基因页：Zeb1
概括？
| 基因 | 6935 |
| 象征 | Zeb1 |
| 同义词 | areb6 | bzp | deltaef1 | fecd6 | nil2a | ppcd3 | tcf8 | zfhep | zfhx1a |
| 描述 | 锌指EBOXBINDING HONEOBOX 1 |
| 参考 | MIM：189909|HGNC：HGNC：11642|ENSEMBL：ENSG00000148516|HPRD：01798|Vega：Otthumg0000000017907 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 10p11.2 |
| Pascal P值 | 0.132 |
| TADA P值 | 0.002 |
| 胎儿β | 0.961 |
| 支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| DNM：Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Zeb1 | Chr10 | 31815671 | C | t | NM_001128128 NM_001174093 NM_001174094 NM_001174095 NM_001174096 NM_030751 |
p.936r>* p.932r>* p.935r>* p.885r>* p.953r>* p.952r>* |
废话 废话 废话 废话 废话 废话 |
精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG14631462 | 10 | 31607925 | ZEB1; LOC220930 | 4.272E-4 | -0.618 | 0.045 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003700 | 转录因子活性 | IEA | - | |
| 去：0003700 | 转录因子活性 | 塔斯 | 8138542 | |
| 去：0003713 | 转录共激活因子活性 | 塔斯 | 8138542 | |
| 去：0003714 | 转录CorePressor活性 | 塔斯 | 8138542 | |
| 去：0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
| 去：0008270 | 锌离子结合 | 塔斯 | 8138542 | |
| 去：0008134 | 转录因子结合 | IEA | - | |
| GO：0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
| GO：0043565 | 序列特异性DNA结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007417 | 中枢神经系统发展 | IEA | 大脑（GO期限：6） | - |
| GO：0000122 | RNA聚合酶II启动子的转录负调控 | IEA | - | |
| GO：0000122 | RNA聚合酶II启动子的转录负调控 | 塔斯 | 1840704 | |
| 去：0006355 | 调节转录，DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
| 去：0006350 | 转录 | IEA | - | |
| 去：0008283 | 细胞增殖 | 塔斯 | 1840704 | |
| 去：0006955 | 免疫反应 | 塔斯 | 1840704 | |
| GO：0048598 | 胚胎形态发生 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - | |
| 去：0005667 | 转录因子复合物 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID幼稚园 | 45 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schuetz乳腺癌导管侵入性 | 351 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| turashvili乳房小叶癌与导管正常 | 69 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌腔与间充质DN | 460 | 312 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌基础与间充质DN | 50 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NUP98 HOXA9 Fusion 10D的Takeda目标 | 194 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim WT1靶向 | 214 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 冷吉非替尼抵抗 | 85 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄端癌DN | 82 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| XU HGF目标由Akt1 6hr诱导 | 19 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Amit EGF响应240 HELA | 60 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onder CDH1目标2向上 | 256 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 | 314 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mahajan对IL1A DN的反应 | 76 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kondo EZH2目标 | 245 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌正常 | 476 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bonome卵巢癌的生存次优秀 | 510 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| podar对Apaphostin的反应 | 147 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GU PDEF目标 | 71 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindstedt树突状细胞成熟C | 69 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura MAPK8目标DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤课程DN | 210 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Baus TFF2靶向 | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng对H2O2的响应通过ERCC6 UP | 40 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1靶向衰老 | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Alfano MYC目标 | 239 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-130/301 | 499 | 505 | 1a | HSA-MIR-130A脑 | cagugcaauguaaaaggggau |
| HSA-MIR-301 | cagugcaauaugucaaagc | ||||
| HSA-MIR-130b脑 | Cagugcaaugaagggauggau | ||||
| HSA-MIR-454-3P | uagugcaauauugcuuauaggguuu | ||||
| mir-142-3p | 501 | 507 | 1a | HSA-MIR-142-3P | uguaguuuccuacuuuaugga |
| mir-150 | 411 | 418 | 1A，M8 | HSA-MIR-150 | ucucccaacccuuguaccagug |
| MiR-200BC/429 | 368 | 375 | 1A，M8 | HSA-MIR-200B | uaauacugccugguaaugaugac |
| HSA-MIR-200C | uaauacugccggguaaugaugg | ||||
| HSA-MIR-429 | uaauacuguguguguguguaaaaaccgu | ||||
| HSA-MIR-200B | uaauacugccugguaaugaugac | ||||
| HSA-MIR-200C | uaauacugccggguaaugaugg | ||||
| HSA-MIR-429 | uaauacuguguguguguguaaaaaccgu | ||||
| mir-23 | 485 | 491 | M8 | HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc |
| HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc | ||||
| mir-323 | 485 | 491 | 1a | HSA-MIR-323脑 | gcacauuacggucgaccucu |
| mir-342 | 487 | 493 | 1a | HSA-MIR-342脑 | ucucacacagaaaucgcacccccguc |
| mir-369-3p | 370 | 376 | M8 | HSA-MIR-369-3P | aauauacaugguugaucuuu |