基因页：TCTA
概括？
| 基因 | 6988 |
| 象征 | TCTA |
| 同义词 | - |
| 描述 | T细胞白血病易位改变了 |
| 参考 | MIM：600690|HGNC：HGNC：11692|Ensembl：ENSG00000145022|HPRD：15977|Vega：Otthumg00000156846 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 3P21 |
| Pascal P值 | 0.032 |
| Sherlock P值 | 0.522 |
| 胎儿β | -1.092 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG16951854 | 3 | 49449507 | rhoa; tcta | 9.37e-5 | 0.351 | 0.027 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS10179642 | CHR2 | 9683695 | TCTA | 6988 | 0.14 | 反式 | ||
| RS38153 | CHR7 | 20044600 | TCTA | 6988 | 0.05 | 反式 | ||
| RS17171901 | CHR7 | 41582999 | TCTA | 6988 | 0.02 | 反式 | ||
| RS11232895 | Chr11 | 81555576 | TCTA | 6988 | 0.13 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PPP1R3F | 0.91 | 0.91 |
| SNPH | 0.90 | 0.92 |
| SAPS1 | 0.90 | 0.90 |
| NACC1 | 0.89 | 0.89 |
| CAMTA2 | 0.89 | 0.91 |
| TTC7B | 0.89 | 0.92 |
| Arhgef4 | 0.88 | 0.89 |
| pink1 | 0.88 | 0.88 |
| leng3 | 0.88 | 0.85 |
| tom1l2 | 0.86 | 0.87 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FAM159B | -0.51 | -0.69 |
| C9orf46 | -0.50 | -0.53 |
| RBMX2 | -0.48 | -0.49 |
| C21orf57 | -0.48 | -0.51 |
| snrpg | -0.47 | -0.55 |
| Spink8 | -0.46 | -0.47 |
| RPL13AP22 | -0.46 | -0.62 |
| RPL24 | -0.46 | -0.47 |
| RP9P | -0.45 | -0.51 |
| RPL35A | -0.45 | -0.53 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Horiuchi WTAP靶向 | 306 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| XU HGF靶向Akt1 DN抑制 | 95 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Buytaert光动力疗法应力DN | 637 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 彭亮氨酸剥夺 | 142 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom APC目标DN | 366 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血干细胞 | 254 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染48小时DN | 504 | 323 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 胰岛素耐药性DN处的sartipy正常 | 21 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 道格拉斯BMI1靶向DN | 314 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张TLX目标36hr | 221 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张TLX目标60小时 | 293 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张TLX目标 | 108 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jison Sickle细胞疾病 | 181 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由MYC DN监管 | 253 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |