基因页:TFF2
概括?
基因 | 7032 |
象征 | TFF2 |
同义词 | sml1 | sp |
描述 | 三叶因子2 |
参考 | MIM:182590|HGNC:HGNC:11756|ENSEMBL:ENSG00000160181|HPRD:01682|Vega:Otthumg00000086797 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 21q22.3 |
Pascal P值 | 0.458 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG18879389 | 21 | 43771120 | TFF2 | 4.45e-5 | -0.435 | 0.021 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TFF2_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CDH5 | 0.81 | 0.80 |
工程 | 0.80 | 0.82 |
Esam | 0.79 | 0.79 |
ROBO4 | 0.79 | 0.79 |
HSPA12B | 0.79 | 0.80 |
NOS3 | 0.78 | 0.77 |
SCARF1 | 0.77 | 0.79 |
Sox17 | 0.77 | 0.77 |
MFSD2 | 0.76 | 0.76 |
LSR | 0.76 | 0.75 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MTIF3 | -0.51 | -0.55 |
VRK2 | -0.47 | -0.53 |
NDUFAF2 | -0.45 | -0.51 |
OXSM | -0.45 | -0.51 |
C8orf59 | -0.43 | -0.51 |
C12orf45 | -0.42 | -0.47 |
Znf32 | -0.41 | -0.46 |
Cryzl1 | -0.41 | -0.45 |
SNHG12 | -0.41 | -0.38 |
MRPS18C | -0.41 | -0.47 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Vecchi胃癌先进与早期DN | 138 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MYC增强的Schlosser血清反应 | 108 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM1 | 229 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
海勒被甲基化沉默 | 282 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rizki肿瘤侵入性3D DN | 270 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yauch刺猬信号传导旁分泌DN | 264 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura MAPK8目标DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 | 211 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 | 281 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ceribelli启动子不活跃,受NFY的约束 | 44 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |