基因页面:真沸点
总结吗?
GeneID | 6908年 |
象征 | 真沸点 |
同义词 | GTF2D | GTF2D1 | HDL4 | SCA17 | TFIID |
描述 | 着重结合蛋白 |
参考 | MIM: 600075|HGNC: HGNC: 11588|运用:ENSG00000112592|HPRD: 02511|织女:OTTHUMG00000016084 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 6问 |
帕斯卡假定值 | 0.215 |
夏洛克假定值 | 0.118 |
胎儿β | 1.038 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
协会 | 综合优势比方法(太阳et al . 2008),协会研究 | 1 | 链接到SZGene |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,精神分裂症患者,神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg11786005 | 6 | 170863399 | 真沸点 | 2.24 e-9 | -0.007 | 1.73 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs9570060 | chr13 | 59754134 | 真沸点 | 6908年 | 0.15 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TBP_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
GJA4 | 0.70 | 0.69 |
翻 | 0.68 | 0.69 |
FCGRT | 0.66 | 0.68 |
BGN | 0.65 | 0.69 |
TIMP1 | 0.64 | 0.67 |
MFSD2 | 0.61 | 0.64 |
TM4SF1 | 0.61 | 0.60 |
S100A11 | 0.61 | 0.62 |
TGFB1 | 0.59 | 0.62 |
ORAI3 | 0.59 | 0.62 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ZMAT2 | -0.40 | -0.46 |
CEP63 | -0.39 | -0.39 |
C1orf96 | -0.38 | -0.35 |
CIR1 | -0.36 | -0.39 |
LMO7 | -0.36 | -0.36 |
ZRSR2 | -0.36 | -0.37 |
GPR22 | -0.35 | -0.38 |
KHDRBS3 | -0.35 | -0.34 |
PITPNB | -0.35 | -0.38 |
RNPC3 | -0.35 | -0.38 |
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003677 | DNA结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0003702 | RNA聚合酶II转录因子的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005488 | 绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 1465435|7680771|8006019 |9045704|9748258 |10391676|12040021 |12217962 |
|
去:0016251 | 一般的RNA聚合酶II转录因子的活动 | 助教 | 2363050 | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0006355 | 依赖dna的转录调节 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0006367 | 从RNA聚合酶II启动子转录起始 | 经验值 | 8946909 | |
去:0006367 | 从RNA聚合酶II启动子转录起始 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0006367 | 从RNA聚合酶II启动子转录起始 | 助教 | 2363050 | |
去:0006368 | RNA RNA聚合酶II发起人的伸长 | 经验值 | 9405375 | |
去:0006350 | 转录 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0008219 | 细胞死亡 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0044419 | 生物种间相互作用 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005654 | 核浆 | 经验值 | 1939271|2449431|8946909 |
|
去:0005669 | 转录因子TFIID复杂 | 艾达 | 14580349 | |
去:0005669 | 转录因子TFIID复杂 | 国际能源机构 | - - - - - - |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ABT1 | hABT1 | 转录激活的基底1 | - - - - - - | HPRD | 10648625 |
AHR | - - - - - - | 芳基碳氢化合物受体 | 与气道高反应性真沸点。 | 绑定 | 15641800 |
AHR | - - - - - - | 芳基碳氢化合物受体 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 8794892 |
基于“增大化现实”技术 | AIS | DHTR | HUMARA | KD | NR3C4 | SBMA | SMAX1 |解冻 | 雄性激素受体 | 重新组成复杂 | BioGRID | 9238003 |
ATF4 | CREB-2 | CREB2 | TAXREB67 | TXREB | 激活转录因子4 (tax-responsive增强器元素B67) | 重新组成复杂 | BioGRID | 9295363 |
伯灵顿 | BCL2L4 | BCL2-associated X蛋白 | 真沸点与伯灵顿启动子进行交互。 | 绑定 | 15710329 |
BCL3 | BCL4 | D19S37 | b细胞慢性淋巴细胞白血病/淋巴瘤3 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9812988 |
BRF1 | BRF | FLJ42674 | FLJ43034 | GTF3B | MGC105048 | TAF3B2 | TAF3C | TAFIII90 | TF3B90 | TFIIIB90 | hBRF | BRF1同族体,单元的RNA聚合酶III转录起始因子希望(酵母) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7624363|10921893 |
BRF2 | BRFU | FLJ11052 | TFIIIB50 | BRF2,亚基的RNA聚合酶III转录起始因子,BRF1-like | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11564744 |
BTAF1 | KIAA0940 | MGC138406 | MOT1 | TAF (II) 170 | TAF172 | TAFII170 | BTAF1 RNA聚合酶II, B-TFIID转录factor-associated 170 kda (Mot1同族体,酵母) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9488487 |
CBX5 | HP1 | HP1A | chromobox同族体5 (HP1α相同器官,果蝇) | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 11959914 |
CD3EAP | ASE-1 |演员| MGC118851 | PAF49 | CD3e分子,ε相关的蛋白质 | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 15226435 |
CITED2 | MRG1 | P35SRJ | 海关与边境保护局/ p300-interacting反式激活因子,Glu / Asp-rich carboxy-terminal域,2 | 重新组成复杂 | BioGRID | 10593900 |
CREG1 | CREG | E1A-stimulated基因的细胞抑制因子1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9710587 |
CREM | 冷藏工人| MGC111110 | MGC17881 | MGC41893 | hCREM-2 | 营响应要素调制器 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10409662 |
CTBP1 | 酒吧| MGC104684 | c端结合蛋白1 | 重新组成复杂 | BioGRID | 11959865 |
DHX9 | DDX9 | LKP | NDHII | RHA | DEAH (Asp-Glu-Ala-His)盒子多肽9 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11149922 |
根据DR1 | NC2 | NC2-BETA | 装置的转录TBP-binding(-代数余子式2) | - - - - - - | HPRD | 11461703 |
DRAP1 | NC2-alpha | DR1-associated蛋白1(α-代数余子式2) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11461703 |
EDF1 | EDF-1 | MBF1 | MGC9058 | 内皮differentiation-related因子1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10816571 |
EP300 | KAT3B | p300 | E1A结合蛋白p300 | p300与真沸点。 | 绑定 | 8621548 |
ESR1 | ER DKFZp686N23123 | | ESR |将有关| |时代NR3A1 | 雌激素受体1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11595744 |
”丛书 | AP-1 | C-FOS | v-fos FBJ小鼠骨肉瘤病毒致癌基因相同器官 | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 |
BioGRID | 8065335 |
”丛书 | AP-1 | C-FOS | v-fos FBJ小鼠骨肉瘤病毒致癌基因相同器官 | - - - - - - | HPRD | 7685215 |
FOXF2 | FKHL6 | FREAC2 | F2 forkhead框 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9722567 |
GLI2 | HPE9 | THP1 | THP2 | GLI-Kruppel家人GLI2 | 真沸点与GLI-2交互。之间的交互是仿照了交互从一个未指明的物种和人类GLI-2真沸点。 | 绑定 | 11160734 |
GTF2A1 | MGC129969 | MGC129970 | TF2A1 | TFIIA | 通用转录因子活动花絮,1,19/37kDa | 生化活动 重新组成复杂 |
BioGRID | 7724559|7958900 |9603936|11278496 |11509574 |
GTF2A1L | 阿尔夫| MGC26254 | 通用转录因子活动花絮,1 | 重新组成复杂 | BioGRID | 12107178 |
GTF2A2 | HsT18745 | TF2A2 | TFIIA | 通用转录因子活动花絮2 12 kda | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7724559|7958900 |9603936 |
GTF2B | TF2B | TFIIB | IIB通用转录因子 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 14963322 |
GTF2E1 | 菲| TF2E1 | TFIIE-A | 通用转录因子国际教育协会多肽1α56 kda | - - - - - - | HPRD | 11113176 |
GTF2E1 | 菲| TF2E1 | TFIIE-A | 通用转录因子国际教育协会多肽1α56 kda | Co-purification 重新组成复杂 |
BioGRID | 7926747|9159119 |
GTF2E2 | 菲| TF2E2 | TFIIE-B | 通用转录因子国际教育协会,多肽2,β34 kda | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9677423|11113176 |
GTF2F1 | BTF4 | RAP74 | TF2F1 | TFIIF | 通用转录因子IIF多肽74 kda | 生化活动 Co-purification 重新组成复杂 |
BioGRID | 7590250|9159119 |9482861 |
GTF2F2 | BTF4 | RAP30 | TF2F2 | TFIIF | 通用转录因子IIF多肽2、30 kda | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 8577725 |
GTF2H4 | TFB2 | TFIIH | 通用转录因子颅内高压症,多肽4,52 kda | Co-purification 重新组成复杂 |
BioGRID | 9159119 |
GTF3C2 | KIAA0011 | TFIIIC-BETA | TFIIIC110 | 通用转录因子IIIC多肽2β110 kda | 重新组成复杂 | BioGRID | 10373544 |
GTF3C3 | TFIIIC102 | TFIIICgamma | tfiiic2 - 102 | 通用转录因子IIIC多肽102 kda | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10373544 |
GTF3C4 | FLJ21002 | KAT12 | MGC138450 | TFIII90 | TFIIIC90 | TFIIICdelta | tfiiic2 - 90 | 通用转录因子IIIC多肽90 kda | 重新组成复杂 | BioGRID | 10373544 |
GTF3C5 | FLJ20857 | TFIIIC63 | TFIIICepsilon | tfiiic2 - 63 | 通用转录因子IIIC多肽63 kda | 重新组成复杂 | BioGRID | 10373544 |
HMGB1 | DKFZp686A04236 | HMG1 | HMG3 | SBP-1 | 高机动组框1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9880542 |
HSF1 | HSTF1 | 热休克转录因子1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11005381 |
计画 | 高清| IT15 | 杭丁顿蛋白 | 计画与真沸点。 | 绑定 | 15225551 |
计画 | 高清| IT15 | 杭丁顿蛋白 | - - - - - - | HPRD | 10410676 |
IKZF1 | Hs.54452 | IK1 | IKAROS | LYF1 | PRO0758 | ZNFN1A1 | hIk-1 | 伊卡洛斯家族锌指1(伊卡洛斯飞船) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11959865 |
IRF1 | IRF-1 | 3月 | 干扰素调节因子1 | 真沸点与IRF-1启动子。 | 绑定 | 15893730 |
JARID1A | KDM5A | RBBP2 | RBP2 | jumonji,丰富互动领域1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7935440 |
小君 | AP-1 | AP1 | c-Jun | 小君致癌基因 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7848298 |
JUND | AP-1 | 小君D原癌基因 | - - - - - - | HPRD | 7848298 |
KLF5 | BTEB2 | CKLF | IKLF | Kruppel-like因子5(肠) | 重新组成复杂 | BioGRID | 9089417 |
MCM2 | BM28 | CCNL1 | CDCL1 | D3S3194 | KIAA0030 | MGC10606 | MITOTIN | cdc19 | 2 minichromosome维护复杂的组件 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12392551 |
MDM2 | HDMX | MGC71221 | hdm2 | Mdm2 p53结合蛋白同系物(鼠标) | 重新组成复杂 | BioGRID | 9271120|9388200 |
MSX1 | HOX7 | HYD1 | msh同源框1 | 亲和力Capture-Western 在活的有机体内 表型抑制 重新组成复杂 |
BioGRID | 8700832|9111364 |10215616 |
MSX1 | HOX7 | HYD1 | msh同源框1 | - - - - - - | HPRD | 8700832|10215616 |
MYC | bHLHe39 |原癌基因 | v-myc myelocytomatosis病毒致癌基因相同器官(禽流感) | 重新组成复杂 | BioGRID | 8755740 |
MYC | bHLHe39 |原癌基因 | v-myc myelocytomatosis病毒致癌基因相同器官(禽流感) | 真沸点与原癌基因。 | 绑定 | 15723054 |
项目实施 | HSD48 | MGC117224 | NACA1 | 新生polypeptide-associated复杂的α亚基 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 8835540 |
NCOA1 | F-SRC-1 | KAT13A | MGC129719 | MGC129720 | NCoA-1 | RIP160 | SRC-1 | SRC1 | bHLHe42 | 核受体共激活剂1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 8754792 |
NCOA3 | ACTR | AIB-1 | AIB1 | CAGH16 | CTG26 | KAT13B | MGC141848 | RAC3 | SRC3 | TNRC14 | TNRC16 | TRAM-1 | pCIP | 核受体共激活剂3 | - - - - - - | HPRD | 9267036 |
NCOA6 | AIB3 | ANTP | ASC2 | HOX1.1 | HOXA7 | KIAA0181 | NRC | PRIP | RAP250 | TRBP | 核受体共激活剂6 | 重新组成复杂 | BioGRID | 10567404 |
NFYB | CBF-A | CBF-B | HAP3 | NF-YB | 核转录因子Y,β | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9153318 |
NFYC | CBF-C | CBFC | DKFZp667G242 | FLJ45775 | H1TF2A | HAP5 | HSM | NF-YC | 核转录因子Y,γ | 重新组成复杂 | BioGRID | 9153318 |
NR3C1 | GCCR | GCR | GR | GRL | 核受体亚科3 C组,成员1(糖皮质激素受体) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9649342 |
PAX3 | 鼎晖| HUP2 | MGC120381 | MGC120382 | MGC120383 | MGC120384 | MGC134778 | WS1相同 | 成对框3 | 重新组成复杂 | BioGRID | 10359315 |
PAX6 | 一个| AN2 | D11S812E | MGC17209 | MGDA | WAGR | 双箱6 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10359315 |
POLR2A | MGC75453 | POLR2 | POLRA | RPB1 | RPBh1 | RPO2 | RPOL2 | RpIILS | hRPB220 | hsRPB1 | DNA聚合酶(RNA) II(导演)多肽,220 kda | Co-purification 重新组成复杂 |
BioGRID | 9159119 |
POLR3C | RPC3 | RPC62 | DNA聚合酶(RNA) III(导演)多肽C (62 kd) | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 9171375 |
POLR3F | MGC13517 | RPC39 | RPC6 | DNA聚合酶(RNA) III(导演)多肽F, 39 kDa | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9171375 |
POU2F1 | OCT1 | OTF1 | POU类2同源框1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 8202368 |
POU2F2 | OCT2 | OTF2 | Oct-2 | POU类2同源框2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 8202368 |
POU3F2 | BRN2 | OCT7 | OTF7 | POUF3 | POU类3同源框2 | Brn-2与真沸点。 | 绑定 | 11029584 |
PSMC2 | MGC3004 | MSS1 | Nbla10058 | S7 | 蛋白酶体(prosome macropain) 26 s亚基,atp酶2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11118327 |
RB1 | OSRC | RB | p105-Rb |复审委员会| pp110 | 成视网膜细胞瘤1 | Rb与真沸点 | 绑定 | 11094070 |
REL | : | v-rel reticuloendotheliosis病毒致癌基因相同器官(禽流感) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 8413269 |
RELA | MGC131774 | NFKB3 | p65 | v-rel reticuloendotheliosis病毒致癌基因相同器官(禽流感) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7706261|9584164 |
RIBIN | - - - - - - | 核糖体rna启动子结合蛋白 | 真沸点与rDNA交互。 | 绑定 | 15723054 |
RNF4 | RES4-26 | SNURF | 无名指蛋白4 | 重新组成复杂 | BioGRID | 9710597 |
RRN3 | DKFZp566E104 | MGC104238 | TIFIA | 我RRN3 RNA聚合酶转录因子相同器官(酵母) | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 11250903 |
RUVBL1 | ECP54 | INO80H | NMP238 |庞丁| Pontin52 | RVB1 | TIH1 | TIP49 | TIP49A | RuvB-like 1(大肠杆菌) | 重新组成复杂 | BioGRID | 9843967 |
RXRA | FLJ00280 | FLJ00318 | FLJ16020 | FLJ16733 | MGC102720 | NR2B1 | 类维生素a X受体α | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7667283 |
SNAPC2 | PTFdelta | SNAP45 | 小核RNA激活复杂、多肽2 45 kda | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 8633057 |
SNAPC4 | FLJ13451 | PTFalpha | SNAP190 | 小核RNA激活复杂,多肽190 kda | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12621023 |
SNURF | - - - - - - | SNRPN上游阅读框 | 表型增强 | BioGRID | 11696545 |
SPIB | SPI-B | Spi-B转录因子(Spi-1 / PU。1相关) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10196196 |
SUB1 | MGC102747 | P15 | PC4 |好 | SUB1同族体(酵母) | - - - - - - | HPRD | 9482861 |
TAF1 | BA2R | CCG1 | 20 | DYT3 | KAT4 | N-TAF1 | NSCL2 |的| P250 | TAF2A | TAFII250 | TAF1 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,250 kda | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7680771 |
TAF10 | TAF2A | TAF2H | TAFII30 | TAF10 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,30 kda | - - - - - - | HPRD | 7923369 |
TAF10 | TAF2A | TAF2H | TAFII30 | TAF10 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,30 kda | Co-purification | BioGRID | 7680771|9153318 |
TAF11 | 德国:15243 | PRO2134 | TAF2I | TAFII28 | TAF11 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,28 kda | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7729427 |
TAF13 | MGC22425 | TAF2K | TAFII18 | TAF13 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,18 kda | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7729427 |
TAF15 | Npl3 | RBP56 | TAF2N | TAFII68 | hTAFII68 | TAF15 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,68 kda | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 |
BioGRID | 8663456 |
TAF1A | 德国:17061 | RAFI48 | SL1 | TAFI48 | TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,RNA聚合酶I, A, 48 kda | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7801123 |
TAF1A | 德国:17061 | RAFI48 | SL1 | TAFI48 | TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,RNA聚合酶I, A, 48 kda | 真沸点与TAFI48 SL1内转录因子复杂 | 绑定 | 7801123 |
TAF1B | 德国:9349 | RAF1B | RAFI63 | SL1 | TAFI63 | TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,RNA聚合酶I, B, 63 kda | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7801123 |
TAF1B | 德国:9349 | RAF1B | RAFI63 | SL1 | TAFI63 | TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,RNA聚合酶I, B, 63 kda | 真沸点与TAFI63 SL1内转录因子复杂。 | 绑定 | 7801123 |
TAF1C | 德国:39976 | SL1 | TAFI110 | TAFI95 | TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,RNA聚合酶I, C, 110 kda | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7801123 |
TAF1C | 德国:39976 | SL1 | TAFI110 | TAFI95 | TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,RNA聚合酶I, C, 110 kda | 真沸点与TAFI110 SL1内转录因子复杂 | 绑定 | 7801123 |
TAF1L | MGC134910 | TAF2A2 | TAF1 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,210 kda-like | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12217962 |
TAF2 | CIF150 | TAF2B | TAFII150 | TAF2 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,150 kda | 真沸点与TAFII150交互。这种交互是模仿了人类真沸点和TAFII150果蝇之间的交互。 | 绑定 | 7801123 |
TAF2 | CIF150 | TAF2B | TAFII150 | TAF2 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,150 kda | Co-purification | BioGRID | 7680771 |
TAF4 | FLJ41943 | TAF2C | TAF2C1 | TAF4A | TAFII130 | TAFII135 | TAF4 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,135 kda | 亲和力Capture-Western Co-purification |
BioGRID | 9153318|12665565 |
TAF5 | TAF2D | TAFII100 | TAF5 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,100 kda | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9045704 |
TAF6 | DKFZp781E21155 | MGC: 8964 | TAF2E | TAFII70 | TAFII80 | TAFII85 | TAF6 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,80 kda | 亲和力Capture-Western Co-purification |
BioGRID | 7680771|9153318 |12665565 |
TAF7 | TAF2F | TAFII55 | TAF7 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,55 kda | 亲和力Capture-Western Co-purification |
BioGRID | 9153318|12665565 |
TAF7L | FLJ23157 | TAF2Q | dJ738A13.1 | TAF7-like RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,50 kda | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12665565 |
TAF9 | 广告- 004 | AK6 | cgi - 137 | CINAP | CIP | MGC1603 | MGC3647 | MGC5067 | MGC: 1603 | MGC: 3647 | MGC: 5067 | TAF2G | TAFII31 | TAFII32 | TAFIID32 | TAF9 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,32 kda | Co-purification | BioGRID | 9153318 |
真沸点 | GTF2D | GTF2D1 | MGC117320 | MGC126054 | MGC126055 | SCA17 | TFIID | TATA盒结合蛋白 | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 8650542 |
TCEA1 | GTF2S孵化器计划| | TCEA | TF2S | TFIIS | 转录延长因子(他们),1 | 重新组成复杂 | BioGRID | 9305922 |
TP53 | FLJ92943 | LFS1 | TRP53 | p53 | 肿瘤蛋白质p53 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 1465435 |
TRAM2 | KIAA0057 | 易位相关膜蛋白2 | - - - - - - | HPRD | 14612417 |
远方 | HsT17391 | 甲状腺激素受体关联4 | - - - - - - | HPRD | 10454579 |
UBTF | 和- 90 | UBF | 上游转录因子结合,RNA聚合酶I | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 8552083 |
WDR62 | C19orf14 | DKFZp434J046 | DKFZp686G1024 | FLJ33298 | MGC166976 | WD重复62年的域 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG基底转录因子 | 36 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG亨廷顿疾病 | 185年 | 109年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA CARM ER通路 | 35 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA RARRXR通路 | 15 | 9 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID REG GR通路 | 82年 | 60 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID MYC抑制通路 | 63年 | 52 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID 1 RB通路 | 65年 | 46 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME RNA聚合酶III 2型启动子的转录起始 | 23 | 12 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME RNA聚合酶II转录 | 105年 | 54 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME RNA聚合酶III转录 | 33 | 18 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME RNA聚合酶II转录前启动和启动子 | 41 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME转录 | 210年 | 127年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME RNA聚合酶I RNA聚合酶III和线粒体转录 | 122年 | 80年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME RNA聚合酶II PRE转录事件 | 61年 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME RNA聚合酶III 3型启动子的转录起始 | 26 | 13 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME艾滋病毒感染 | 207年 | 122年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME艾滋病毒生命周期 | 125年 | 69年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME艾滋病毒生命周期的后期阶段 | 104年 | 61年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
奥斯曼膀胱癌DN | 406年 | 230年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ENK紫外线反应表皮 | 293年 | 179年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652年 | 1023年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA ATM PCC网络 | 1442年 | 892年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779年 | 480年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN NUYTTEN EZH2目标 | 1024年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH NANOG目标 | 988年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH SOX2目标 | 734年 | 436年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
酒井法子肿瘤浸润的单核细胞DN | 81年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
霍夫曼细胞淋巴瘤了 | 50 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
徐gh自分泌的目标 | 268年 | 157年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由喀斯特IWANAGA致癌PTEN DN | 353年 | 226年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
前列腺癌SETLUR TMPRSS2 ERG融合起来 | 67年 | 48 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MARTENS受PML RARA融合 | 456年 | 287年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
棕熊短波紫外线反应迟 | 1137年 | 655年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
赞美上帝FOXO3 DN的目标 | 187年 | 109年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
miR-1/206 | 474年 | 481年 | 1、m8 | hsa-miR-1 | UGGAAUGUAAAGAAGUAUGUA |
hsa - mir - 206深圳 | UGGAAUGUAAGGAAGUGUGUGG | ||||
hsa - mir - 613 | AGGAAUGUUCCUUCUUUGCC | ||||
miR-15/16/195/424/497 | 229年 | 236年 | 1、m8 | hsa-miR-15a大脑 | UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG |
hsa-miR-16大脑 | UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG | ||||
hsa-miR-15b大脑 | UAGCAGCACAUCAUGGUUUACA | ||||
hsa - mir - 195深圳 | UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC | ||||
hsa - mir - 424 | CAGCAGCAAUUCAUGUUUUGAA | ||||
hsa - mir - 497 | CAGCAGCACACUGUGGUUUGU | ||||
mir - 200 bc / 429 | 488年 | 494年 | m8 | hsa - mir - 200 b | UAAUACUGCCUGGUAAUGAUGAC |
hsa - mir - 200 c | UAAUACUGCCGGGUAAUGAUGG | ||||
hsa - mir - 429 | UAAUACUGUCUGGUAAAACCGU | ||||
mir - 379 | 394年 | 400年 | 1 | hsa - mir - 379大脑 | UGGUAGACUAUGGAACGUA |