基因页面:TSPAN6
总结吗?
| GeneID | 7105年 |
| 象征 | TSPAN6 |
| 同义词 | T245 | TM4SF6 | TSPAN-6 |
| 描述 | tetraspanin 6 |
| 参考 | MIM: 300191|HGNC: HGNC: 11858|运用:ENSG00000000003|HPRD: 02179| |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | Xq22 |
| 夏洛克假定值 | 0.04 |
| 胎儿β | 2.287 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs16983508 | chrX | 99747940 | TSPAN6 | 7105年 | 0.03 | 独联体 | ||
| rs12042301 | chr1 | 118355192 | TSPAN6 | 7105年 | 0.16 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| TNXA | 0.92 | 0.90 |
| GPR124 | 0.78 | 0.81 |
| LAMC3 | 0.71 | 0.79 |
| OLFML2A | 0.71 | 0.76 |
| ECE1 | 0.70 | 0.77 |
| FGD5 | 0.70 | 0.76 |
| ITIH5 | 0.66 | 0.74 |
| COL18A1 | 0.65 | 0.71 |
| KIAA0664 | 0.65 | 0.67 |
| INS | 0.65 | 0.68 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C8orf59 | -0.50 | -0.56 |
| RPS27L | -0.48 | -0.51 |
| MRPL13 | -0.45 | -0.49 |
| RPL31 | -0.44 | -0.52 |
| PFDN5 | -0.43 | -0.49 |
| ALG5 | -0.42 | -0.48 |
| AL050337.1 | -0.41 | -0.43 |
| COX7C | -0.41 | -0.46 |
| COX16 | -0.41 | -0.46 |
| SYCP3 | -0.41 | -0.39 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| ONKEN葡萄膜黑色素瘤DN | 526年 | 357年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 森古普塔鼻咽癌DN | 349年 | 157年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN BASAKI YBX1目标 | 384年 | 230年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 格雷厄姆CML静止和正常的静止的DN | 47 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 格雷厄姆CML分裂和正常的静止的DN | 95年 | 57 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 罗德里格斯甲状腺癌分化不良DN | 805年 | 505年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王食道癌和正常的DN | 101年 | 66年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN NUYTTEN EZH2目标 | 1024年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里克曼肿瘤分化好VS适度 | 109年 | 69年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里克曼转移了 | 344年 | 180年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 鲍德温PRKCI目标了 | 35 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH NANOG目标 | 988年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH SUZ12目标 | 1038年 | 678年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH速度的目标 | 1062年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL反式 | 882年 | 572年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 贝克尔三苯氧胺耐药性DN | 52 | 37 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃造血干细胞 | 254年 | 164年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病了布莱洛克的 | 1691年 | 1088年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染48小时血巨细胞病毒DN | 504年 | 323年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伯顿脂肪生成8 | 86年 | 57 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 朱巨细胞病毒24小时DN | 91年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 曾IRS1 DN的目标 | 135年 | 88年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 朱巨细胞病毒所有DN | 128年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 曾脂肪形成的潜在DN | 46 | 28 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CREIGHTON内分泌治疗抵抗4 | 307年 | 185年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BOQUEST干细胞DN | 216年 | 143年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王肿瘤由CCND1 MYC转换 | 21 | 14 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 甜蜜的肺癌喀斯特DN | 435年 | 289年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| COLINA 4 ebp1和4 ebp2的目标 | 356年 | 214年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陈代谢症侯群网络 | 1210年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米利伪足趋触性DN | 668年 | 419年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 蒋介石肝癌子类未经DN | 193年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 开罗肝脏发展起来 | 166年 | 105年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 黄成人组织干细胞模块 | 721年 | 492年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| TORCHIA EWSR1 FLI1融合DN的目标 | 321年 | 200年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN FORTSCHEGGER PHF8目标 | 784年 | 464年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 黄宗泽上皮分化模块 | 69年 | 31日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 杜兰基质年代了 | 297年 | 194年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |