基因页:PPP1R11
概括?
基因 | 6992 |
象征 | PPP1R11 |
同义词 | cfap255 | hcg-v | hcgv | ipp3 | tcte5 | tctex5 |
描述 | 蛋白质磷酸酶1调节抑制剂亚基11 |
参考 | MIM:606670|HGNC:HGNC:9285|Ensembl:ENSG00000204619|HPRD:09449|Vega:Otthumg0000000031260 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6p21.3 |
Pascal P值 | 5.729E-14 |
Sherlock P值 | 0.649 |
胎儿β | -0.281 |
主持人 | 小脑半球 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.033 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PPP1R11_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 17353931 | |
去:0004864 | 蛋白质磷酸酶抑制剂活性 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005625 | 可溶性部分 | 塔斯 | 9843442 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Odonnell TFRC靶向 | 456 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应 | 134 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dairkee Tert目标 | 380 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
史密斯·泰特(Smith Tert) | 145 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
takao对UVB辐射的响应 | 86 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江缺氧正常 | 311 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
iwanaga癌变由KRAS DN | 120 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LIN NPAS4靶向 | 163 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对Salirasib的反应 | 245 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应很晚 | 317 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Linsley mir16目标 | 206 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vanoevelen肌发生SIN3A靶标 | 220 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-146 | 259 | 265 | 1a | HSA-MIR-146A | ugagaacugaauuccaugggug |
HSA-MIR-146B脑 | ugagaacugaauuccauaggcu | ||||
mir-15/16/195/424/497 | 145 | 152 | 1A,M8 | HSA-MIR-15A脑 | uagcagcacauaugguugug |
HSA-MIR-16脑 | uagcagcacguaaauauuggcg | ||||
HSA-MIR-15B脑 | uagcagcacaucaugguuaca | ||||
HSA-MIR-195SZ | uagcagaaaaauauuggc | ||||
HSA-MIR-424 | Cagcagcaauucauguuuugaa | ||||
HSA-MIR-497 | cagcagcacacuguguuugu | ||||
mir-182 | 267 | 273 | 1a | HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca |
mir-34/449 | 264 | 271 | 1A,M8 | HSA-MIR-34A脑 | uggcaguguuaguguguuuu |
HSA-MIR-34C | Aggcaguguaguagcugauugc | ||||
HSA-MIR-449 | uggcaguguauuguagcuggu | ||||
HSA-MIR-449B | Aggcaguguauuguuagcuggc | ||||
HSA-MIR-34A脑 | uggcaguguuaguguguuuu | ||||
HSA-MIR-34C | Aggcaguguaguagcugauugc | ||||
HSA-MIR-449 | uggcaguguauuguagcuggu | ||||
HSA-MIR-449B | Aggcaguguauuguuagcuggc | ||||
mir-96 | 267 | 273 | 1a | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |