基因页：TBX5
概括？
| 基因 | 6910 |
| 象征 | TBX5 |
| 同义词 | 霍斯 |
| 描述 | T-box 5 |
| 参考 | MIM：601620|HGNC：HGNC：11604|ENSEMBL：ENSG00000089225|HPRD：03372|Vega：Otthumg00000166191 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 12Q24.1 |
| Pascal P值 | 0.992 |
| 胎儿β | 0.143 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 小脑 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| TBX5 | CHR12 | 114804166 | G | 一个 | NM_000192 NM_080717 NM_181486 |
。 。 。 |
沉默的 沉默的 沉默的 |
精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG23320862 | 12 | 114843932 | TBX5 | 7.77E-8 | -0.026 | 1.83E-5 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| CCT8 | 0.97 | 0.97 |
| CCT6A | 0.97 | 0.96 |
| polr2b | 0.96 | 0.95 |
| NOL11 | 0.96 | 0.95 |
| HSF2 | 0.96 | 0.96 |
| RFWD2 | 0.96 | 0.95 |
| Tex10 | 0.96 | 0.95 |
| CSE1L | 0.96 | 0.95 |
| GDI2 | 0.95 | 0.96 |
| cdc5l | 0.95 | 0.94 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.76 | -0.88 |
| MT-CO2 | -0.76 | -0.88 |
| AF347015.33 | -0.76 | -0.88 |
| AF347015.27 | -0.75 | -0.87 |
| HLA-F | -0.75 | -0.82 |
| mt-cyb | -0.75 | -0.87 |
| AIFM3 | -0.74 | -0.81 |
| AF347015.8 | -0.74 | -0.88 |
| AF347015.15 | -0.73 | -0.87 |
| AF347015.2 | -0.72 | -0.89 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Reactome YAP1和WWTR1 TAZ刺激基因表达 | 24 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome通用转录途径 | 352 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周的炎症反应fima | 544 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ingram SHH目标 | 127 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kaab心脏中心与心室 | 249 | 170 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krasnoselskaya ILF3靶向 | 38 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染12小时DN | 101 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| H3K27me3 | 97 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Cheng由雌二醇印记 | 110 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruneau分隔室 | 10 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen IPS带有HCP H3K27Me3 | 102 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES HCP带有H3K27Me3 | 41 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染1小时 | 61 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |