基因页：TLR5

概括？
基因 7100
象征 TLR5
同义词 梅利奥| sle1 | sleb1 | til3
描述 像受体5一样收费
参考 MIM：603031|HGNC：HGNC：11851|ENSEMBL：ENSG00000187554|HPRD：04326|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q41-Q42
Sherlock P值 0.721
胎儿β -0.495
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM：Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 筛 CG46 特征 学习
TLR5 CHR1 223283825 G 一个 NM_003268 p.850p> l 错过 精神分裂症 DNM：Fromer_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS3812061 CHR5 126213763 TLR5 7100 0.19 反式
RS17618655 Chr9 73983104 TLR5 7100 0.08 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
KIAA1244 0.83 0.85
asxl2 0.81 0.84
NFAT5 0.79 0.84
CSMD1 0.78 0.78
PPP1R12B 0.78 0.82
SH3PXD2A 0.78 0.78
SHC3 0.77 0.77
lonrf2 0.77 0.79
phlpp2 0.77 0.81
tgoln2 0.77 0.79
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
DBI -0.47 -0.60
GNG11 -0.44 -0.55
Rhoc -0.44 -0.54
PSME2 -0.44 -0.54
SERF2 -0.44 -0.53
C1orf61 -0.44 -0.58
C1orf54 -0.44 -0.55
Rab34 -0.42 -0.51
ST20 -0.42 -0.52
RPS27L -0.42 -0.49

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Kegg Toll像受体信号通路 102 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG致病性大肠杆菌感染 59 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome先天免疫系统 279 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome收费受体级联 118 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bidus转移DN 161 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Labbe Wnt3a靶向DN 97 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈肝新陈代谢QTL顺式 93 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G1 UP 113 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen IPS ICP带有H3K4ME3和H327Me3 126 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP带有H3K4ME3和H3K27ME3 137 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组C的UVC响应 92 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞DN 428 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因