概括
基因 7032
象征 TFF2
同义词 sml1 | sp
描述 三叶因子2
参考 MIM:182590|HGNC:HGNC:11756|ENSEMBL:ENSG00000160181|HPRD:01682|Vega:Otthumg00000086797
基因类型 蛋白质编码
地图位置 21q22.3
Pascal P值 0.458
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG18879389 21 43771120 TFF2 4.45e-5 -0.435 0.021 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CDH5 0.81 0.80
工程 0.80 0.82
Esam 0.79 0.79
ROBO4 0.79 0.79
HSPA12B 0.79 0.80
NOS3 0.78 0.77
SCARF1 0.77 0.79
Sox17 0.77 0.77
MFSD2 0.76 0.76
LSR 0.76 0.75
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MTIF3 -0.51 -0.55
VRK2 -0.47 -0.53
NDUFAF2 -0.45 -0.51
OXSM -0.45 -0.51
C8orf59 -0.43 -0.51
C12orf45 -0.42 -0.47
Znf32 -0.41 -0.46
Cryzl1 -0.41 -0.45
SNHG12 -0.41 -0.38
MRPS18C -0.41 -0.47

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Vecchi胃癌先进与早期DN 138 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MYC增强的Schlosser血清反应 108 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM1 229 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
海勒被甲基化沉默 282 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D DN 270 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yauch刺猬信号传导旁分泌DN 264 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura MAPK8目标DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 211 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ceribelli启动子不活跃,受NFY的约束 44 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因