Gene Page:TIMP1
概括?
| 基因 | 7076 |
| Symbol | TIMP1 |
| Synonyms | CLGI|EPA|EPO|HCI|TIMP|TIMP-1 |
| Description | TIMP metallopeptidase inhibitor 1 |
| Reference | MIM:305370|HGNC:HGNC:11820|Ensembl:ENSG00000102265|HPRD:02371|Vega:OTTHUMG00000021447 |
| Gene type | protein-coding |
| Map location | Xp11.3-p11.23 |
| Sherlock p-value | 0.565 |
| Fetal beta | -0.318 |
| eGene | Myers' cis & trans |
| Support | Potential synaptic genes |
数据源中的基因
| Gene set name | Method of gene set | Description | Info |
|---|---|---|---|
| CV:PGCnp | Genome-wide Association Study | GWAS | |
| PMID:cooccur | High-throughput literature-search | Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included. | |
| Literature | High-throughput literature-search | Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenias | Click to show details |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
eQTL annotation
eQTL annotation| SNP ID | Chromosome | Position | eGene | Gene Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS distance | eQTL type |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs2839839 | chr2 | 51691483 | TIMP1 | 7076 | 0.18 | trans | ||
| rs6746267 | chr2 | 205612604 | TIMP1 | 7076 | 0.02 | trans | ||
| rs4921994 | chr8 | 18954801 | TIMP1 | 7076 | 0.01 | trans | ||
| rs4796759 | chr17 | 40174840 | TIMP1 | 7076 | 0.06 | trans |
Section II. Transcriptome annotation
General gene expression (GTEx)
Gene expression during devlopment (BrainCloud)
脚注：
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.
Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)
脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
No co-expressed genes in brain regions
Section V. Pathway annotation
| Pathway name | Pathway size | # SZGR 2.0 genes in pathway | Info |
|---|---|---|---|
| PID AP1 PATHWAY | 70 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID IL6 7 PATHWAY | 47 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME DEGRADATION OF THE EXTRACELLULAR MATRIX | 29 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME EXTRACELLULAR MATRIX ORGANIZATION | 87 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME RESPONSE TO ELEVATED PLATELET CYTOSOLIC CA2 | 89 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME HEMOSTASIS | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME PLATELET ACTIVATION SIGNALING AND AGGREGATION | 208 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NAKAMURA TUMOR ZONE PERIPHERAL VS CENTRAL DN | 634 | 384 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ZHONG RESPONSE TO AZACITIDINE AND TSA UP | 183 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PAX FOXO1融合的Davicioni目标 | 255 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CASORELLI ACUTE PROMYELOCYTIC LEUKEMIA UP | 177 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Huttmann B Cll生存不佳 | 276 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS MESENCHYMAL DN | 460 | 312 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ROY WOUND BLOOD VESSEL UP | 50 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GRABARCZYK BCL11B TARGETS UP | 81 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GOZGIT ESR1 TARGETS DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KOKKINAKIS METHIONINE DEPRIVATION 48HR UP | 128 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KOKKINAKIS METHIONINE DEPRIVATION 96HR UP | 117 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DELYS THYROID CANCER UP | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHIARADONNA NEOPLASTIC TRANSFORMATION KRAS UP | 126 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BARIS THYROID CANCER DN | 59 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BERENJENO通过RHOA转换 | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MISSIAGLIA REGULATED BY METHYLATION UP | 126 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MCBRYAN PUBERTAL BREAST 4 5WK UP | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MCBRYAN PUBERTAL BREAST 6 7WK DN | 79 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SANCHEZ MDM2 TARGETS | 15 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LI AMPLIFIED IN LUNG CANCER | 178 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| AIYAR COBRA1 TARGETS UP | 39 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| XU HGF SIGNALING NOT VIA AKT1 48HR UP | 35 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PATIL LIVER CANCER | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HASINA NOL7 TARGETS UP | 13 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KONDO HYPOXIA | 8 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GOTZMANN EPITHELIAL TO MESENCHYMAL TRANSITION UP | 69 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BENPORATH CYCLING GENES | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NAKAJIMA MAST CELL | 46 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REN ALVEOLAR RHABDOMYOSARCOMA DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee Calorie限制性新皮层 | 83 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nielsen malignat纤维组织细胞瘤 | 18 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 村上紫外线响应6小时 | 37 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KUNINGER IGF1 VS PDGFB TARGETS DN | 46 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| VERRECCHIA RESPONSE TO TGFB1 C2 | 25 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MACLACHLAN BRCA1 TARGETS UP | 21 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BURTON ADIPOGENESIS 2 | 72 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| VERRECCHIA EARLY RESPONSE TO TGFB1 | 58 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MCLACHLAN DENTAL CARIES DN | 245 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RODWELL AGING KIDNEY NO BLOOD UP | 222 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RODWELL AGING KIDNEY UP | 487 | 303 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BURTON ADIPOGENESIS 7 | 51 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WHITESIDE CISPLATIN RESISTANCE DN | 13 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| JIANG HYPOXIA NORMAL | 311 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BAELDE DIABETIC NEPHROPATHY DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| JOSEPH RESPONSE TO SODIUM BUTYRATE UP | 31 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MCLACHLAN DENTAL CARIES UP | 253 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 《图片报》极品癌基因IC SIGNATURE | 261 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 转移DN期间的clasper淋巴管 | 36 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Riggins他莫昔芬抵抗DN | 220 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| JI CARCINOGENESIS BY KRAS AND STK11 DN | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| JEPSEN SMRT TARGETS | 33 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MARTINEZ RB1 TARGETS UP | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MARTINEZ TP53 TARGETS DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MARTINEZ RB1 AND TP53 TARGETS UP | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MITSIADES RESPONSE TO APLIDIN UP | 439 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BASSO HAIRY CELL LEUKEMIA DN | 80 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ZHENG IL22 SIGNALING UP | 56 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GRADE COLON AND RECTAL CANCER UP | 285 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BOQUEST STEM CELL UP | 260 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| QI PLASMACYTOMA DN | 100 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BLUM RESPONSE TO SALIRASIB UP | 245 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| VART KSHV INFECTION ANGIOGENIC MARKERS UP | 165 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHANG CYCLING GENES | 148 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| JISON SICKLE CELL DISEASE UP | 181 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHIANG LIVER CANCER SUBCLASS CTNNB1 DN | 170 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LEE LIVER CANCER HEPATOBLAST | 16 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ZHAN MULTIPLE MYELOMA HP DN | 47 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nakayama软组织肿瘤PCA1向上 | 76 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MIKKELSEN ES ICP WITH H3K4ME3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 惠特菲尔德细胞周期G2 | 182 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KARLSSON TGFB1 TARGETS UP | 127 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| VERHAAK GLIOBLASTOMA MESENCHYMAL | 216 | 130 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HIRSCH CELLULAR TRANSFORMATION SIGNATURE UP | 242 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| JOHNSTONE PARVB TARGETS 3 UP | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PEDERSEN METASTASIS BY ERBB2 ISOFORM 4 | 110 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YANG BCL3 TARGETS UP | 364 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ALTEMEIER RESPONSE TO LPS WITH MECHANICAL VENTILATION | 128 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ACEVEDO FGFR1 TARGETS IN PROSTATE CANCER MODEL UP | 289 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA ECM REGULATORS | 238 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA MATRISOME ASSOCIATED | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA MATRISOME | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |