基因页:TFR2
概括?
基因 | 7036 |
象征 | TFR2 |
同义词 | HFE3 | TFRC2 |
描述 | 转铁蛋白受体2 |
参考 | MIM:604720|HGNC:HGNC:11762|ENSEMBL:ENSG00000106327|HPRD:05282|Vega:Otthumg00000159598 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7q22 |
Pascal P值 | 0.004 |
胎儿β | -0.914 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG19767562 | 7 | 100224437 | TFR2 | 8.85e-5 | -0.428 | 0.027 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TFR2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
rarres3 | 0.74 | 0.71 |
Bbox1 | 0.73 | 0.72 |
Rhoc | 0.73 | 0.66 |
pxmp3 | 0.72 | 0.63 |
PTPMT1 | 0.71 | 0.68 |
斯里 | 0.71 | 0.62 |
CD63 | 0.70 | 0.67 |
MTHFS | 0.70 | 0.71 |
S100A6 | 0.70 | 0.76 |
C5orf35 | 0.69 | 0.65 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
UPF2 | -0.51 | -0.59 |
ZC3H13 | -0.49 | -0.55 |
RTF1 | -0.48 | -0.58 |
tnks1bp1 | -0.48 | -0.53 |
baz1b | -0.47 | -0.56 |
SUPT6H | -0.47 | -0.52 |
TCOF1 | -0.47 | -0.52 |
EIF3A | -0.47 | -0.57 |
gigyf2 | -0.47 | -0.54 |
DDX46 | -0.47 | -0.58 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 16D的Takeda目标 | 175 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoebeke淋巴干细胞DN | 86 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
runx1 runx1t1融合HSC DN的TONKS目标 | 187 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graham CML静止与正常静止 | 87 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graham CML分割与正常静止 | 181 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fab M7类型的Ross Aml | 68 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标DN | 366 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
康(Kang)由tert dn永生 | 102 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
苏肝 | 55 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类增殖DN | 179 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤DN | 267 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝脏发展DN | 222 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染1小时DN | 222 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ohguchi肝HNF4A靶向DN | 149 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHYLA CBFA2T3靶向DN | 242 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |