基因页：Thy1
Summary？
| GeneID | 7070 |
| Symbol | Thy1 |
| 同义词 | CD90 | CDW90 |
| 描述 | THY-1细胞表面抗原 |
| 参考 | MIM:188230|HGNC:HGNC:11801|HPRD：01769|HPRD：11283| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 11q23.3 |
| Pascal P值 | 0.3 |
| Sherlock p-value | 0.17 |
| 胎儿β | -2.73 |
| DMG | 1 (# studies) |
| 主持人 | 小脑半球 |
| 支持 | 细胞内信号转导 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS G2CDB.HUMAN_CLATHRIN G2Cdb.human_Synaptosome |
Gene in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 2 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| GSMA_I | Genome scan meta-analysis | Psr: 0.006 | |
| Literature | 高通量文献搜索 | Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenias | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | Hits with neuro-related keywords: 2 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG22978378 | 11 | 119294441 | Thy1 | 1.83E-5 | 0.503 | 0.016 | DMG：Wockner_2014 |
| cg24421870 | 11 | 119290274 | Thy1 | 9.93E-5 | 0.574 | 0.028 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
没有发生基因在文胸in regions
第三节。基因本体论注释
| Molecular function | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005100 | Rho GTPase激活剂活性 | ISS | - | |
| 去：0003674 | Molecular_Function | ND | - | |
| 去：0005178 | integrin binding | IPI | 15004192 | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 7513706 | |
| GO:0034235 | GPI锚固结合 | ISS | - | |
| Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0050771 | 轴突发生的阴性调节 | ISS | 轴突，神经发生（GO期限：14） | - |
| 去：0001525 | 血管生成 | ISS | - | |
| GO:0006469 | negative regulation of protein kinase activity | ISS | - | |
| 去：0007010 | 细胞骨架组织 | ISS | - | |
| 去：0008150 | 生物_Process | ND | - | |
| GO:0048041 | 局灶性粘附形成 | ISS | - | |
| GO：0016337 | 细胞细胞粘附 | ISS | - | |
| GO：0050870 | T细胞激活的阳性调节 | ISS | - | |
| GO：0050860 | T细胞受体信号通路的负调控 | ISS | - | |
| GO：0051281 | 将螯合钙离子释放到细胞质的正调节 | ISS | - | |
| GO:0030336 | 细胞迁移的负调节 | ISS | - | |
| GO：0043547 | GTPase活性的阳性调节 | ISS | - | |
| GO:0046549 | 视网膜锥细胞发育 | ISS | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0030426 | 生长锥 | ISS | Axon，Dendrite（GO期限：5） | - |
| 去：0005575 | cellular_component | ND | - | |
| 去：0005783 | 内质网 | 艾达 | 11256614 | |
| 去：0009897 | external side of plasma membrane | ISS | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | ISS | - | |
| 去：0005887 | integral to plasma membrane | TAS | 2864289 | |
| GO：0031362 | 锚定在质膜的外侧 | IEA | - | |
| GO：0031225 | 锚定在膜上 | IEA | - | |
| GO:0045121 | 膜筏 | nas | 15093746 |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
| miRNA family | 目标位置 | miRNA ID | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-103/107 | 141 | 147 | 1a | hsa-miR-103脑 | agcagcauuguacggcuauga |
| hsa-miR-107脑 | agcagcauuguacgggcuauca | ||||