基因页:TFAP2C
概括?
基因 | 7022 |
象征 | TFAP2C |
同义词 | ap2-gamma | erf1 | tfap2g | hap-2g |
描述 | 转录因子AP-2伽马(激活增强子结合蛋白2伽马) |
参考 | MIM:601602|HGNC:HGNC:11744|Ensembl:ENSG00000087510|HPRD:03361|Vega:Otthumg0000000032805 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 20q13.2 |
Pascal P值 | 0.424 |
胎儿β | 2.804 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG24581326 | 20 | 55204266 | TFAP2C | 1.37E-5 | -0.597 | 0.014 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TFAP2C_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FKBP8 | 0.87 | 0.87 |
IGSF8 | 0.86 | 0.87 |
SH3BP1 | 0.86 | 0.86 |
PDXP | 0.85 | 0.86 |
P4HTM | 0.85 | 0.87 |
OTUB1 | 0.84 | 0.84 |
ABHD8 | 0.84 | 0.85 |
rundc3a | 0.84 | 0.84 |
rad23a | 0.84 | 0.83 |
PPP1R3F | 0.84 | 0.86 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.18 | -0.46 | -0.17 |
EIF5B | -0.43 | -0.50 |
AF347015.21 | -0.43 | -0.14 |
AC010300.1 | -0.42 | -0.35 |
FAM159B | -0.39 | -0.54 |
NSBP1 | -0.37 | -0.29 |
MT-ATP8 | -0.37 | -0.14 |
AL139819.3 | -0.36 | -0.30 |
AC005921.3 | -0.36 | -0.49 |
AF347015.8 | -0.34 | -0.11 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID TAP63途径 | 54 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
冬季缺氧 | 92 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang LMO4靶向 | 372 | 227 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌早期 | 430 | 232 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jaeger转移DN | 258 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Odonnell TFRC靶向 | 456 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1靶向DN | 459 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Elvidge缺氧DN | 146 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
兰迪斯乳腺癌进展 | 44 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vanharanta子宫肌瘤 | 45 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Landis Erbb2乳腺肿瘤324向上 | 150 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房3 4WK | 214 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房4 5WK | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房5 6WK | 116 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RIZ红细胞分化HBZ | 41 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wood EBV EBNA1靶向 | 110 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlesinger甲基化的癌症 | 88 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
狮子转移 | 539 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发12小时 | 116 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath ES核心九相关 | 100 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌20q12 Q13 Amplicon | 149 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cromer转移 | 79 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEI MYB目标 | 318 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HALMOS CEBPA目标DN | 46 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hedenfalk乳腺癌遗传与零星 | 50 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aprelikova BRCA1目标 | 49 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yamazaki TCEB3靶向DN | 215 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性4 | 307 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Massarweh他莫昔芬抵抗DN | 258 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cheng由雌二醇印记 | 110 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 | 315 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hofmann骨髓发育异常综合症低风险DN | 30 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K27Me3 | 79 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 | 269 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Korkola与POU5F1相关 | 34 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 | 341 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dasu IL6信号向上 | 59 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Winzen通过KHSRP退化 | 100 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Guillaumond KLF10靶向 | 51 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rao由Sall4绑定 | 227 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
巨噬细胞的库马尔病原体负荷 | 275 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kumar自噬网络 | 71 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lim乳腺腔内成熟DN | 99 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 | 516 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang EGF间隔DN | 214 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |