB67 | TXREB 激活转录因子4 (tax-responsive增强器元素B67) 重新组成复杂 BioGRID 9295363
伯灵顿 BCL2L4 BCL2-associated X蛋白 真沸点与伯灵顿启动子进行交互。 绑定 15710329
BCL3 BCL4 | D19S37 b细胞慢性淋巴细胞白血病/淋巴瘤3 - - - - - - HPRD, BioGRID 9812988
BRF1 BRF | FLJ42674 | FLJ43034 | GTF3B | MGC105048 | TAF3B2 | TAF3C | TAFIII90 | TF3B90 | TFIIIB90 | hBRF BRF1同族体,单元的RNA聚合酶III转录起始因子希望(酵母) - - - - - - HPRD, BioGRID 7624363|10921893
BRF2 BRFU | FLJ11052 | TFIIIB50 BRF2,亚基的RNA聚合酶III转录起始因子,BRF1-like - - - - - - HPRD, BioGRID 11564744
BTAF1 KIAA0940 | MGC138406 | MOT1 | TAF (II) 170 | TAF172 | TAFII170 BTAF1 RNA聚合酶II, B-TFIID转录factor-associated 170 kda (Mot1同族体,酵母) - - - - - - HPRD, BioGRID 9488487
CBX5 HP1 | HP1A chromobox同族体5 (HP1α相同器官,果蝇) 亲和力Capture-Western BioGRID 11959914
CD3EAP ASE-1 |演员| MGC118851 | PAF49 CD3e分子,ε相关的蛋白质 亲和力Capture-Western BioGRID 15226435
CITED2 MRG1 | P35SRJ 海关与边境保护局/ p300-interacting反式激活因子,Glu / Asp-rich carboxy-terminal域,2 重新组成复杂 BioGRID 10593900
CREG1 CREG E1A-stimulated基因的细胞抑制因子1 - - - - - - HPRD, BioGRID 9710587
CREM 冷藏工人| MGC111110 | MGC17881 | MGC41893 | hCREM-2 营响应要素调制器 - - - - - - HPRD, BioGRID 10409662
CTBP1 酒吧| MGC104684 c端结合蛋白1 重新组成复杂 BioGRID 11959865
DHX9 DDX9 | LKP | NDHII | RHA DEAH (Asp-Glu-Ala-His)盒子多肽9 - - - - - - HPRD, BioGRID 11149922
根据DR1 NC2 | NC2-BETA 装置的转录TBP-binding(-代数余子式2) - - - - - - HPRD 11461703
DRAP1 NC2-alpha DR1-associated蛋白1(α-代数余子式2) - - - - - - HPRD, BioGRID 11461703
EDF1 EDF-1 | MBF1 | MGC9058 内皮differentiation-related因子1 - - - - - - HPRD, BioGRID 10816571
EP300 KAT3B | p300 E1A结合蛋白p300 p300与真沸点。 绑定 8621548
ESR1 ER DKFZp686N23123 | | ESR |将有关| |时代NR3A1 雌激素受体1 - - - - - - HPRD, BioGRID 11595744
”丛书 AP-1 | C-FOS v-fos FBJ小鼠骨肉瘤病毒致癌基因相同器官 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
BioGRID 8065335
”丛书 AP-1 | C-FOS v-fos FBJ小鼠骨肉瘤病毒致癌基因相同器官 - - - - - - HPRD 7685215
FOXF2 FKHL6 | FREAC2 F2 forkhead框 - - - - - - HPRD, BioGRID 9722567
GLI2 HPE9 | THP1 | THP2 GLI-Kruppel家人GLI2 真沸点与GLI-2交互。之间的交互是仿照了交互从一个未指明的物种和人类GLI-2真沸点。 绑定 11160734
GTF2A1 MGC129969 | MGC129970 | TF2A1 | TFIIA 通用转录因子活动花絮,1,19/37kDa 生化活动
重新组成复杂
BioGRID 7724559|7958900
|9603936|11278496
|11509574
GTF2A1L 阿尔夫| MGC26254 通用转录因子活动花絮,1 重新组成复杂 BioGRID 12107178
GTF2A2 HsT18745 | TF2A2 | TFIIA 通用转录因子活动花絮2 12 kda - - - - - - HPRD, BioGRID 7724559|7958900
|9603936
GTF2B TF2B | TFIIB IIB通用转录因子 - - - - - - HPRD, BioGRID 14963322
GTF2E1 菲| TF2E1 | TFIIE-A 通用转录因子国际教育协会多肽1α56 kda - - - - - - HPRD 11113176
GTF2E1 菲| TF2E1 | TFIIE-A 通用转录因子国际教育协会多肽1α56 kda Co-purification
重新组成复杂
BioGRID 7926747|9159119
GTF2E2 菲| TF2E2 | TFIIE-B 通用转录因子国际教育协会,多肽2,β34 kda - - - - - - HPRD, BioGRID 9677423|11113176
GTF2F1 BTF4 | RAP74 | TF2F1 | TFIIF 通用转录因子IIF多肽74 kda 生化活动
Co-purification
重新组成复杂
BioGRID 7590250|9159119
|9482861
GTF2F2 BTF4 | RAP30 | TF2F2 | TFIIF 通用转录因子IIF多肽2、30 kda - - - - - - HPRD, BioGRID 8577725
GTF2H4 TFB2 | TFIIH 通用转录因子颅内高压症,多肽4,52 kda Co-purification
重新组成复杂
BioGRID 9159119
GTF3C2 KIAA0011 | TFIIIC-BETA | TFIIIC110 通用转录因子IIIC多肽2β110 kda 重新组成复杂 BioGRID 10373544
GTF3C3 TFIIIC102 | TFIIICgamma | tfiiic2 - 102 通用转录因子IIIC多肽102 kda - - - - - - HPRD, BioGRID 10373544
GTF3C4 FLJ21002 | KAT12 | MGC138450 | TFIII90 | TFIIIC90 | TFIIICdelta | tfiiic2 - 90 通用转录因子IIIC多肽90 kda 重新组成复杂 BioGRID 10373544
GTF3C5 FLJ20857 | TFIIIC63 | TFIIICepsilon | tfiiic2 - 63 通用转录因子IIIC多肽63 kda 重新组成复杂 BioGRID 10373544
HMGB1 DKFZp686A04236 | HMG1 | HMG3 | SBP-1 高机动组框1 - - - - - - HPRD, BioGRID 9880542
HSF1 HSTF1 热休克转录因子1 - - - - - - HPRD, BioGRID 11005381
计画 高清| IT15 杭丁顿蛋白 计画与真沸点。 绑定 15225551
计画 高清| IT15 杭丁顿蛋白 - - - - - - HPRD 10410676
IKZF1 Hs.54452 | IK1 | IKAROS | LYF1 | PRO0758 | ZNFN1A1 | hIk-1 伊卡洛斯家族锌指1(伊卡洛斯飞船) - - - - - - HPRD, BioGRID 11959865
IRF1 IRF-1 | 3月 干扰素调节因子1 真沸点与IRF-1启动子。 绑定 15893730
JARID1A KDM5A | RBBP2 | RBP2 jumonji,丰富互动领域1 - - - - - - HPRD, BioGRID 7935440
小君 AP-1 | AP1 | c-Jun 小君致癌基因 - - - - - - HPRD, BioGRID 7848298
JUND AP-1 小君D原癌基因 - - - - - - HPRD 7848298
KLF5 BTEB2 | CKLF | IKLF Kruppel-like因子5(肠) 重新组成复杂 BioGRID 9089417
MCM2 BM28 | CCNL1 | CDCL1 | D3S3194 | KIAA0030 | MGC10606 | MITOTIN | cdc19 2 minichromosome维护复杂的组件 - - - - - - HPRD, BioGRID 12392551
MDM2 HDMX | MGC71221 | hdm2 Mdm2 p53结合蛋白同系物(鼠标) 重新组成复杂 BioGRID 9271120|9388200
MSX1 HOX7 | HYD1 msh同源框1 亲和力Capture-Western
在活的有机体内
表型抑制
重新组成复杂
BioGRID 8700832|9111364
|10215616
MSX1 HOX7 | HYD1 msh同源框1 - - - - - - HPRD 8700832|10215616
MYC bHLHe39 |原癌基因 v-myc myelocytomatosis病毒致癌基因相同器官(禽流感) 重新组成复杂 BioGRID 8755740
MYC bHLHe39 |原癌基因 v-myc myelocytomatosis病毒致癌基因相同器官(禽流感) 真沸点与原癌基因。 绑定 15723054
项目实施 HSD48 | MGC117224 | NACA1 新生polypeptide-associated复杂的α亚基 - - - - - - HPRD, BioGRID 8835540
NCOA1 F-SRC-1 | KAT13A | MGC129719 | MGC129720 | NCoA-1 | RIP160 | SRC-1 | SRC1 | bHLHe42 核受体共激活剂1 - - - - - - HPRD, BioGRID 8754792
NCOA3 ACTR | AIB-1 | AIB1 | CAGH16 | CTG26 | KAT13B | MGC141848 | RAC3 | SRC3 | TNRC14 | TNRC16 | TRAM-1 | pCIP 核受体共激活剂3 - - - - - - HPRD 9267036
NCOA6 AIB3 | ANTP | ASC2 | HOX1.1 | HOXA7 | KIAA0181 | NRC | PRIP | RAP250 | TRBP 核受体共激活剂6 重新组成复杂 BioGRID 10567404
NFYB CBF-A | CBF-B | HAP3 | NF-YB 核转录因子Y,β - - - - - - HPRD, BioGRID 9153318
NFYC CBF-C | CBFC | DKFZp667G242 | FLJ45775 | H1TF2A | HAP5 | HSM | NF-YC 核转录因子Y,γ 重新组成复杂 BioGRID 9153318
NR3C1 GCCR | GCR | GR | GRL 核受体亚科3 C组,成员1(糖皮质激素受体) - - - - - - HPRD, BioGRID 9649342
PAX3 鼎晖| HUP2 | MGC120381 | MGC120382 | MGC120383 | MGC120384 | MGC134778 | WS1相同 成对框3 重新组成复杂 BioGRID 10359315
PAX6 一个| AN2 | D11S812E | MGC17209 | MGDA | WAGR 双箱6 - - - - - - HPRD, BioGRID 10359315
POLR2A MGC75453 | POLR2 | POLRA | RPB1 | RPBh1 | RPO2 | RPOL2 | RpIILS | hRPB220 | hsRPB1 DNA聚合酶(RNA) II(导演)多肽,220 kda Co-purification
重新组成复杂
BioGRID 9159119
POLR3C RPC3 | RPC62 DNA聚合酶(RNA) III(导演)多肽C (62 kd) 亲和力Capture-Western BioGRID 9171375
POLR3F MGC13517 | RPC39 | RPC6 DNA聚合酶(RNA) III(导演)多肽F, 39 kDa - - - - - - HPRD, BioGRID 9171375
POU2F1 OCT1 | OTF1 POU类2同源框1 - - - - - - HPRD, BioGRID 8202368
POU2F2 OCT2 | OTF2 | Oct-2 POU类2同源框2 - - - - - - HPRD, BioGRID 8202368
POU3F2 BRN2 | OCT7 | OTF7 | POUF3 POU类3同源框2 Brn-2与真沸点。 绑定 11029584
PSMC2 MGC3004 | MSS1 | Nbla10058 | S7 蛋白酶体(prosome macropain) 26 s亚基,atp酶2 - - - - - - HPRD, BioGRID 11118327
RB1 OSRC | RB | p105-Rb |复审委员会| pp110 成视网膜细胞瘤1 Rb与真沸点 绑定 11094070
REL : v-rel reticuloendotheliosis病毒致癌基因相同器官(禽流感) - - - - - - HPRD, BioGRID 8413269
RELA MGC131774 | NFKB3 | p65 v-rel reticuloendotheliosis病毒致癌基因相同器官(禽流感) - - - - - - HPRD, BioGRID 7706261|9584164
RIBIN - - - - - - 核糖体rna启动子结合蛋白 真沸点与rDNA交互。 绑定 15723054
RNF4 RES4-26 | SNURF 无名指蛋白4 重新组成复杂 BioGRID 9710597
RRN3 DKFZp566E104 | MGC104238 | TIFIA 我RRN3 RNA聚合酶转录因子相同器官(酵母) 亲和力Capture-Western BioGRID 11250903
RUVBL1 ECP54 | INO80H | NMP238 |庞丁| Pontin52 | RVB1 | TIH1 | TIP49 | TIP49A RuvB-like 1(大肠杆菌) 重新组成复杂 BioGRID 9843967
RXRA FLJ00280 | FLJ00318 | FLJ16020 | FLJ16733 | MGC102720 | NR2B1 类维生素a X受体α - - - - - - HPRD, BioGRID 7667283
SNAPC2 PTFdelta | SNAP45 小核RNA激活复杂、多肽2 45 kda - - - - - - HPRD, BioGRID 8633057
SNAPC4 FLJ13451 | PTFalpha | SNAP190 小核RNA激活复杂,多肽190 kda - - - - - - HPRD, BioGRID 12621023
SNURF - - - - - - SNRPN上游阅读框 表型增强 BioGRID 11696545
SPIB SPI-B Spi-B转录因子(Spi-1 / PU。1相关) - - - - - - HPRD, BioGRID 10196196
SUB1 MGC102747 | P15 | PC4 |好 SUB1同族体(酵母) - - - - - - HPRD 9482861
TAF1 BA2R | CCG1 | 20 | DYT3 | KAT4 | N-TAF1 | NSCL2 |的| P250 | TAF2A | TAFII250 TAF1 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,250 kda - - - - - - HPRD, BioGRID 7680771
TAF10 TAF2A | TAF2H | TAFII30 TAF10 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,30 kda - - - - - - HPRD 7923369
TAF10 TAF2A | TAF2H | TAFII30 TAF10 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,30 kda Co-purification BioGRID 7680771|9153318
TAF11 德国:15243 | PRO2134 | TAF2I | TAFII28 TAF11 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,28 kda - - - - - - HPRD, BioGRID 7729427
TAF13 MGC22425 | TAF2K | TAFII18 TAF13 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,18 kda - - - - - - HPRD, BioGRID 7729427
TAF15 Npl3 | RBP56 | TAF2N | TAFII68 | hTAFII68 TAF15 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,68 kda 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
BioGRID 8663456
TAF1A 德国:17061 | RAFI48 | SL1 | TAFI48 TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,RNA聚合酶I, A, 48 kda - - - - - - HPRD, BioGRID 7801123
TAF1A 德国:17061 | RAFI48 | SL1 | TAFI48 TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,RNA聚合酶I, A, 48 kda 真沸点与TAFI48 SL1内转录因子复杂 绑定 7801123
TAF1B 德国:9349 | RAF1B | RAFI63 | SL1 | TAFI63 TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,RNA聚合酶I, B, 63 kda - - - - - - HPRD, BioGRID 7801123
TAF1B 德国:9349 | RAF1B | RAFI63 | SL1 | TAFI63 TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,RNA聚合酶I, B, 63 kda 真沸点与TAFI63 SL1内转录因子复杂。 绑定 7801123
TAF1C 德国:39976 | SL1 | TAFI110 | TAFI95 TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,RNA聚合酶I, C, 110 kda - - - - - - HPRD, BioGRID 7801123
TAF1C 德国:39976 | SL1 | TAFI110 | TAFI95 TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,RNA聚合酶I, C, 110 kda 真沸点与TAFI110 SL1内转录因子复杂 绑定 7801123
TAF1L MGC134910 | TAF2A2 TAF1 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,210 kda-like - - - - - - HPRD, BioGRID 12217962
TAF2 CIF150 | TAF2B | TAFII150 TAF2 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,150 kda 真沸点与TAFII150交互。这种交互是模仿了人类真沸点和TAFII150果蝇之间的交互。 绑定 7801123
TAF2 CIF150 | TAF2B | TAFII150 TAF2 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,150 kda Co-purification BioGRID 7680771
TAF4 FLJ41943 | TAF2C | TAF2C1 | TAF4A | TAFII130 | TAFII135 TAF4 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,135 kda 亲和力Capture-Western
Co-purification
BioGRID 9153318|12665565
TAF5 TAF2D | TAFII100 TAF5 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,100 kda - - - - - - HPRD, BioGRID 9045704
TAF6 DKFZp781E21155 | MGC: 8964 | TAF2E | TAFII70 | TAFII80 | TAFII85 TAF6 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,80 kda 亲和力Capture-Western
Co-purification
BioGRID 7680771|9153318
|12665565
TAF7 TAF2F | TAFII55 TAF7 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,55 kda 亲和力Capture-Western
Co-purification
BioGRID 9153318|12665565
TAF7L FLJ23157 | TAF2Q | dJ738A13.1 TAF7-like RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,50 kda - - - - - - HPRD, BioGRID 12665565
TAF9 广告- 004 | AK6 | cgi - 137 | CINAP | CIP | MGC1603 | MGC3647 | MGC5067 | MGC: 1603 | MGC: 3647 | MGC: 5067 | TAF2G | TAFII31 | TAFII32 | TAFIID32 TAF9 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,32 kda Co-purification BioGRID 9153318
真沸点 GTF2D | GTF2D1 | MGC117320 | MGC126054 | MGC126055 | SCA17 | TFIID TATA盒结合蛋白 亲和力Capture-Western BioGRID 8650542
TCEA1 GTF2S孵化器计划| | TCEA | TF2S | TFIIS 转录延长因子(他们),1 重新组成复杂 BioGRID 9305922
TP53 FLJ92943 | LFS1 | TRP53 | p53 肿瘤蛋白质p53 - - - - - - HPRD, BioGRID 1465435
TRAM2 KIAA0057 易位相关膜蛋白2 - - - - - - HPRD 14612417
远方 HsT17391 甲状腺激素受体关联4 - - - - - - HPRD 10454579
UBTF 和- 90 | UBF 上游转录因子结合,RNA聚合酶I - - - - - - HPRD, BioGRID 8552083
WDR62 C19orf14 | DKFZp434J046 | DKFZp686G1024 | FLJ33298 | MGC166976 WD重复62年的域 2台混合动力 BioGRID 16169070


部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
KEGG基底转录因子 36 24 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG亨廷顿疾病 185年 109年 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA CARM ER通路 35 27 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA RARRXR通路 15 9 所有SZGR 2.0基因通路
PID REG GR通路 82年 60 所有SZGR 2.0基因通路
PID MYC抑制通路 63年 52 所有SZGR 2.0基因通路
PID 1 RB通路 65年 46 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME RNA聚合酶III 2型启动子的转录起始 23 12 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME RNA聚合酶II转录 105年 54 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME RNA聚合酶III转录 33 18 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME RNA聚合酶II转录前启动和启动子 41 21 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME转录 210年 127年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME RNA聚合酶I RNA聚合酶III和线粒体转录 122年 80年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME RNA聚合酶II PRE转录事件 61年 32 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME RNA聚合酶III 3型启动子的转录起始 26 13 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME艾滋病毒感染 207年 122年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME艾滋病毒生命周期 125年 69年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME艾滋病毒生命周期的后期阶段 104年 61年 所有SZGR 2.0基因通路
奥斯曼膀胱癌DN 406年 230年 所有SZGR 2.0基因通路
ENK紫外线反应表皮 293年 179年 所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652年 1023年 所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA ATM PCC网络 1442年 892年 所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA CHEK2 PCC网络 779年 480年 所有SZGR 2.0基因通路
DN NUYTTEN EZH2目标 1024年 594年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH NANOG目标 988年 594年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH SOX2目标 734年 436年 所有SZGR 2.0基因通路
酒井法子肿瘤浸润的单核细胞DN 81年 51 所有SZGR 2.0基因通路
霍夫曼细胞淋巴瘤了 50 35 所有SZGR 2.0基因通路
徐gh自分泌的目标 268年 157年 所有SZGR 2.0基因通路
由喀斯特IWANAGA致癌PTEN DN 353年 226年 所有SZGR 2.0基因通路
前列腺癌SETLUR TMPRSS2 ERG融合起来 67年 48 所有SZGR 2.0基因通路
MARTENS受PML RARA融合 456年 287年 所有SZGR 2.0基因通路
棕熊短波紫外线反应迟 1137年 655年 所有SZGR 2.0基因通路
赞美上帝FOXO3 DN的目标 187年 109年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
miR-1/206 474年 481年 1、m8 hsa-miR-1 UGGAAUGUAAAGAAGUAUGUA
hsa - mir - 206深圳 UGGAAUGUAAGGAAGUGUGUGG
hsa - mir - 613 AGGAAUGUUCCUUCUUUGCC
miR-15/16/195/424/497 229年 236年 1、m8 hsa-miR-15a大脑 UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG
hsa-miR-16大脑 UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG
hsa-miR-15b大脑 UAGCAGCACAUCAUGGUUUACA
hsa - mir - 195深圳 UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC
hsa - mir - 424 CAGCAGCAAUUCAUGUUUUGAA
hsa - mir - 497 CAGCAGCACACUGUGGUUUGU
mir - 200 bc / 429 488年 494年 m8 hsa - mir - 200 b UAAUACUGCCUGGUAAUGAUGAC
hsa - mir - 200 c UAAUACUGCCGGGUAAUGAUGG
hsa - mir - 429 UAAUACUGUCUGGUAAAACCGU
mir - 379 394年 400年 1 hsa - mir - 379大脑 UGGUAGACUAUGGAACGUA