基因页：TFDP1
概括?
| 基因ID | 7027 |
| Symbol | TFDP1 |
| 同义词 | DILC | DP1 | DRTF1 | DP-1 |
| 描述 | 转录因子DP-1 |
| 参考 | MIM:189902|HGNC:HGNC:11749|Ensembl：ENSG00000198176|HPRD:01792|Vega:OTTHUMG00000017388 |
| 基因type | protein-coding |
| 地图位置 | 13Q34 |
| Pascal P值 | 0.465 |
| Sherlock P值 | 0.916 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因set name | 基因组方法 | 描述 | Info |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | Genome-wide Association Study | GWAS | |
| DMG:Wockner_2014 | Genome-wide DNA methylation analysis | This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24). | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
Differentially methylated gene
Differentially methylated gene| 探测 | Chromosome | Position | Nearest gene | P (dis) | beta（dis） | FDR (dis) | Study |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG05516537 | 13 | 114239958 | TFDP1 | 5.286E-4 | 0.573 | 0.048 | DMG:Wockner_2014 |
Section II. Transcriptome annotation
基因ral gene expression (GTEx)
基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)
脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
Top co-expressed genes in brain regions
| Top 10 positively co-expressed genes | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | Spearman's Correlation |
| GOT1 | 0.93 | 0.95 |
| GLS2 | 0.91 | 0.93 |
| Creld1 | 0.91 | 0.91 |
| 阿尔多亚 | 0.91 | 0.88 |
| GBA | 0.91 | 0.92 |
| 纳帕 | 0.90 | 0.91 |
| NPTN | 0.90 | 0.92 |
| TUBG2 | 0.89 | 0.85 |
| RHBDD2 | 0.89 | 0.94 |
| 加布德 | 0.89 | 0.79 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | Spearman's Correlation |
| RBMX2 | -0.52 | -0.53 |
| KIAA1949 | -0.51 | -0.33 |
| TUBB2B | -0.51 | -0.44 |
| FADS2 | -0.50 | -0.39 |
| SH3BP2 | -0.50 | -0.46 |
| GPR125 | -0.50 | -0.43 |
| FAM36A | -0.48 | -0.40 |
| Bcl7c | -0.48 | -0.51 |
| ZNF300 | -0.48 | -0.19 |
| ZNF311 | -0.48 | -0.25 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| Interactors | Aliases B | Official full name B | Experimental | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| CDK3 | - | cyclin-dependent kinase 3 | Affinity Capture-Western | BioGRID | 8846921 |
| E2F1 | E2F-1 | RBAP1 | RBBP3 | RBP3 | E2F转录因子1 | Affinity Capture-Western Reconstituted Complex 两个杂交 |
BioGRID | 7739537|7892279 |8405995|9780002 |
| E2F1 | E2F-1 | RBAP1 | RBBP3 | RBP3 | E2F转录因子1 | E2F1 interacts with DP1. | BIND | 8816798 |
| E2F2 | E2F-2 | E2F转录因子2 | - | HPRD | 7739537|8755520 |
| E2F3 | DKFZp686C18211 | E2F-3 | KIAA0075 | MGC104598 | E2F转录因子3 | - | HPRD | 7739537|8755520 |
| E2F4 | E2F-4 | E2F transcription factor 4, p107/p130-binding | E2F-4interacts with DP-1. | BIND | 7892279 |
| E2F4 | E2F-4 | E2F transcription factor 4, p107/p130-binding | 两个杂交 | BioGRID | 7892279 |
| E2F4 | E2F-4 | E2F transcription factor 4, p107/p130-binding | - | HPRD | 10540350 |
| E2F5 | E2F-5 | p130-binding E2F转录因子5日 | E2F-5与DP-1相互作用。 | BIND | 7892279 |
| E2F5 | E2F-5 | p130-binding E2F转录因子5日 | - | HPRD，Biogrid | 7760804 |
| E2F6 | E2F-6 | MGC111545 | E2F转录因子6 | - | HPRD | 9501179 |
| E2F6 | E2F-6 | MGC111545 | E2F转录因子6 | 两个杂交 | BioGRID | 16189514 |
| NPDC1 | 出租车|驾驶室 - |CAB-1 |CAB1 |DKFZP586J0523 | neural proliferation, differentiation and control, 1 | - | HPRD，Biogrid | 11042687 |
| RB1 | OSRC | RB | p105-Rb | pRb | pp110 | retinoblastoma 1 | Affinity Capture-Western | BioGRID | 7739537 |
| RBL1 | CP107 |MGC40006 |prb1 |P107 | retinoblastoma-like 1 (p107) | Affinity Capture-Western | BioGRID | 7739537 |
| Sertad2 | MGC126688 |MGC126690 |sei-2 |Trip-BR2 | 包含2的serta域 | - | HPRD | 11331592 |
| TP53 | FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 | tumor protein p53 | - | HPRD，Biogrid | 8816502 |
| TP53BP1 | 53BP1 | FLJ41424 | MGC138366 | p202 | 肿瘤蛋白p53结合蛋白1 | Reconstituted Complex | BioGRID | 8896460 |
V.途径注释
| Pathway name | Pathway size | ＃szgr 2.0基因 | Info |
|---|---|---|---|
| KEGG CELL CYCLE | 128 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg tgf beta信号通路 | 86 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta G1途径 | 28 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIOCARTA CELLCYCLE PATHWAY | 23 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIOCARTA SKP2E2F PATHWAY | 10 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIOCARTA RACCYCD PATHWAY | 26 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIOCARTA P27 PATHWAY | 13 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID SMAD2 3NUCLEAR PATHWAY | 82 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID E2F PATHWAY | 74 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID P53下游途径 | 137 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID RB 1 Pathway | 65 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome G0和早期G1 | 25 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME CELL CYCLE | 421 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME PRE NOTCH TRANSCRIPTION AND TRANSLATION | 29 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME PRE NOTCH EXPRESSION AND PROCESSING | 44 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME SMAD2 SMAD3 SMAD4 HETEROTRIMER REGULATES TRANSCRIPTION | 27 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME TRANSCRIPTIONAL ACTIVITY OF SMAD2 SMAD3 SMAD4 HETEROTRIMER | 38 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME GENERIC TRANSCRIPTION PATHWAY | 352 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME CELL CYCLE MITOTIC | 325 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME G1 PHASE | 38 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME G1 S TRANSITION | 112 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME MITOTIC G1 G1 S PHASES | 137 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME SIGNALING BY NOTCH | 103 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME INHIBITION OF REPLICATION INITIATION OF DAMAGED DNA BY RB1 E2F1 | 13 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME E2F MEDIATED REGULATION OF DNA REPLICATION | 35 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组凋亡 | 148 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME G1 S SPECIFIC TRANSCRIPTION | 19 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME SIGNALING BY TGF BETA RECEPTOR COMPLEX | 63 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BH3的反应组激活仅蛋白 | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 凋亡的反应组固有途径 | 30 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Borczuk恶性间皮瘤 | 305 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WANG CLIM2 TARGETS UP | 269 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| VECCHI GASTRIC CANCER EARLY UP | 430 | 232 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SENESE HDAC3 TARGETS DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 斋丁嫩造血干细胞DN | 226 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIDUS METASTASIS UP | 214 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HAHTOLA SEZARY SYNDROM UP | 98 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MARKEY RB1 ACUTE LOF DN | 228 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA UP | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RIZ ERYTHROID DIFFERENTIATION | 77 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RIZ ERYTHROID DIFFERENTIATION CCNE1 | 40 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schlosser MYC靶标和血清反应DN | 47 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LIANG HEMATOPOIESIS STEM CELL NUMBER LARGE VS TINY DN | 45 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA XPRSS INT NETWORK | 168 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC NETWORK | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA2 PCC NETWORK | 423 | 265 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA ATM PCC NETWORK | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA CHEK2 PCC NETWORK | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA CENTERED NETWORK | 117 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LOPEZ MBD TARGETS | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 洛克伍德在肺癌中放大 | 214 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 6HR DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath ES核心九相关 | 100 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肯尼CTNNB1靶向 | 50 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTROEM CORRELATED WITH IL5 DN | 64 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PEART HDAC增殖集群DN | 76 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SASAKI ADULT T CELL LEUKEMIA | 176 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yu Myc的目标 | 42 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vernell视网膜母细胞瘤路径 | 70 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ALCALAY AML BY NPM1 LOCALIZATION DN | 184 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kamminga EZH2目标 | 41 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LEE CALORIE RESTRICTION NEOCORTEX UP | 83 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE DN | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WANG SMARCE1 TARGETS DN | 371 | 218 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| JI对FSH DN的响应 | 58 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BURTON ADIPOGENESIS 3 | 101 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ZHANG ANTIVIRAL RESPONSE TO RIBAVIRIN UP | 30 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE INCIPIENT DN | 165 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张抗病毒对利巴韦林DN的反应 | 51 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SUZUKI RESPONSE TO TSA | 22 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BILD E2F3 ONCOGENIC SIGNATURE | 246 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR DN | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 24HR DN | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MARTINEZ RB1 TARGETS UP | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MARTINEZ RB1 AND TP53 TARGETS DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SARRIO EPITHELIAL MESENCHYMAL TRANSITION UP | 180 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yokoe Cancer testis抗原 | 38 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ACEVEDO LIVER TUMOR VS NORMAL ADJACENT TISSUE UP | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MITSIADES RESPONSE TO APLIDIN DN | 249 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SMID BREAST CANCER BASAL UP | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BLUM RESPONSE TO SALIRASIB DN | 342 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WALLACE JAK2 TARGETS UP | 26 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shedden肺癌的生存率差A6 | 456 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SETLUR PROSTATE CANCER TMPRSS2 ERG FUSION UP | 67 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BRCA1的Pujana乳腺癌突变 | 56 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KOBAYASHI EGFR SIGNALING 24HR DN | 251 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DANG REGULATED BY MYC UP | 72 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MARTENS BOUND BY PML RARA FUSION | 456 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LU EZH2 TARGETS DN | 414 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DUTERTRE ESTRADIOL RESPONSE 24HR UP | 324 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LEE BMP2 TARGETS DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| IKEDA MIR30 TARGETS UP | 116 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 寄养KDM1A靶向DN | 211 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |