概括
基因 7003
象征 tead1
同义词 AA | NTEF-1 | REF1 | TCF-13 | TCF13 | TEAD-1 | TEF-1
描述 茶域转录因子1
参考 MIM:189967|HGNC:HGNC:11714|ENSEMBL:ENSG00000187079|HPRD:01802|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11P15.2
Pascal P值 0.053
胎儿β 0.674
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG06829681 11 12867453 tead1 5.3e-5 -0.565 0.022 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SFRP4 0.69 0.62
ECM2 0.66 0.73
ABCA4 0.63 0.49
COL8A2 0.62 0.53
SLC5A5 0.61 0.59
SLC13A4 0.60 0.55
Angpt1 0.60 0.56
OLFML1 0.60 0.61
PLBD1 0.59 0.52
SIGLEC1 0.59 0.61
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AC132872.1 -0.27 -0.38
SH2B2 -0.25 -0.23
AC005393.1 -0.25 -0.21
RPL27 -0.24 -0.38
tubb2b -0.24 -0.25
SNHG12 -0.24 -0.34
RPL37 -0.24 -0.40
rps19p3 -0.24 -0.35
RPL23A -0.24 -0.39
carhsp1 -0.24 -0.31

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome Ppara激活基因表达 104 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome YAP1和WWTR1 TAZ刺激基因表达 24 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome通用转录途径 352 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 168 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1靶向 457 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIZ红细胞分化12小时 43 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 TTD DN 84 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sakai肿瘤浸润单核细胞 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
der ifn beta响应 102 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标DN 366 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤MS 48 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染24小时DN 148 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血干细胞 254 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染18小时DN 178 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈里斯脑癌祖细胞 44 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh他莫昔芬抵抗DN 258 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang EGF间隔 105 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因