Gene Page:TGFBR3

概括?
GeneID 7049
Symbol TGFBR3
Synonyms BGCAN|betaglycan
Description transforming growth factor beta receptor III
参考 MIM:600742|HGNC:HGNC:11774|Ensembl：ENSG0000000069702|HPRD:02846|
Gene type protein-coding
Map location 1p33-p32
Pascal p-value 0.268
Sherlock P值 0.881
Fetal beta -1.668
DMG 1（＃研究）
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别
Support Ascano FMRP targets

数据源中的基因
基因集名称 Method of gene set Description Info
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS
DMG:vanEijk_2014 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 432 differentially methylated CpG sites corresponding to 391 unique transcripts between schizophrenia patients (n=260) and unaffected controls (n=250). 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@Differentially methylated gene

Probe Chromosome Position Nearest gene P (dis) Beta (dis) FDR (dis) Study
cg00563926 1 92352481 TGFBR3 0.007 6.491 DMG:vanEijk_2014

@eQTL annotation

SNP ID Chromosome Position eGene Gene Entrez ID pvalue qvalue TSS distance eQTL type
RS1691463 chr3 84914366 TGFBR3 7049 0.13 trans
rs394185 chr3 84959076 TGFBR3 7049 0.09 trans
RS8079075 chr17 38010814 TGFBR3 7049 0.1 trans

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
GLRA1 0.62 0.30
GPR151 0.58 0.40
CBLN4 0.57 0.59
SCN7A 0.56 0.52
CAMK2D 0.54 0.72
DIRAS3 0.54 0.43
TMTC1 0.53 0.68
DNER 0.53 0.53
EMB 0.53 0.50
DKK4 0.53 0.10
Top 10 negatively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
AF347015.21 -0.27 -0.33
CSAG1 -0.27 -0.36
AF347015.2 -0.25 -0.26
HIGD1B -0.25 -0.34
SAT1 -0.24 -0.36
CXCL14 -0.24 -0.24
EIF4EBP3 -0.24 -0.32
IL32 -0.24 -0.34
FXYD1 -0.24 -0.30
CBR3 -0.24 -0.30

V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
BIOCARTA ALK PATHWAY 37 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA CTCF PATHWAY 23 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA TOB1 PATHWAY 21 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TGFBR PATHWAY 55 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU PROSTATE CANCER DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHEMNITZ RESPONSE TO PROSTAGLANDIN E2 DN 391 222 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENGUPTA NASOPHARYNGEAL CARCINOMA WITH LMP1 DN 175 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUIFFE INVASION INHIBITED BY ASCITES DN 145 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huttmann B Cll生存不佳 276 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DEURIG T CELL PROLYMPHOCYTIC LEUKEMIA DN 320 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KINSEY TARGETS OF EWSR1 FLII FUSION DN 329 219 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JAATINEN HEMATOPOIETIC STEM CELL DN 226 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA POORLY DIFFERENTIATED DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE EPIDERMIS DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌DN 232 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Naderi乳腺癌预后DN 18 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 XPCS DN 88 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HERNANDEZ ABERRANT MITOSIS BY DOCETACEL 2NM UP 81 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
埃尔南德斯有丝分裂逮捕Docetaxel 2 DN 19 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI WILMS TUMOR VS FETAL KIDNEY 2 DN 51 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TSAI对电离辐射的响应 149 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU NASOPHARYNGEAL CARCINOMA 70 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 2 UP 256 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOFMANN CELL LYMPHOMA DN 39 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG IMMORTALIZED BY HOXA9 AND MEIS1 UP 31 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KANG IMMORTALIZED BY TERT DN 102 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO HOXA10 TARGETS VIA PROGESTERONE DN 19 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NATSUME RESPONSE TO INTERFERON BETA UP 71 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
布莱洛克ALZHEIMERS DISEASE INCIPIENT UP 390 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KAAB FAILED HEART ATRIUM DN 141 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周TNF信号4人力资源 54 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 16HR DN 86 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KAAB HEART ATRIUM VS VENTRICLE UP 249 170 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21 TARGETS 2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 20HR DN 101 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MAHAJAN RESPONSE TO IL1A DN 76 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
布莱洛克ALZHEIMERS DISEASE UP 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS 2 72 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHU CMV 8 HR DN 53 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV 24小时DN 91 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE AGING CEREBELLUM UP 84 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHU CMV ALL DN 128 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAELDE DIABETIC NEPHROPATHY DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KYNG RESPONSE TO H2O2 71 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P3 160 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIGGINS TAMOXIFEN RESISTANCE UP 66 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 TARGETS UP 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ TP53 TARGETS UP 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 AND TP53 TARGETS UP 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SARRIO EPITHELIAL MESENCHYMAL TRANSITION DN 154 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIZKI TUMOR INVASIVENESS 2D UP 69 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIGGI EWING SARCOMA PROGENITOR DN 191 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER NORMAL LIKE UP 476 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRADE COLON AND RECTAL CANCER DN 101 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOQUEST STEM CELL CULTURED VS FRESH UP 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG TUMOR INVASIVENESS DN 210 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TSAI RESPONSE TO RADIATION THERAPY 32 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU SILENCED BY METHYLATION IN BLADDER CANCER 55 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOFFMANN SMALL PRE BII TO IMMATURE B LYMPHOCYTE DN 50 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOFFMANN IMMATURE TO MATURE B LYMPHOCYTE UP 43 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONO FOXP3 TARGETS DN 42 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOSHIDA LIVER CANCER SUBCLASS S3 266 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 8 49 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村掺杂早期 66 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAMURA ADIPOGENESIS LATE UP 104 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PILON KLF1 TARGETS UP 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUINS UVC RESPONSE VIA TP53 GROUP D 280 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHU SKIL TARGETS DN 9 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TORCHIA TARGETS OF EWSR1 FLI1 FUSION DN 321 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WINZEN DEGRADED VIA KHSRP 100 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOBERT OLIGODENDROCYTE DIFFERENTIATION DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KATSANOU ELAVL1 TARGETS DN 148 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YANG BCL3 TARGETS UP 364 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1目标10小时DN 244 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG MLL TARGETS 289 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FORTSCHEGGER PHF8 TARGETS DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIM MAMMARY STEM CELL UP 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIM MAMMARY LUMINAL MATURE DN 99 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG TRANSIENTLY UP BY 1ST EGF PULSE ONLY 1839 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因