基因页：TCEA1
概括？
| 基因 | 6917 |
| 象征 | TCEA1 |
| 同义词 | gtf2s | sii | tcea | tf2s | tfiis |
| 描述 | 转录伸长因子A1 |
| 参考 | MIM：601425|HGNC：HGNC：11612|Ensembl：ENSG00000187735|HPRD：03252|Vega：Otthumg00000164262 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 8Q11.2 |
| Pascal P值 | 0.352 |
| 胎儿β | 0.268 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG11787876 | 8 | 54935228 | TCEA1 | 1.93E-8 | -0.013 | 6.79E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS11997954 | CHR8 | 54899848 | TCEA1 | 6917 | 0 | 顺式 | ||
| RS6473900 | CHR8 | 54912989 | TCEA1 | 6917 | 0.01 | 顺式 | ||
| RS16919782 | CHR8 | 55063436 | TCEA1 | 6917 | 0.01 | 顺式 | ||
| RS16919784 | CHR8 | 55063537 | TCEA1 | 6917 | 0.01 | 顺式 | ||
| RS11991952 | CHR8 | 55069060 | TCEA1 | 6917 | 0.01 | 顺式 | ||
| RS4737503 | CHR8 | 55071318 | TCEA1 | 6917 | 0.05 | 顺式 | ||
| RS11997954 | CHR8 | 54899848 | TCEA1 | 6917 | 0.09 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| CDK7 | cak1 |CDKN7 |mo15 |STK1 |P39MO15 | 细胞周期蛋白依赖性激酶7 | 重构的复合物 | Biogrid | 9305922 |
| CDK8 | K35 |MGC126074 |MGC126075 | 细胞周期蛋白依赖性激酶8 | 重构的复合物 | Biogrid | 9305922 |
| CTDP1 | ccfdn |FCP1 | CTD（羧基末端结构域，RNA聚合酶II，多肽A）磷酸酶，亚基1 | - | HPRD，Biogrid | 9765293 |
| GTF2B | TF2B |tfiib | 通用转录因子IIB | 重构的复合物 | Biogrid | 9305922 |
| GTF2E1 | fe |TF2E1 |tfiie-a | 通用转录因子IIE，多肽1，α56KDA | - | HPRD，Biogrid | 9305922 |
| GTF2F1 | BTF4 |Rap74 |TF2F1 |tfiif | 通用转录因子IIF，多肽1，74KDA | 重构的复合物 | Biogrid | 9305922 |
| GTF2F2 | BTF4 |Rap30 |TF2F2 |tfiif | 通用转录因子IIF，多肽2，30KDA | 重构的复合物 | Biogrid | 9305922 |
| GTF2H1 | BTF2 |TFB1 |tfiih | 一般转录因子IIH，多肽1，62KDA | 重构的复合物 | Biogrid | 9305922|9765293 |
| polr2a | MGC75453 |polr2 |波拉|RPB1 |RPBH1 |RPO2 |rpol2 |rpiils |HRPB220 |HSRPB1 | 聚合酶（RNA）II（定向DNA）多肽A，220KDA | - | HPRD，Biogrid | 12914699 |
| REXO1 | eloabp1 |ELOA-BP1 |KIAA1138 |rex1 |TCEB3BP1 | REX1，RNA外切酶1同源物（S. cerevisiae） | - | HPRD，Biogrid | 12943681 |
| TBP | gtf2d |GTF2D1 |MGC117320 |MGC126054 |MGC126055 |SCA17 |tfiid | 塔塔盒结合蛋白 | 重构的复合物 | Biogrid | 9305922 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Reactome RNA Pol II转录 | 105 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome转录耦合ner tc ner | 45 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome转录 | 210 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组核苷酸切除修复 | 51 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RNA Pol II伸长复合物的反应组形成 | 45 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome伸长逮捕和恢复 | 32 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 转录耦合NER TC NER修复复合物的反应组形成 | 30 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome DNA修复 | 112 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome RNA Pol II前转录事件 | 61 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome HIV感染 | 207 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome HIV生命周期 | 125 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome HIV生命周期的后期 | 104 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过CD40 UP的Hollmann凋亡 | 201 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Tien肠益生菌24小时DN | 214 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vanharanta子宫肌瘤带有7Q删除 | 67 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| OUELLET卵巢癌侵入性与LMP UP | 117 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MET的Seiden肿瘤发生 | 88 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| myllykangas放大热点9 | 8 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| liang造血细胞数大与微小的DN | 45 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| gotzmann上皮到间充质过渡dn | 206 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chesler Brain QTL顺式 | 75 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 史密斯·泰特（Smith Tert） | 145 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Marciniak ER应力响应通过CHOP | 25 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TBH和H2O2的Weigel氧化应激 | 36 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血成熟细胞 | 293 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HU基因毒素作用直接与间接24小时 | 55 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Aprelikova BRCA1目标 | 49 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yamazaki TCEB3靶向DN | 215 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bacolod抗烷基化剂DN | 60 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez TP53靶向 | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1和TP53靶向 | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张乳腺癌祖细胞 | 425 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 对Salirasib的反应 | 245 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王肿瘤的侵入性DN | 210 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 格雷希克癌症复制号码 | 323 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hsiao家政基因 | 389 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan晚分化基因dn | 16 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO对孕酮簇的时间反应14 | 143 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO对孕酮簇的时间反应17 | 181 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BAE BRCA1靶向 | 75 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHYLA CBFA2T3靶向DN | 242 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 | 344 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |