基因页：TCOF1

概括？
基因 6949
象征 TCOF1
同义词 MFD1 | TCS | TCS1 | treacle
描述 treacle核糖体生物发生因子1
参考 MIM：606847|HGNC：HGNC：11654|ENSEMBL：ENSG00000070814|HPRD：06026|Vega：Otthumg00000130081
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5Q32
Pascal P值 0.993
Sherlock P值 0.439
胎儿β -0.372
DMG 2（＃研究）

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 2
DMG：Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 2
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.0032
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） PSR：0.01718
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） PSR：0.00459

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG08983975 5 149737654 TCOF1 -0.018 0.75 DMG：Nishioka_2013
CG08983975 5 149737654 TCOF1 1.05E-8 -0.008 4.5e-6 DMG：JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Crebzf 0.66 0.63
ZNF211 0.65 0.65
KIAA0907 0.64 0.65
ZNF671 0.64 0.64
Tia1 0.64 0.63
mterfd2 0.64 0.65
Tra2a 0.64 0.63
las1l 0.64 0.61
ZNF548 0.64 0.62
PRPF3 0.63 0.63
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
pth1r -0.49 -0.54
ifi27 -0.48 -0.59
AF347015.31 -0.48 -0.57
FXYD1 -0.48 -0.59
MT-CO2 -0.48 -0.56
AF347015.27 -0.48 -0.57
TSC22D4 -0.47 -0.54
AF347015.33 -0.47 -0.56
higd1b -0.47 -0.59
HLA-F -0.47 -0.50

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005515 蛋白质结合 IPI 17353931
去：0005215 转运蛋白活性 塔斯 9096354
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0001501 骨骼系统开发 塔斯 9096354
去：0006810 运输 IEA -
GO：0042790 核RRNA大RNA聚合酶I转录本的转录 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005634 核 IEA -
去：0005730 核仁 艾达 15249688

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Bertucci髓质与导管乳腺癌 206 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ginestier乳腺癌20Q13扩增DN 180 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Tert目标 380 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 479 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
mantovani病毒GPCR信号传导DN 49 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ferreira Ewings肉瘤不稳定与稳定 167 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标 126 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病初期 390 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王顺铂反应和XPC DN 228 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WELCSH BRCA1靶向DN 141 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bild MYC致癌签名 206 117 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿隆索转移DN 26 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mueller Plurinet 299 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kobayashi EGFR信令24小时DN 251 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
winnepenninckx黑色素瘤转移 162 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄胚胎干细胞核心 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAE BRCA1靶向DN 32 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染4小时DN 254 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Katsanou Elavl1靶向DN 148 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huang GATA2靶向DN 72 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Alfano MYC目标 239 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因