基因页：TIMP3

概括?
GeneID 7078
Symbol TIMP3
同义词 HSMRK222 | K222 | K222TA2 | SFD
描述 TIMP metallopeptidase inhibitor 3
参考 MIM:188826|HGNC：HGNC：11822|Ensembl：ENSG00000100234|HPRD：01785|Vega:OTTHUMG00000030784
Gene type protein-coding
地图位置 22q12.3
Pascal P值 0.137
Sherlock P值 0.002
Fetal beta -1.167
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
Gene set name 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
协会 组合的优势比方法（Sun et al. 2008），协会研究 1 链接到Szgene
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.031

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID Chromosome Position eGene Gene Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
RS17720221 chr13 75182377 TIMP3 7078 0.19 trans

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因


Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0003674 molecular_function ND -
GO:0005515 protein binding IPI 18344519
去：0004857 酶抑制剂活性 IEA -
去：0008191 金属肽酶抑制剂活性 IEA -
Biological process GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0007169 跨膜受体蛋白酪氨酸激酶团体naling pathway NAS 15609325
GO:0007601 视觉感知 IEA -
GO:0008624 通过细胞外信号诱导凋亡 NAS 7925969
GO:0050896 response to stimulus IEA -
细胞分量 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005576 extracellular region IEA -
GO:0005578 蛋白质细胞外基质 NAS 7925969
GO:0005604 地下膜 IEA -

V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
Biocarta P53途径 16 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘前列腺癌DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERTUCCI MEDULLARY VS DUCTAL BREAST CANCER DN 169 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHUETZ BREAST CANCER DUCTAL INVASIVE UP 351 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Piepoli LGI1靶向 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huttmann B Cll生存不佳 276 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES NTN1 TARGETS DN 158 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG CLIM2 TARGETS UP 269 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VECCHI GASTRIC CANCER ADVANCED VS EARLY UP 175 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TAKEDA TARGETS OF NUP98 HOXA9 FUSION 10D UP 194 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MULLIGHAN MLL SIGNATURE 1 DN 242 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION HSC DN 187 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dittmer Pthlh靶向 112 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UDAYAKUMAR MED1 TARGETS DN 240 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC1 AND HDAC2 TARGETS DN 232 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC2 TARGETS DN 133 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sabates结直肠腺瘤的大小 23 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向 214 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM WT1 TARGETS 8HR UP 164 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM WT1 TARGETS 12HR UP 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAMUNYOKOLI OVARIAN CANCER LMP DN 199 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌变性DN 537 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOKKINAKIS METHIONINE DEPRIVATION 48HR UP 128 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kokkinakis甲硫氨酸剥夺96小时 117 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIARADONNA NEOPLASTIC TRANSFORMATION KRAS DN 142 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIARADONNA NEOPLASTIC TRANSFORMATION CDC25 DN 153 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARKEY RB1 CHRONIC LOF DN 118 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN RESPONSE TO MC AND DOXORUBICIN DN 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAUSSMANN MLL AF4 FUSION TARGETS C UP 170 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA FOREVER UP 19 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA DN 394 258 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过小径dn 186 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BEGUM TARGETS OF PAX3 FOXO1 FUSION DN 45 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Olsson E2F3靶向DN 49 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射2的响应2 127 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hernandez异常有丝分裂构成Docetacel 4nm 23 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HERNANDEZ MITOTIC ARREST BY DOCETAXEL 1 UP 36 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SEITZ NEOPLASTIC TRANSFORMATION BY 8P DELETION UP 73 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOHANKUMAR TLX1 TARGETS UP 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRUETZMANN PANCREATIC CANCER UP 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏2 DN 51 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIEN BREAST CARCINOMA METAPLASTIC 35 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
成人癌中甲基化的欧姆 27 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OHM EMBRYONIC CARCINOMA DN 8 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU CELL MIGRATION 184 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
COLIN PILOCYTIC ASTROCYTOMA VS GLIOBLASTOMA DN 28 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gotzmann上皮到间充质过渡 69 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SUNG METASTASIS STROMA UP 110 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROZANOV MMP14 TARGETS SUBSET 33 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROZANOV MMP14 TARGETS UP 266 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TARTE PLASMA CELL VS PLASMABLAST UP 398 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JECHLINGER EPITHELIAL TO MESENCHYMAL TRANSITION DN 66 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fab M7类型的Ross Aml 68 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SWEET KRAS TARGETS UP 84 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Grandvaux IRF3目标DN 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Haddad T淋巴细胞和NK祖细胞 78 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GILDEA METASTASIS 30 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEI MYB TARGETS 318 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PETROVA ENDOTHELIUM LYMPHATIC VS BLOOD UP 131 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAGI AML FAB MARKERS 191 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
铃木对TSA和Decitabine 1A的反应 23 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NATSUME RESPONSE TO INTERFERON BETA UP 71 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JIANG AGING CEREBRAL CORTEX UP 36 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
约瑟夫对丁酸钠DN的反应 64 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室 249 170 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 2 50 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染24小时DN 148 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIBA RESPONSE TO TSA UP 52 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAMAZAKI TCEB3 TARGETS UP 175 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SIMBULAN PARP1 TARGETS UP 31 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen lvad支持失败的心 103 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verrecchia对TGFB1 C2的反应 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS 8 86 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verrecchia对TGFB1的早期反应 58 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV 24小时DN 91 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV全部DN 128 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
liang被甲基化沉默 32 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HEDENFALK BREAST CANCER BRCA1 VS BRCA2 163 113 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS PEAK AT 0HR 63 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1 AUTOCRINE TARGETS DN 142 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性5 482 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HELLER HDAC TARGETS UP 317 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HELLER HDAC TARGETS SILENCED BY METHYLATION UP 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 TARGETS UP 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 AND TP53 TARGETS DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FUJII YBX1 TARGETS DN 202 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOQUE METHYLATED IN CANCER 56 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LE SKI TARGETS DN 8 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WILSON PROTEASES AT TUMOR BONE INTERFACE UP 21 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng胶质母细胞瘤可塑性DN 58 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV INFECTION ANGIOGENIC MARKERS UP 165 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV INFECTION ANGIOGENIC MARKERS DN 138 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN 238 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SWEET LUNG CANCER KRAS DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI PSEUDOPODIA CHEMOTAXIS DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉中的罗马胰岛素靶标 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与11q23重新排列 351 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TSAI DNAJB4靶向 13 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAMURA ADIPOGENESIS EARLY DN 38 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村脂肪形成晚期DN 38 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Baus TFF2靶向DN 11 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG RESPONSE TO GSK3 INHIBITOR SB216763 DN 374 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gabriely miR21靶标 289 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PILON KLF1 TARGETS UP 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STEGER ADIPOGENESIS DN 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WIEDERSCHAIN TARGETS OF BMI1 AND PCGF2 57 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOBERT OLIGODENDROCYTE DIFFERENTIATION DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PLASARI TGFB1 TARGETS 10HR UP 199 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DELACROIX RARG BOUND MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix RAR目标DN 24 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FORTSCHEGGER PHF8 TARGETS DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEDRIOLI MIR31 TARGETS DN 418 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ANASTASSIOU CANCER MESENCHYMAL TRANSITION SIGNATURE 64 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang EGF间隔DN 214 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA ECM REGULATORS 238 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family 目标位置 mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
miR-1/206 1756年 1762年 1A HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ UGGAAUGUAAGGAAGUGUGUGG
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ UGGAAUGUAAGGAAGUGUGUGG
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
miR-101 2420 2426 1A HSA-MIR-101 UACAGUACUGUGAUAACUGAAG
mir-144 2420 2426 1A HSA-MIR-144 uacaguauagauguauguaguag
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D 1761年 1767年 1A HSA-MIR-17-5P CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU
HSA-MIR-20A脑 uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
hsa-miR-519d CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU
mir-181 3499 3505 1A HSA-MIR-181a脑 aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181bSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181c脑 aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181d脑 aacauucauuguugucggggguggguu
HSA-MIR-181a脑 aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181bSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181c脑 aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181d脑 aacauucauuguugucggggguggguu
mir-21 2385 2392 1A,m8 HSA-MIR-21脑 uagcuuaucagacugauguuga
HSA-MIR-590 GAGCUUAUUCAUAAAAGUGCAG
miR-221/222 2443 2449 m8 HSA-MIR-221脑 AGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUC
HSA-MIR-222脑 AGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUC
miR-299-3p 2557 2563 m8 HSA-MIR-299-3P uauggggaugguaaaaCcgcuu
miR-30-5p 3529 3536 1A,m8 hsa-miR-30a-5p UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ UGUAAACAUCCUACACUCAGCU
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-384 305 311 1A hsa-miR-384 AUUCCUAGAAAUUGUUCAUA