概括
基因 7134
象征 TNNC1
同义词 cmd1z | cmh13 | tn-c | tnc | tnnc
描述 肌钙蛋白C1,缓慢的骨骼和心脏类型
参考 MIM:191040|HGNC:HGNC:11943|ENSEMBL:ENSG00000114854|HPRD:08930|Vega:Otthumg00000158572
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3P21.1
Pascal P值 0.036
胎儿β -0.355
主持人

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
ADT:SUN_2012 系统研究抗精神病药及其靶标 共有382个药物目标关联涉及43种抗精神病药和49个靶基因。
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
LK:是的 全基因组协会研究 该数据集包括映射到22个区域的99个基因。CV:RIPKE_2013中还包括24个领先的SNP

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
rprml 0.61 0.35
GP1BB 0.58 0.42
NPB 0.55 0.33
SCARF2 0.52 0.47
PRR7 0.52 0.42
TFR2 0.51 0.40
TNFSF9 0.51 0.37
CHPF 0.50 0.46
tbxa2r 0.50 0.33
map1lc3a 0.50 0.43
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SEC62 -0.25 -0.28
EIF5B -0.22 -0.29
Znhit6 -0.22 -0.20
SPCS2 -0.21 -0.21
ZNF226 -0.21 -0.22
CHMP4A -0.21 -0.22
CWF19L2 -0.20 -0.29
HSPBAP1 -0.20 -0.23
nkapl -0.20 -0.21
AIF1L -0.20 -0.11

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg钙信号通路 178 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg心肌收缩 80 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG肥厚性心肌病HCM 85 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG扩张心肌病 92 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组横纹的肌肉收缩 27 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组肌肉收缩 48 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rodrigues NTN1靶向DN 158 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1和HDAC2靶向DN 232 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC2靶向DN 133 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向DN 536 332 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX3 FOXO1融合的Ebauer目标 207 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX3 FOXO1融合的Ebauer肌原靶标 50 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
furukawa dusp6靶向pci35 74 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼头颈癌F 54 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Affar YY1目标 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙槽横纹肌肉瘤 98 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Calorie限制性新皮层 83 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室DN 261 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tseng irs1靶向DN 135 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kuninger IGF1与PDGFB的目标 82 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HU遗传毒性损伤4小时 35 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1靶向DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53靶向 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
iwanaga癌变由KRAS DN 120 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D 210 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
戴尔基癌俯卧反应BPA 51 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Izadpanah干细胞脂肪与骨DN 108 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌Kras DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ISSAEVA MLL2目标 62 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王NFKB目标 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Katsanou Elavl1靶向 169 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chemello Moleus vs Edl肌纤维向上 35 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因