基因页：thra
概括？
| 基因 | 7067 |
| 象征 | thra |
| 同义词 | ar7 | chng6 | ear7 | erb-t-1 | erba | erba1 | nr1a1 | thra1 | thra2 | c-erba-1 |
| 描述 | 甲状腺激素受体，α |
| 参考 | MIM：190120|HGNC：HGNC：11796|ENSEMBL：ENSG00000126351|HPRD：07185|Vega：Otthumg00000133332 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 17q11.2 |
| Pascal P值 | 0.042 |
| Sherlock P值 | 0.59 |
| 胎儿β | -0.269 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG23121350 | 17 | 38219361 | thra | 4.79E-8 | -0.014 | 1.29e-5 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS17542055 | CHR7 | 42652803 | thra | 7067 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| UTP14C | 0.96 | 0.97 |
| mtdh | 0.94 | 0.95 |
| AC012621.2 | 0.94 | 0.95 |
| Trip12 | 0.94 | 0.95 |
| prkaa1 | 0.94 | 0.95 |
| BCLAF1 | 0.93 | 0.95 |
| GTF2A1 | 0.93 | 0.95 |
| ZNF507 | 0.93 | 0.96 |
| Bag5 | 0.93 | 0.94 |
| CEP97 | 0.93 | 0.96 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.72 | -0.79 |
| FXYD1 | -0.71 | -0.79 |
| MT-CO2 | -0.71 | -0.80 |
| higd1b | -0.69 | -0.78 |
| ifi27 | -0.69 | -0.78 |
| 增强 | -0.68 | -0.80 |
| mt-cyb | -0.67 | -0.75 |
| AF347015.21 | -0.67 | -0.77 |
| AF347015.8 | -0.67 | -0.76 |
| AF347015.33 | -0.67 | -0.73 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| AKAP13 | AKAP-LBC |brx |FLJ11952 |FLJ43341 |ha-3 |HT31 |LBC |原始-LB |原始-LBC |C-LBC | 激酶（PRKA）锚蛋白13 | - | HPRD，Biogrid | 9627117 |
| BTG1 | - | B细胞易位基因1，抗增殖 | BTG1与THRA相互作用（TR-Alpha-1）。这种相互作用是在人类BTG1与鸡或鹌鹑tr-Alpha-1之间的相互作用上建模的。 | 绑定 | 15674337 |
| CCND1 | bcl1 |D11S287E |prad1 |U21B31 | Cyclin D1 | - | HPRD，Biogrid | 12048199 |
| CDK7 | cak1 |CDKN7 |mo15 |STK1 |P39MO15 | 细胞周期蛋白依赖性激酶7 | Tr-Alpha与HMO15相互作用。这种相互作用是在鸡Tr-Alpha和人HMO15之间的相互作用上建模的。 | 绑定 | 15249124 |
| CDK8 | K35 |MGC126074 |MGC126075 | 细胞周期蛋白依赖性激酶8 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10198638 |
| COPS2 | 外星人|CSN2 |sgn2 |Trip15 | COP9本构型显微类同源亚基2（拟南芥） | - | HPRD，Biogrid | 10207062 |
| CREB1 | Creb |MGC9284 | cAMP响应元件结合蛋白1 | - | HPRD | 12805224 |
| DAP3 | DAP-3 |DKFZP686G12159 |MGC126058 |MGC126059 |MRP-S29 |MRPS29 |BMRP-10 | 死亡相关蛋白3 | 重构的复合物 | Biogrid | 10903152 |
| EP300 | kat3b |P300 | E1a结合蛋白p300 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12371907 |
| FUS | 切碎|FUS-CHOP |fus1 |TLS |TLS/CHOP |HNRNP-P2 | 融合（涉及恶性脂肪肉瘤中的t（12; 16）） | - | HPRD，Biogrid | 9440806 |
| GTF2B | TF2B |tfiib | 通用转录因子IIB | GTF2B（TFIIB）与THRA（T3R-Alpha）相互作用。这种相互作用是建立在人类TFIIB和鸡T3R-α之间的相互作用的模型。 | 绑定 | 7609079 |
| HDAC2 | RPD3 |yaf1 | 组蛋白脱乙酰基酶2 | - | HPRD | 10508171 |
| 人力资源 | alunc |au |HSA277165 | 无毛同源物（鼠标） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11641275 |
| itgb3bp | CENP-R |Cenpr |HSU37139 |NRIF3 |TAP20 | 整联蛋白β3结合蛋白（beta3-endonexin） | 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 10490654|11713274 |
| Med1 | CRSP1 |CRSP200 |滴水205 |滴水230 |MGC71488 |PBP |PPARBP |PPARGBP |RB18A |TRAP220 | TRIP2 | 介体复合体亚基1 | - | HPRD，Biogrid | 9653119 |
| Med12 | CAGH45 |霍普|KIAA0192 |OPA1 |TNRC11 |陷阱230 | 中介复合体亚基12 | 亲和力捕获ms 亲和力捕获 - 韦斯特恩 |
Biogrid | 10198638 |
| Med16 | 滴灌92 |thrap5 |陷阱95 | 中介复合体亚基16 | 亲和力捕获ms 亲和力捕获 - 韦斯特恩 |
Biogrid | 10198638 |
| Med21 | SRB7 |Surb7 | 中介复合体亚基21 | Tr-Alpha与HSRB7相互作用。这种相互作用是建立在鸡Tr-Alpha和人HSRB7之间的相互作用上的模型。 | 绑定 | 15249124 |
| Med21 | SRB7 |Surb7 | 中介复合体亚基21 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10198638 |
| Med24 | ARC100 |CRSP100 |CRSP4 |滴100 |KIAA0130 |MGC8748 |thrap4 |陷阱100 | 介体复合体亚基24 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10198638 |
| Med6 | NY-REN-28 | 中介复合体亚基6 | 亲和力捕获ms 亲和力捕获 - 韦斯特恩 |
Biogrid | 10198638 |
| mef2a | ADCAD1 |RSRFC4 |RSRFC9 | 心肌细胞增强子因子2a | - | HPRD，Biogrid | 12371907 |
| NCOA1 | F-SRC-1 |kat13a |MGC129719 |MGC129720 |NCOA-1 |RIP160 |SRC-1 |src1 |Bhlhe42 | 核受体共激活因子1 | Tr-Alpha与SRC-1相互作用。这种相互作用是建立在鸡Tr-Alpha和人SRC-1之间的相互作用上的。 | 绑定 | 15249124 |
| NCOA6 | AIB3 |antp |ASC2 |HOX1.1 |Hoxa7 |KIAA0181 |NRC |prip |Rap250 |trbp | 核受体共激活因子6 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 10567404|10847592 |11158331 |
| NR0B2 | FLJ17090 |SHP |SHP1 | 核受体亚科0，B组，成员2 | 重构的复合物 | Biogrid | 8650544 |
| NR2F1 | COUP-TFI |ear-3 |Ear3 |erbal3 |NR2F2 |SVP44 |TCFCOUP1 |TFCOUP1 | 核受体亚科2，F组，成员1 | - | HPRD | 1331778 |
| NRIP1 | FLJ77253 |RIP140 | 核受体相互作用蛋白1 | 重构的复合物 | Biogrid | 9626662 |
| NSD1 | ARA267 |DKFZP666C163 |FLJ10684 |FLJ22263 |FLJ44628 |KMT3B |sotos |斯托 | 核受体结合集合域蛋白1 | - | HPRD | 9628876 |
| PARP1 | adprt |adprt1 |PARP |PARP-1 |ppol |PADPRT-1 | 聚（ADP-核糖）聚合酶1 | PARP-1与Tr-Alpha相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人类PARP-1和Tr-Alpha之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 15808511 |
| PCSK2 | Nec2 |PC2 |SPC2 | 普罗蛋白转化酶枯草蛋白/Kexin类型2 | THRA与PCSK2（PC2）启动子相互作用。这种相互作用是建立在鸡肉Thra和人PCSK2（PC2）启动子之间的相互作用上的模型。 | 绑定 | 10965896 |
| PML | myl |pp8675 |RNF71 |TRIM19 | Promyelocytic白血病 | - | HPRD | 10610177 |
| POU2F1 | OCT1 |OTF1 | POU 2级同型1 | 重构的复合物 | Biogrid | 10480874 |
| rxra | FLJ00280 |FLJ00318 |FLJ16020 |FLJ16733 |MGC102720 |NR2B1 | 类维生素X受体，α | 共纯化 | Biogrid | 1314167 |
| rxra | FLJ00280 |FLJ00318 |FLJ16020 |FLJ16733 |MGC102720 |NR2B1 | 类维生素X受体，α | - | HPRD | 1331778 |
| RXRB | daudi6 |H-2riibp |MGC1831 |NR2B2 |RCOR-1 | 类维生素X受体，β | - | HPRD | 1331778 |
| TDG | - | 胸腺氨酸-DNA糖基酶 | - | HPRD，Biogrid | 12874288 |
| TRIM24 | PTC6 |RNF82 |TF1A |tif1 |tif1a |tif1alpha |HTIF1 | 三方基序24 | 重构的复合物 | Biogrid | 9115274 |
| Trip11 | CEV14 |GMAP-210 |Trip230 | 甲状腺激素受体相互作用者11 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 9256431 |
| 是的 | ywha1 | 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白，ETA多肽 | - | HPRD | 11266503 |
| ywhaq | 14-3-3 |1c5 |HS1 | 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白，theta多肽 | 重构的复合物 | Biogrid | 11266503 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG神经活性配体受体相互作用 | 272 | 195 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta EGFR Smrte途径 | 11 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID RXR VDR途径 | 26 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome通用转录途径 | 352 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome核受体转录途径 | 49 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn | 493 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 下巴乳腺癌复制号码 | 27 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Berenjeno由Rhoa DN转变 | 394 | 258 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dairkee Tert目标 | 380 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 刘肝癌 | 38 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌17q11 Q21 Amplicon | 133 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 费尔南德斯（Fernandez）由迈克（Myc）约束 | 182 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 约瑟夫对丁酸钠DN的反应 | 64 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tseng irs1靶向DN | 135 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN | 287 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom APC MYC目标 | 217 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stearman肺癌早期与晚期 | 125 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bhati G2M被2methoxyestradiol DN逮捕 | 127 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 霍夫曼（Hoffmann | 75 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张TLX目标60小时 | 293 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shedden肺癌良好生存A12 | 317 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由Myc Up监管 | 72 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |