概括
基因 7040
象征 TGFB1
同义词 CED | DPD1 | LAP | TGFB | TGFBETA
描述 转换生长因子β1
参考 MIM:190180|HGNC:HGNC:11766|ENSEMBL:ENSG00000105329|HPRD:01821|Vega:Otthumg00000182760
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13.1
Pascal P值 0.065
胎儿β -0.566
主持人

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.0382

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CENPM 0.91 0.61
CDC45L 0.90 0.59
MCM5 0.90 0.67
FAM83D 0.89 0.61
AC087645.2 0.89 0.64
PCNA 0.89 0.73
TACC3 0.89 0.63
ASF1B 0.88 0.62
PLK1 0.88 0.65
FAM64A 0.88 0.63
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.39 -0.59
AF347015.27 -0.39 -0.61
MT-CO2 -0.38 -0.60
C5orf53 -0.38 -0.44
AF347015.33 -0.38 -0.61
AF347015.8 -0.38 -0.62
AF347015.15 -0.38 -0.62
mt-cyb -0.37 -0.60
AIFM3 -0.37 -0.46
AF347015.2 -0.36 -0.61

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005114 II型转化生长因子β受体结合 艾达 11157754
去:0005515 蛋白质结合 ISS -
去:0008083 生长因子活性 IEA -
GO:0016563 转录激活剂活性 ISS -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0043011 髓样树枝状细胞分化 IEA 树突(GO期限:10) -
去:0001501 骨骼系统开发 ISS -
去:0002248 炎症反应期间结缔组织置换 塔斯 9639571
去:0002513 对自抗原的耐受性诱导 IEA -
去:0001837 上皮到间质转变 塔斯 14679171
去:0007184 SMAD蛋白核易位 艾达 15334054
去:0006468 蛋白氨基酸磷酸化 ISS -
去:0008219 细胞死亡 ISS -
去:0006917 诱导凋亡 艾达 15334054
去:0009887 器官形态发生 ISS -
去:0007050 细胞周期停滞 艾达 14555988
去:0008284 细胞增殖的阳性调节 ISS -
去:0008354 生殖细胞迁移 IEA -
去:0007435 唾液腺形态发生 IEP 18080134
GO:0016202 条纹肌肉发育的调节 ISS -
去:0006796 磷酸盐代谢过程 艾达 10513816
去:0006754 ATP生物合成过程 艾达 10513816
去:0006954 炎症反应 ISS -
GO:0017015 调节转化生长因子β受体信号通路 艾达 15334054
GO:0019049 病毒逃避宿主防御 艾达 15334054
去:0042306 调节蛋白质进口到核中 ISS -
GO:0016481 转录的负调节 艾达 15702480
GO:0051101 DNA结合的调节 ISS -
去:0042130 T细胞增殖的负调控 IEA -
去:0030501 骨矿化的阳性调节 IEP 17401695
GO:0048298 同种型切换到IgA同种型的正调控 艾达 14988498
GO:0030879 乳腺发育 IEA -
GO:0032740 白介素17生产的阳性调节 艾达 18453574
GO:0031575 G1/s过渡检查点 艾达 15334054
GO:0030279 骨化负调节 IEA -
GO:0032943 单核细胞增殖 IEA -
GO:0032967 胶原生物合成过程的阳性调节 塔斯 9639571
去:0030308 细胞生长的负调控 艾达 15334054
GO:0035307 蛋白氨基酸去磷酸化的阳性调节 艾达 14555988
去:0043029 T细胞稳态 IEA -
GO:0045893 转录,DNA依赖性的阳性调节 ISS -
去:0045930 有丝分裂细胞周期的负调控 艾达 14555988
GO:0050680 上皮细胞增殖的负调节 小鬼 16943770
去:0045066 调节性T细胞分化 IEA -
GO:0043932 骨骼重塑涉及的骨化 IEP 17401695
GO:0048535 淋巴结发展 ISS -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005796 高尔基管 经验 3457014|9934696
去:0005576 细胞外区域 经验 9865696|9934696|11100470
去:0005576 细胞外区域 IEA -
去:0005578 蛋白质细胞外基质 ISS -
去:0005615 细胞外空间 ISS -
去:0005634 艾达 18040277
去:0005737 细胞质 艾达 18040277
GO:0031093 血小板α颗粒管腔 经验 3457014

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
ACVRL1 ACVRLK1 |ALK-1 |ALK1 |HHT |HHT2 |orw2 |Skr3 |tsr-i 激活素A型II型1 - HPRD,Biogrid 10716993
应用程序 AAA |Abeta |abpp |AD1 |appi |ctfgamma |CVAP |PN2 淀粉样β(A4)前体蛋白 TGF-BETA-1与淀粉样蛋白β相互作用。这种相互作用是在未指定物种和淀粉样蛋白β肽的TGF-BETA-1之间的相互作用上建模的。 绑定 12867422
BGN DSPG1 |PG-S1 |PGI |slr1a 大扫描 - HPRD,Biogrid 8093006|10383378
BMP2 BMP2A 骨形态发生蛋白2 - HPRD 11456401
Bmp3 BMP-3A 骨形态发生蛋白3 - HPRD 9434787
CCL3 G0S19-1 |ld78alpha |MIP-1-Alpha |MIP1A |Scya3 趋化因子(C-C基序)配体3 - HPRD 8568261
COL2A1 anfh |AOM |col11a3 |MGC131516 |SEDC 胶原蛋白,II型,Alpha 1 - HPRD,Biogrid 10085302
CTGF CCN2 |HCS24 |IGFBP8 |MGC102839 |诺维2 结缔组织生长因子 - HPRD,Biogrid 10457363
daxx Bing2 |DAP6 |EAP1 |MGC126245 |MGC126246 死亡域相关蛋白 - HPRD 11483955
DCN CSCD |DSPG2 |PG40 |PGII |PGS2 |slrr1b 装饰 - HPRD 7638106|7798269
DCN CSCD |DSPG2 |PG40 |PGII |PGS2 |slrr1b 装饰 重构的复合物 Biogrid 7798269|8093006
|9675033
EIF3I EIF3S2 |Pro2242 |Trip-1 |Trip1 |eif3-beta |EIF3-P36 真核翻译引发因子3,亚基I - HPRD,Biogrid 9813058
工程 CD105 |结束|FLJ41744 |HHT1 |ORW |ORW1 内聚物 - HPRD 12015308
FCN1 FCNM 纤维蛋白(胶原蛋白/纤维蛋白原结构域)1 - HPRD,Biogrid 7686157
fmod slrr2e 纤维蛋白 - HPRD,Biogrid 8093006
fnta fpta |MGC99680 |pggt1a |PTAR2 Farnesylsylansferase,Caax盒,Alpha - HPRD,Biogrid 8599089
itgav CD51 |DKFZP686A08142 |MSK8 |vnra 整联蛋白,αV(玻璃原蛋白受体,α多肽,抗原CD51) - HPRD 11970960
ITGB6 - 整合素,beta 6 - HPRD 10025398
ITGB8 - 整合素,Beta 8 - HPRD 11970960
LTBP1 MGC163161 潜在转化生长因子β结合蛋白1 - HPRD,Biogrid 8617200|10930463
LTBP3 DKFZP586M2123 |FLJ33431 |FLJ39893 |FLJ42533 |FLJ44138 |LTBP-3 |LTBP2 |PP6425 潜在转化生长因子β结合蛋白3 - HPRD 12062452
LTBP4 FLJ46318 |FLJ90018 |LTBP-4 |LTBP-4L 潜在转化生长因子β结合蛋白4 - HPRD 9660815
MMP2 Clg4 |Clg4a |MMP-II |蒙娜|TBE-1 基质金属肽酶2(明胶酶A,72KDA明胶酶,72KDA IV型胶原酶) - HPRD,Biogrid 10652271
MMP9 clg4b |凝胶|MMP-9 基质金属肽酶9(明胶酶B,92KDA明胶酶,92KDA IV型胶原酶) 生化活动 Biogrid 10652271
PZP CPAMD6 |MGC133093 怀孕区蛋白 - HPRD,Biogrid 7513640
SNIP1 FLJ12553 |RP3-423B22.3 |DJ423B22.2 SMAD核相互作用蛋白1 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 10887155
Sparc 分泌的蛋白质,酸性,富含半胱氨酸的蛋白质(骨蛋白) - HPRD 15034927
TGFB1 CED |DPD1 |TGFB |TGFBETA 转化生长因子,β1 - HPRD 7935686
TGFB2 MGC116892 |TGF-BETA2 转化生长因子,beta 2 两个杂交 Biogrid 11483955
TGFB2 MGC116892 |TGF-BETA2 转化生长因子,beta 2 - HPRD 11157754
TGFBR1 AAT5 |ACVRLK4 |ALK-5 |Alk5 |LDS1A |LDS2A |SKR4 |TGFR-1 转化生长因子,β受体1 TGF-BETA-1与TGF-BETA-R-I相互作用。这种相互作用是基于未指定物种与人类TGF-beta-R-I的TGF-BETA-1之间的相互作用进行建模的。 绑定 7852346
TGFBR1 AAT5 |ACVRLK4 |ALK-5 |Alk5 |LDS1A |LDS2A |SKR4 |TGFR-1 转化生长因子,β受体1 - HPRD,Biogrid 8235612
TGFBR2 AAT3 |FAA3 |LDS1B |LDS2B |MFS2 |riic |taad2 |TGFR-2 |TGFBETA-RII 转化生长因子,β受体II(70/80KDA) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11157754
TGFBR2 AAT3 |FAA3 |LDS1B |LDS2B |MFS2 |riic |taad2 |TGFR-2 |TGFBETA-RII 转化生长因子,β受体II(70/80KDA) - HPRD 7935686
TGFBR2 AAT3 |FAA3 |LDS1B |LDS2B |MFS2 |riic |taad2 |TGFR-2 |TGFBETA-RII 转化生长因子,β受体II(70/80KDA) TGF-BETA-1与TGF-BETA-R-II相互作用。这种相互作用是基于未指定物种与人类TGF-beta-R-II的TGF-BETA-1之间的相互作用进行建模的。 绑定 7852346
TGFBR3 BGCAN |βlycan 转化生长因子,β受体III - HPRD 7935686
TGFBR3 BGCAN |βlycan 转化生长因子,β受体III 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 8106553
TGFBRAP1 陷阱-1 |陷阱1 转化生长因子,β受体相关蛋白1 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11278302
THBS1 thbs |TSP |TSP1 血小板传播1 - HPRD,Biogrid 1550960
瓦斯 slitl2 血管素 - HPRD,Biogrid 15247411
VTN V75 |vn |vnt 玻霉素 - HPRD,Biogrid 11796824
是的 14-3-3e |FLJ45465 |KCIP-1 |MDCR |MDS 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白,epsilon多肽 - HPRD,Biogrid 11172812


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg mapk信号通路 267 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 267 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg细胞周期 128 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg tgf beta信号通路 86 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IGA生产的KEGG肠道免疫网络 48 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg Leishmania感染 72 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
癌症中的KEGG途径 328 259 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG结直肠癌 62 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG肾细胞癌 70 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg胰腺癌 70 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG慢性髓细胞性白血病 73 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG肥厚性心肌病HCM 85 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG扩张心肌病 92 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta ALK途径 37 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta G1途径 28 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta CTCF途径 23 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta fordam途径 29 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta生物途径 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta MAPK途径 87 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta P38MAPK途径 40 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta TOB1途径 21 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta NKT途径 29 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta IL1R途径 33 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta TGFB途径 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SA MMP细胞因子连接 15 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Glypican 1 Pathway 27 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL27途径 26 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID端粒酶途径 68 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID RXR VDR途径 26 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AP1途径 70 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid upa upar途径 42 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ALK1途径 26 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Syndecan 1途径 46 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Syndecan 2途径 33 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TGFBR途径 55 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL12 STAT4途径 33 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome TGFβ受体信号在EMT上皮向间充质转变中 16 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TGFβ受体信号的反应组下调 23 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome TGF Beta受体信号传导激活SMADS 26 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对血小板胞质CA2升高的反应组反应 89 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
白色脂肪细胞分化的Reactome转录调节 72 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TGFβ受体复合物的反应组信号传导 63 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome血小板激活信号传导和聚集 208 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Borczuk恶性间皮瘤 305 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov在癌症中循环内皮细胞 158 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌 404 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chiaradonna肿瘤转化克拉斯 126 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2A DN 141 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Baris甲状腺癌DN 59 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Streicher LSM1靶向DN 19 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TGFB1通过smad4 up tgfb1的ramjaun凋亡 7 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Breuhahn生长因子信号传导肝癌 22 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Khetchoumian Trim24靶向 47 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
galie肿瘤血管生成 8 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath MYC带Ebox的目标 230 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shin B细胞淋巴瘤簇3 28 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标1向上 140 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
羔羊CCND1靶标 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Peng Leucine剥夺DN 187 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tenedini Megakaryocyte标记 66 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
费尔南德斯(Fernandez)由迈克(Myc)约束 182 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
宁慢性阻塞性肺疾病 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭谷氨酰胺剥夺DN 337 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标DN 366 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nemeth炎症反应LPS 88 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
康(Kang)因tert而永生 89 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 225 163 该途径中的所有SZGR 2.0基因
亚伯拉罕ALPC与多发性骨髓瘤DN 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Xu Crebbp目标DN 44 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU HBX目标2 DN 16 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU HBX目标1 DN 23 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈里斯缺氧 81 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
村上紫外线响应6小时DN 21 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室 249 170 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chiba对TSA的反应 52 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard对紫外线nhek的反应 244 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU HBX目标3 DN 13 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莫雷拉对TSA的反应 28 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
村上紫外线24小时 20 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向 280 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin PDE3B目标 22 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Marzec IL2发出信号 115 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
POS组胺反应网络 32 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gautschi SRC信号传导 8 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaurnier PSMD4目标 73 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk中央女性生育 29 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk精子 114 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Labbe Wnt3a靶向 112 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Qi Plasmacytoma Up 259 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
冬季缺氧metagene 242 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV感染血管生成标记 165 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV感染血管生成标记DN 138 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GU PDEF目标 71 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoffmann小型BII至未成熟B淋巴细胞DN 50 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼不成熟到成熟的B淋巴细胞DN 50 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen去分化状态DN 7 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jison Sickle细胞疾病DN 181 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
woo肝癌复发 105 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 349 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC DN监管 253 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dang myc针对DN 31 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 210 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dasu IL6信号向上 59 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KANG AR目标DN 19 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标2 UP 140 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kasler HDAC7靶向1个 194 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SPI1和FLI1 DN的Juban目标 92 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1靶向10小时 199 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA分泌因素 344 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因