概括
基因 7097
象征 TLR2
同义词 CD282 | TIL4
描述 像受体2一样收费
参考 MIM:603028|HGNC:HGNC:11848|HPRD:04323|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4Q32
Pascal P值 0.024
Sherlock P值 0.727
胎儿β -1.935
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS3804100 CHR4 154625408 TLR2 7097 0.07 顺式
RS10014722 CHR4 54588016 TLR2 7097 0.1 反式
RS17036588 CHR4 158561487 TLR2 7097 0.13 反式
RS6596945 CHR6 3071912 TLR2 7097 0.06 反式
RS11216720 Chr11 117909100 TLR2 7097 0.04 反式
RS17076272 CHR13 22726361 TLR2 7097 0.15 反式
RS17076274 CHR13 22726381 TLR2 7097 0.15 反式
RS6127987 CHR20 37035217 TLR2 7097 0.03 反式
RS16982879 Chrx 92924110 TLR2 7097 0.18 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HCRTR2 0.58 0.17
PDE1A 0.53 0.36
C14orf23 0.52 0.20
STK17A 0.51 0.19
gadl1 0.50 0.16
ST6GALNAC3 0.50 0.29
KRT31 0.49 0.25
RNF138 0.49 0.17
克里姆 0.48 0.38
NCAPG 0.48 0.01
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CSPG5 -0.27 -0.27
CCDC80 -0.27 -0.33
lims2 -0.25 -0.25
FGF11 -0.25 -0.24
BTBD17 -0.25 -0.37
tbxa2r -0.23 -0.28
SOCS1 -0.23 -0.35
KIF19 -0.23 -0.31
TMEM102 -0.23 -0.24
TMEM51 -0.23 -0.26

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg Toll像受体信号通路 102 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg Leishmania感染 72 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta DC途径 22 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta NTHI途径 24 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta收费途径 37 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TOLL内源性途径 25 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组防御素 51 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome beta防御素 42 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome myd88 mal级联反应于质膜发起 83 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome先天免疫系统 279 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome激活的TLR4信号传导 93 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome收费受体级联 118 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bertucci髓质与导管乳腺癌 206 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应生活 485 293 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Casorelli急性临时细胞白血病 177 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨型性白血病DN 116 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gal白血病干细胞DN 244 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌先进与早期 175 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov在癌症中循环内皮细胞 158 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合红细胞的TONKS目标 157 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应fima 544 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周炎性反应lps up 431 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和血清剥夺的反应 211 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胶质母细胞瘤中甲基化的粘合剂 40 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hif1a总靶向 8 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过HIF1A的总缺氧 77 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤分化中等程度与不良 121 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿米特血清反应240 MCF10A 57 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张对IKK抑制剂和TNF的反应 223 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rozanov MMP14靶向 266 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
sana tnf发出信号 83 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕色髓样细胞的发育 165 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOXA9和MEIS1 DN的HESS目标 77 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染12小时 111 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acevedo肝癌,H3K27me3 UP 295 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acevedo肝癌与H3K9me3 UP 141 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SEKI炎症反应LPS 77 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindstedt树突状细胞成熟A 67 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
炎症反应和胆固醇 58 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner ES ICP与H3K4Me3 34 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MEISSNER NPC ICP带有H3K4ME3 20 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liu Vav3前列腺致癌作用 89 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sakai慢性肝炎与肝癌 83 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 445 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verhaak胶质母细胞瘤间充质 216 130 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 374 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇1 125 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇3 170 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇4 112 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇7 118 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim Glis2靶向 84 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向DN 418 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Altemeier对LPS具有机械通气的反应 128 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 516 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因