Gene Page:TGFB3

概括?
基因 7043
Symbol TGFB3
Synonyms arvd | arvd1 | lds5 | rnhf | tgf-beta33
Description transforming growth factor beta 3
Reference MIM:190230|HGNC:HGNC:11769|HPRD:01829|
Gene type protein-coding
Map location 14q24
Pascal p-value 0.029
Sherlock p-value 0.012
Fetal beta -0.158
eGene Myers' cis & trans

数据源中的基因
Gene set name Method of gene set Description Info
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@eQTL annotation

SNP ID Chromosome Position eGene Gene Entrez ID pvalue qvalue TSS distance eQTL type
RS10758680 chr9 5328914 TGFB3 7043 0.17 trans
rs1885497 chr9 5336506 TGFB3 7043 0.17 trans
rs2078397 chr10 43291860 TGFB3 7043 0.2 trans
rs1661709 chr17 73573032 TGFB3 7043 0.2 trans

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
死神:胎儿(13 - 26页ostconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
NOB1 0.92 0.90
G6PD 0.92 0.92
EEF2 0.92 0.86
DHPS 0.91 0.87
YIPF3 0.91 0.89
PRMT1 0.91 0.87
RBM4 0.91 0.86
ARMC6 0.91 0.88
HMGA1 0.91 0.84
var 0.91 0.93
Top 10 negatively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
AF347015.31 -0.70 -0.81
AF347015.27 -0.69 -0.82
MT-CO2 -0.69 -0.81
AF347015.8 -0.68 -0.81
AF347015.33 -0.67 -0.79
MT-CYB -0.66 -0.79
AF347015.21 -0.66 -0.83
C5orf53 -0.64 -0.68
AF347015.15 -0.63 -0.78
AF347015.2 -0.63 -0.80

Section V. Pathway annotation

Pathway name Pathway size # SZGR 2.0 genes in pathway Info
KEGG MAPK SIGNALING PATHWAY 267 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG CYTOKINE CYTOKINE RECEPTOR INTERACTION 267 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG CELL CYCLE 128 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG TGF BETA SIGNALING PATHWAY 86 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG LEISHMANIA INFECTION 72 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG PATHWAYS IN CANCER 328 259 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG COLORECTAL CANCER 62 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG RENAL CELL CARCINOMA 70 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG PANCREATIC CANCER 70 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG CHRONIC MYELOID LEUKEMIA 73 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG HYPERTROPHIC CARDIOMYOPATHY HCM 85 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG DILATED CARDIOMYOPATHY 92 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA ALK PATHWAY 37 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA G1 PATHWAY 28 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA CTCF PATHWAY 23 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA INFLAM通路 29 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA ERYTH PATHWAY 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA MAPK PATHWAY 87 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA P38MAPK PATHWAY 40 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA TOB1 PATHWAY 21 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta NKT途径 29 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA IL1R PATHWAY 33 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA TGFB PATHWAY 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID GLYPICAN 1PATHWAY 27 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ALK1 PATHWAY 26 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TGFBR PATHWAY 55 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME RESPONSE TO ELEVATED PLATELET CYTOSOLIC CA2 89 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME HEMOSTASIS 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PLATELET ACTIVATION SIGNALING AND AGGREGATION 208 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PARENT MTOR SIGNALING DN 46 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU PROSTATE CANCER DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS BASAL UP 380 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHEBOTAEV GR TARGETS UP 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN UP 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN RESPONSE TO MC AND DOXORUBICIN UP 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAUSSMANN MLL AF4 FUSION TARGETS F UP 185 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL BREAST 3 4WK UP 214 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL BREAST 4 5WK UP 271 175 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARMER BREAST CANCER BASAL VS LULMINAL 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SASAI RESISTANCE TO NEOPLASTIC TRANSFROMATION 50 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHETH LIVER CANCER VS TXNIP LOSS PAM4 261 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FERREIRA EWINGS SARCOMA UNSTABLE VS STABLE UP 167 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CAFFAREL RESPONSE TO THC UP 33 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CAFFAREL RESPONSE TO THC 24HR 5 DN 59 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 48HR DN 428 306 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOTZMANN EPITHELIAL TO MESENCHYMAL TRANSITION UP 69 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH MYC TARGETS WITH EBOX 230 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHANG POU5F1 TARGETS UP 15 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TARTE PLASMA CELL VS PLASMABLAST UP 398 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
POMEROY MEDULLOBLASTOMA DESMOPLASIC VS CLASSIC UP 62 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FRASOR RESPONSE TO ESTRADIOL DN 82 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JECHLINGER EPITHELIAL TO MESENCHYMAL TRANSITION DN 66 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FERNANDEZ BOUND BY MYC 182 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH HEMATOPOIESIS STEM CELL QTL TRANS 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌转移 56 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Magrangeas多发性骨髓瘤Igll vs Iglk 42 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MUNSHI MULTIPLE MYELOMA UP 81 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HARRIS HYPOXIA 81 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YIH RESPONSE TO ARSENITE C2 18 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21 TARGETS 2 UP 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS PEAK AT 0HR 63 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SEMENZA HIF1 TARGETS 36 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
转移期间的clasper淋巴管 20 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HILLION HMGA1 TARGETS 90 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KYNG DNA DAMAGE BY 4NQO OR UV 63 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KYNG DNA DAMAGE DN 195 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEST ADRENOCORTICAL TUMOR DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
THUM MIR21 TARGETS HEART DISEASE UP 17 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WINTER HYPOXIA METAGENE 242 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV INFECTION ANGIOGENIC MARKERS UP 165 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MIZUKAMI HYPOXIA UP 12 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG TLX TARGETS 36HR UP 221 150 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG TLX TARGETS 60HR UP 293 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG TLX TARGETS UP 108 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHEN METABOLIC SYNDROM NETWORK 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MIKKELSEN IPS ICP WITH H3K4ME3 AND H327ME3 126 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VANTVEER BREAST CANCER POOR PROGNOSIS 55 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG BOUND BY MYC 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP带有H3K4ME3和H3K27ME3 137 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MIKKELSEN NPC ICP WITH H3K4ME3 445 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VERHAAK GLIOBLASTOMA CLASSICAL 162 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时DN 91 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KANG AR TARGETS UP 17 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOBERT OLIGODENDROCYTE DIFFERENTIATION DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SERVITJA ISLET HNF1A TARGETS UP 163 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YANG BCL3 TARGETS UP 364 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rarg Bound MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix RAR目标 48 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA SECRETED FACTORS 344 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA MATRISOME ASSOCIATED 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA MATRISOME 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因