Summary
基因ID 7056
Symbol thbd
同义词 Ahus6 | BDCA3 | CD141 | THPH12 | THRM | TM
描述 血栓形成蛋白
参考 MIM:188040|HGNC:HGNC:11784|Ensembl:ENSG00000178726|HPRD:01764|Vega:Otthumg00000032053
基因类型 蛋白质编码
地图位置 20p11.2
Pascal P值 0.774
胎儿β -0.257
DMG 2(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Montano_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括CPG与精神分裂症之间的172个复制关联。 2
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 2

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG17368760 20 23029287 thbd 2.68E-4 -0.007 0.173 DMG:Montano_2016
CG24562819 20 23029806 thbd -0.027 0.77 DMG:Nishioka_2013

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17627020 CHR5 54167839 thbd 7056 0.14 反式
rs12344698 Chr9 16750142 thbd 7056 0.03 反式
RS17342483 Chrx 102250155 thbd 7056 0.15 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SLC4A4 0.86 0.79
kat2b 0.85 0.78
ADD3 0.85 0.85
SLC1A2 0.85 0.78
TGFBR3 0.84 0.84
ranbp3l 0.84 0.77
aldh6a1 0.83 0.74
gramd3 0.83 0.77
PMP2 0.83 0.76
cybrd1 0.83 0.81
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Med19 -0.47 -0.52
RP9 -0.45 -0.54
AC011491.1 -0.44 -0.51
ZNF821 -0.44 -0.45
ZNF428 -0.44 -0.48
NR2C2AP -0.44 -0.49
PBX4 -0.44 -0.45
PTMS -0.44 -0.55
NOL12 -0.44 -0.46
DUSP12 -0.43 -0.44

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg补充和凝结级联 69 49 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID FRA路径 37 28 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组细胞表面相互作用在血管壁 91 65 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME COMMON PATHWAY 14 10 All SZGR 2.0 genes in this pathway
纤维蛋白凝块凝结级联反应组的形成 32 22 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组止血 466 331 All SZGR 2.0 genes in this pathway
加兹达钻石黑芬贫血髓样骨髓 30 19 All SZGR 2.0 genes in this pathway
威尔科克斯对孕酮的反应 152 90 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Basaki YBX1靶向DN 384 230 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Smirnov在癌症中循环内皮细胞 158 103 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Jaeger转移DN 258 141 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌DN 77 52 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ENK UV响应表皮DN 508 354 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LANDIS BREAST CANCER PROGRESSION DN 70 43 All SZGR 2.0 genes in this pathway
林格伦膀胱癌CLUSTER 1 DN 378 231 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Landis Erbb2乳腺肿瘤324 DN 149 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 All SZGR 2.0 genes in this pathway
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Olsson E2F3靶向DN 49 33 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lindgren膀胱癌簇2B 392 251 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hernandez异常有丝分裂由DOCETACEL 2NM上升 81 57 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Simbulan UV响应永生的DN 31 26 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schlesinger甲基化的癌症 88 64 All SZGR 2.0 genes in this pathway
通过ELK3 DN的缺氧总缺氧 156 106 All SZGR 2.0 genes in this pathway
仅通过ELK3的高缺氧 33 18 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ingram SHH目标 127 79 All SZGR 2.0 genes in this pathway
buytaert光动力疗法压力 811 508 All SZGR 2.0 genes in this pathway
洛佩兹MBD目标 957 597 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath Suz12目标 1038 678 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath EED目标 1062 725 All SZGR 2.0 genes in this pathway
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath PRC2目标 652 441 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Onder CDH1目标2 DN 464 276 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yao Hoxa10通过孕酮靶向 79 58 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Tavor Cebpa靶向DN 30 21 All SZGR 2.0 genes in this pathway
liang被甲基化2沉默2 53 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ingram SHH目标 7 5 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CUI TCF21目标2 DN 830 547 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Delaserna Myod目标DN 57 42 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yamazaki TCEB3靶向 175 116 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kuninger IGF1 vs PDGFB目标DN 46 28 All SZGR 2.0 genes in this pathway
dazard对UV SCC DN的响应 123 86 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee Calorie限制肌肉 43 33 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gerhold脂肪形成DN 64 44 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PAL PRMT5靶向DN 29 16 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chen ETV5靶向Sertoli 20 10 All SZGR 2.0 genes in this pathway
TSENG IRS1 TARGETS DN 135 88 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ABE VEGFA目标 20 15 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伯顿成生成1 33 24 All SZGR 2.0 genes in this pathway
TSENG ADIPOGENIC POTENTIAL DN 46 28 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染6小时DN 160 101 All SZGR 2.0 genes in this pathway
华莱士前列腺癌竞赛 299 167 All SZGR 2.0 genes in this pathway
恩格曼癌祖细胞 48 31 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SMID BREAST CANCER NORMAL LIKE UP 476 285 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zheng IL22发出信号 56 36 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boquest干细胞DN 216 143 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bredemeyer抹布通过ATM而不是通过NFKB向上发出信号 49 32 All SZGR 2.0 genes in this pathway
公园维甲酸的反应 12 8 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS UP 1305 895 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schraets MLL靶向DN 33 24 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甜肺癌Kras DN 435 289 All SZGR 2.0 genes in this pathway
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 356 214 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 536 296 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 All SZGR 2.0 genes in this pathway
米利假足型haptotaxis dn 668 419 All SZGR 2.0 genes in this pathway
突变的TP53的Stambolsky靶标 49 35 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Verhaak胶质母细胞瘤间充质 216 130 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chicas RB1靶向衰老 572 352 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Johnstone Parvb目标3 430 288 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 549 316 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee BMP2目标 745 475 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KOINUMA TARGETS OF SMAD2 OR SMAD3 824 528 All SZGR 2.0 genes in this pathway
杨Bcl3靶向 364 236 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PLASARI TGFB1 TARGETS 10HR DN 244 157 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang MLL目标 289 188 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Holleman daunorubicin B全部 10 9 All SZGR 2.0 genes in this pathway