基因页:THBS4
概括?
基因 | 7060 |
象征 | THBS4 |
同义词 | TSP-4 | TSP4 |
描述 | 血小板传播4 |
参考 | MIM:600715|HGNC:HGNC:11788|Ensembl:ENSG00000113296|HPRD:02836|Vega:Otthumg00000108173 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 5Q13 |
Pascal P值 | 0.414 |
Sherlock P值 | 0.061 |
胎儿β | -2.831 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/THBS4_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AZGP1 | 0.70 | 0.73 |
hhatl | 0.69 | 0.78 |
gyg1 | 0.68 | 0.71 |
TMBIM1 | 0.67 | 0.73 |
皮尔 | 0.66 | 0.72 |
apod | 0.65 | 0.78 |
CSRP1 | 0.64 | 0.74 |
CBR1 | 0.64 | 0.72 |
我的天啊 | 0.64 | 0.73 |
FHL5 | 0.64 | 0.71 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
nkiras2 | -0.48 | -0.65 |
PKN1 | -0.46 | -0.67 |
CRMP1 | -0.46 | -0.62 |
FGD1 | -0.46 | -0.62 |
C17orf70 | -0.46 | -0.63 |
KIAA1949 | -0.46 | -0.67 |
AC022098.2 | -0.46 | -0.63 |
Gmip | -0.46 | -0.64 |
SH2B2 | -0.45 | -0.72 |
DBN1 | -0.45 | -0.62 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg tgf beta信号通路 | 86 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg焦点粘附 | 201 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG ECM受体相互作用 | 84 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PDGF的Reactome信号传导 | 122 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bertucci髓质与导管乳腺癌DN | 169 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
turashvili乳房小叶癌与小叶正常DN | 74 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌先进与早期 | 175 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jaeger转移 | 44 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 UP | 418 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
环氧化物素的浓凋亡 | 239 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼头颈癌F | 54 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cervera SDHB目标2 | 114 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pomeroy髓母细胞瘤脱毛质vs经典 | 62 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Affar YY1靶向DN | 234 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
康(Kang)由tert dn永生 | 102 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
约瑟夫对丁酸钠DN的反应 | 64 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krasnoselskaya ILF3靶向DN | 46 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦克拉克兰牙科龋齿 | 253 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦凯布(McCabe)由HOXC6绑定 | 469 | 239 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2 CDC25A DN的射线肿瘤发生 | 159 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yauch刺猬信号传导旁分泌DN | 264 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 | 269 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌子类CTNNB1 UP | 176 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钱德兰转移DN | 306 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kamminga衰老 | 41 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇2向上 | 54 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇3 | 170 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇6 | 140 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Katsanou Elavl1靶向DN | 148 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Plasari TGFB1靶向10小时 | 199 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA ECM糖蛋白 | 196 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA核心母质 | 275 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |