基因页：terf2
概括？
| 基因 | 7014 |
| 象征 | terf2 |
| 同义词 | trbf2 | trf2 |
| 描述 | 端粒重复结合因子2 |
| 参考 | MIM：602027|HGNC：HGNC：11729|ENSEMBL：ENSG00000132604|HPRD：03610|Vega：Otthumg00000137566 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 16Q22.1 |
| Pascal P值 | 6.613E-4 |
| Sherlock P值 | 0.034 |
| 胎儿β | 0.339 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS36781 | CHR5 | 109289728 | terf2 | 7014 | 0.08 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| GPR124 | 0.66 | 0.70 |
| SLC2A1 | 0.65 | 0.75 |
| BGN | 0.65 | 0.67 |
| mmrn2 | 0.64 | 0.71 |
| FGD5 | 0.64 | 0.71 |
| OLFML2A | 0.63 | 0.71 |
| COL18A1 | 0.63 | 0.65 |
| vwf | 0.62 | 0.69 |
| PLOD1 | 0.61 | 0.68 |
| FOXF2 | 0.61 | 0.68 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AC090186.1 | -0.49 | -0.55 |
| C8orf59 | -0.49 | -0.58 |
| ZBTB8OS | -0.48 | -0.52 |
| RP9P | -0.45 | -0.53 |
| NOX1 | -0.43 | -0.46 |
| MRPS18C | -0.43 | -0.45 |
| ATP5E | -0.42 | -0.54 |
| UQCRB | -0.42 | -0.46 |
| Sycp3 | -0.42 | -0.44 |
| C14ORF156 | -0.41 | -0.44 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| BLM | BS |MGC126616 |MGC131618 |MGC131620 |recq2 |recql2 |RECQL3 | 布卢姆综合症 | - | HPRD，Biogrid | 12181313 |
| BLM | BS |MGC126616 |MGC131618 |MGC131620 |recq2 |recql2 |RECQL3 | 布卢姆综合症 | BLM与TRF2相互作用。 | 绑定 | 12181313 |
| CSNK2B | CK2B |CK2N |CSK2B |g5a |MGC138222 |MGC138224 | 酪蛋白激酶2，β多肽 | CK2-β与TAF7启动子相互作用。 | 绑定 | 15893730 |
| mre11a | atld |HNGS1 |mre11 |mre11b | MRE11减数分裂重组11同源物A（S. cerevisiae） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10888888 |
| NBN | AT-V1 |AT-V2 |ATV |FLJ10155 |MGC87362 |NBS |NBS1 |P95 | nbrin | - | HPRD，Biogrid | 10888888 |
| rad50 | rad50-2 |HRAD50 | Rad50同源物（S. cerevisiae） | - | HPRD，Biogrid | 10888888 |
| sub1 | MGC102747 |P15 |PC4 |P14 | Sub1同源物（S. cerevisiae） | PC4与TAF7启动子相互作用。 | 绑定 | 15893730 |
| terf2 | trbf2 |TRF2 | 端粒重复结合因子2 | - | HPRD | 11545737 |
| terf2ip | 滴水5 |Rap1 | 端粒重复结合因子2，相互作用蛋白 | - | HPRD | 10850490|14565979 |15100233 |
| terf2ip | 滴水5 |Rap1 | 端粒重复结合因子2，相互作用蛋白 | 亲和力捕获ms 亲和力捕获 - 韦斯特恩 两个杂交 |
Biogrid | 10850490|10888888 |15100233 |
| terf2ip | 滴水5 |Rap1 | 端粒重复结合因子2，相互作用蛋白 | HRAP1与TRF2相互作用。 | 绑定 | 15316005 |
| tinf2 | terf2 |tin2 |tin2l | TERF1（TRF1） - 互动核因子2 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 15181449 |
| tinf2 | terf2 |tin2 |tin2l | TERF1（TRF1） - 互动核因子2 | TIN2与TRF2相互作用。 | 绑定 | 15316005 |
| tinf2 | terf2 |tin2 |tin2l | TERF1（TRF1） - 互动核因子2 | - | HPRD | 15292264 |
| WRN | DKFZP686C2056 |recq3 |recql2 |RECQL3 | Werner综合征 | - | HPRD，Biogrid | 12181313 |
| WRN | DKFZP686C2056 |recq3 |recql2 |RECQL3 | Werner综合征 | WRN与TRF2相互作用。 | 绑定 | 12181313 |
| XRCC5 | FLJ39089 |karp-1 |karp1 |ku80 |kub2 |ku86 |nfiv | X射线修复补充中国仓鼠细胞5（双链破裂的重新加入）中的缺陷修复 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 15100233 |
| XRCC6 | CTC75 |CTCBF |G22P1 |ku70 |ML8 |TLAA | X射线修复补充中国仓鼠细胞中有缺陷的修复6 | - | HPRD，Biogrid | 10984620|11112778 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID ATM路径 | 34 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID端粒酶途径 | 68 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome减数分裂 | 116 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组细胞周期 | 421 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome染色体维护 | 122 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Meiotic Synapsis | 73 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 端粒末端的反应组包装 | 48 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome端粒维护 | 75 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan NPM1突变签名1 DN | 126 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan NPM1签名3 DN | 162 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Provenzani转移 | 194 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| riz红细胞分化 | 77 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 XPC向上 | 28 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 UP | 309 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana乳腺癌点燃int网络 | 101 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kauffmann黑色素瘤复发DN | 6 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kauffmann DNA修复基因 | 230 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 彭葡萄糖剥夺DN | 169 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血细胞和祖细胞 | 681 | 420 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan早期分化基因dn | 42 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染1小时DN | 222 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |