基因页面:TBX6

总结吗?
GeneID 6911年
象征 TBX6
同义词 SCDO5
描述 T-box 6
参考 MIM: 602427|HGNC: HGNC: 11605|运用:ENSG00000149922|HPRD: 03888|织女:OTTHUMG00000132115
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 16 p11.2
帕斯卡假定值 2.368 e-6
胎儿β -0.828
DMG 1(#研究)
eGene 尾状基底神经节
皮质
额叶皮质BA9
迈尔斯的顺式和反式

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
CNV:是的 拷贝数变异的研究 人工管理
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 2
GSMA_IIE 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) Psr: 0.01775

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg05417332 16 30104025 YPEL3; TBX6 7.11 e-5 -0.462 0.025 DMG: Wockner_2014
cg09278687 16 30100430 TBX6 2.369的军医 -0.382 0.037 DMG: Wockner_2014

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs1578978 chr8 118196802 TBX6 6911年 0.12 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

没有大脑中的基因区域


第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0003700 转录因子的活动 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0001707 中胚层的形成 国际能源机构 - - - - - -
去:0001708 细胞命运的规范 国际能源机构 - - - - - -
去:0006355 依赖dna的转录调节 国际能源机构 - - - - - -
去:0009653 解剖结构形态发生 助教 9888994
去:0007498 中胚层发育 助教 9933572
去:0007275 多细胞有机体的发展 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005634 核 国际能源机构 - - - - - -

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
DN SCHLOSSER血清反应 712年 443年 所有SZGR 2.0基因通路
BALLIF发育障碍P16 P12删除 13 8 所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652年 1023年 所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA ATM PCC网络 1442年 892年 所有SZGR 2.0基因通路
沈SMARCA2 DN的目标 357年 212年 所有SZGR 2.0基因通路
谢泼德BMYB吗啉代了 205年 126年 所有SZGR 2.0基因通路
阿尔茨海默病了布莱洛克的 1691年 1088年 所有SZGR 2.0基因通路
李小脑老化了 84年 58 所有SZGR 2.0基因通路
米凯尔森ES与H3K4ME3 ICP 718年 401年 所有SZGR 2.0基因通路
MARTENS受PML RARA融合 456年 287年 所有SZGR 2.0基因通路
PILON KLF1目标了 504年 321年 所有SZGR 2.0基因通路