概括
基因 6943
象征 TCF21
同义词 POD1 | BHLHA23
描述 转录因子21
参考 MIM:603306|HGNC:HGNC:11632|ENSEMBL:ENSG00000118526|HPRD:04493|Vega:Otthumg0000000015608
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6Q23.2
Pascal P值 0.953
胎儿β 0.406
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG18685594 6 134211217 TCF21 5.21E-8 -0.025 1.37E-5 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003677 DNA结合 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
GO:0030528 转录调节器活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0001658 输尿管芽分支 IEA -
去:0006355 调节转录,DNA依赖性的调节 IEA -
去:0009887 器官形态发生 IEA -
去:0007498 中胚层开发 塔斯 9507058
去:0007548 性别差异 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
RIZ红细胞分化APOBEC2 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TSAI对电离辐射的响应 149 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hatada甲基化在肺癌中 390 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 261 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标DN 366 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 182 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Traynor Rett综合征 45 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bandres对Carmustin Mgmt 48hr DN的响应 161 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染6小时DN 160 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Iwanaga癌变由Kras Pten DN 353 226 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk胚胎生殖细胞 19 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk精子 114 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌Kras DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gyorffy阿霉素耐药性 56 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 549 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
前列腺癌模型DN中的Acevedo FGFR1靶标 308 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因