基因页:TLR2
概括?
基因 | 7097 |
象征 | TLR2 |
同义词 | CD282 | TIL4 |
描述 | 像受体2一样收费 |
参考 | MIM:603028|HGNC:HGNC:11848|HPRD:04323| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4Q32 |
Pascal P值 | 0.024 |
Sherlock P值 | 0.727 |
胎儿β | -1.935 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS3804100 | CHR4 | 154625408 | TLR2 | 7097 | 0.07 | 顺式 | ||
RS10014722 | CHR4 | 54588016 | TLR2 | 7097 | 0.1 | 反式 | ||
RS17036588 | CHR4 | 158561487 | TLR2 | 7097 | 0.13 | 反式 | ||
RS6596945 | CHR6 | 3071912 | TLR2 | 7097 | 0.06 | 反式 | ||
RS11216720 | Chr11 | 117909100 | TLR2 | 7097 | 0.04 | 反式 | ||
RS17076272 | CHR13 | 22726361 | TLR2 | 7097 | 0.15 | 反式 | ||
RS17076274 | CHR13 | 22726381 | TLR2 | 7097 | 0.15 | 反式 | ||
RS6127987 | CHR20 | 37035217 | TLR2 | 7097 | 0.03 | 反式 | ||
RS16982879 | Chrx | 92924110 | TLR2 | 7097 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TLR2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HCRTR2 | 0.58 | 0.17 |
PDE1A | 0.53 | 0.36 |
C14orf23 | 0.52 | 0.20 |
STK17A | 0.51 | 0.19 |
gadl1 | 0.50 | 0.16 |
ST6GALNAC3 | 0.50 | 0.29 |
KRT31 | 0.49 | 0.25 |
RNF138 | 0.49 | 0.17 |
克里姆 | 0.48 | 0.38 |
NCAPG | 0.48 | 0.01 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CSPG5 | -0.27 | -0.27 |
CCDC80 | -0.27 | -0.33 |
lims2 | -0.25 | -0.25 |
FGF11 | -0.25 | -0.24 |
BTBD17 | -0.25 | -0.37 |
tbxa2r | -0.23 | -0.28 |
SOCS1 | -0.23 | -0.35 |
KIF19 | -0.23 | -0.31 |
TMEM102 | -0.23 | -0.24 |
TMEM51 | -0.23 | -0.26 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg Toll像受体信号通路 | 102 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg Leishmania感染 | 72 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta DC途径 | 22 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta NTHI途径 | 24 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta收费途径 | 37 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID TOLL内源性途径 | 25 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组防御素 | 51 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome beta防御素 | 42 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome myd88 mal级联反应于质膜发起 | 83 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome先天免疫系统 | 279 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome激活的TLR4信号传导 | 93 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome收费受体级联 | 118 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bertucci髓质与导管乳腺癌 | 206 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应生活 | 485 | 293 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Casorelli急性临时细胞白血病 | 177 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨型性白血病DN | 116 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与基础DN | 455 | 304 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
gal白血病干细胞DN | 244 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌先进与早期 | 175 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smirnov在癌症中循环内皮细胞 | 158 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
runx1 runx1t1融合红细胞的TONKS目标 | 157 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应fima | 544 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周炎性反应lps up | 431 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和血清剥夺的反应 | 211 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素的反应 | 612 | 367 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在胶质母细胞瘤中甲基化的粘合剂 | 40 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
hif1a总靶向 | 8 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过HIF1A的总缺氧 | 77 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼肿瘤分化中等程度与不良 | 121 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿米特血清反应240 MCF10A | 57 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张对IKK抑制剂和TNF的反应 | 223 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标2 DN | 464 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rozanov MMP14靶向 | 266 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
sana tnf发出信号 | 83 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕色髓样细胞的发育 | 165 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HOXA9和MEIS1 DN的HESS目标 | 77 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染12小时 | 111 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Acevedo肝癌,H3K27me3 UP | 295 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Acevedo肝癌与H3K9me3 UP | 141 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SEKI炎症反应LPS | 77 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindstedt树突状细胞成熟A | 67 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
炎症反应和胆固醇 | 58 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner ES ICP与H3K4Me3 | 34 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MEISSNER NPC ICP带有H3K4ME3 | 20 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MILI假足趋化性DN | 457 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Liu Vav3前列腺致癌作用 | 89 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sakai慢性肝炎与肝癌 | 83 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verhaak胶质母细胞瘤间充质 | 216 | 130 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 | 374 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇1 | 125 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇3 | 170 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇4 | 112 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇7 | 118 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim Glis2靶向 | 84 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pedrioli mir31靶向DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Altemeier对LPS具有机械通气的反应 | 128 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 | 516 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |