基因页面:TOP1
总结吗?
GeneID | 7150年 |
象征 | TOP1 |
同义词 | 遮阳帽 |
描述 | 拓扑异构酶(DNA) |
参考 | MIM: 126420|HGNC: HGNC: 11986|运用:ENSG00000198900|HPRD: 00535|织女:OTTHUMG00000033057 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 20 q12-q13.1 |
帕斯卡假定值 | 3.372的军医 |
夏洛克假定值 | 0.421 |
胎儿β | 1.583 |
DMG | 2(#研究) |
支持 | Ascano FMRP目标 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 2 |
DMG: Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了DNA的甲基化概要首发精神分裂症患者外周血细胞从18岁(FESZ)和15名正常对照组。 | 2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg04119538 | 20. | 39657451 | TOP1 | -0.032 | 0.51 | DMG: Nishioka_2013 | |
cg04119538 | 20. | 39657451 | TOP1 | 4.83 e-9 | -0.009 | 2.77 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TOP1_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第四部分,注释蛋白质间交互作用
扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
BTBD1 | C15orf1 | NS5ATP8 | BTB (POZ)域包含1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11818025 |
BTBD2 | - - - - - - | BTB (POZ)域包含2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11818025 |
CSNK2A1 | CK2A1 | CKII | 酪蛋白激酶2,α1多肽 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 2998765 |
CSNK2A2 | CK2A2 | CSNK2A1 | FLJ43934 | 酪蛋白激酶2α'多肽 | 生化活动 | BioGRID | 2998765 |
NCL | C23 | FLJ45706 | nucleolin | Top1与Nucleolin | 绑定 | 10967121 |
NCL | C23 | FLJ45706 | nucleolin | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 8567649|9512561 |10967121 |
PARP1 | ADPRT | ADPRT1 | PARP | PARP-1 | PPOL | pADPRT-1 | 保利(ADP-ribose)聚合酶1 | 我PARP-1与威尼斯平底渔船 | 绑定 | 15247263 |
SFPQ | POMP100 | PSF | 剪接因子多为脯氨酸/段位(结合蛋白相关) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9756848 |
SFPQ | POMP100 | PSF | 剪接因子多为脯氨酸/段位(结合蛋白相关) | Top1与PSF | 绑定 | 9756848 |
SFRS1 | ASF | MGC5228 | SF2 | SF2p33 | SRp30a | 剪接因子,精氨酸/ serine-rich 1 | - - - - - - | HPRD | 9611241 | 9611241 |
SFRS1 | ASF | MGC5228 | SF2 | SF2p33 | SRp30a | 剪接因子,精氨酸/ serine-rich 1 | 西部 重新组成复杂 |
BioGRID | 9611241|12270705 |
SFRS11 | DKFZp686M13204 | dJ677H15.2 |意味着 | 剪接因子,精氨酸/ serine-rich 11 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9756848 |
SUMO1 | DAP-1 | GMP1 | OFC10 | PIC1 | SENP2 | SMT3 | SMT3C | SMT3H3 | SUMO-1 | UBL1 | SMT3 mif抑制两个3同族体1(酵母) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11709553 |
TAL1 | sci | TCL5 | bHLHa17 | tal-1 | t细胞急性淋巴细胞白血病1 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 16407974 |
TDP1 | FLJ11090 | MGC104252 | tyrosyl-DNA磷酸二酯酶1 | - - - - - - | HPRD | 12618186 |
TOP1 | 遮阳帽 | 拓扑异构酶(DNA) | Top1与Top1形成为。 | 绑定 | 9756848 |
TOPORS | LUN | P53BP3 | RP31 | TP53BPL | 拓扑异构酶我绑定,精氨酸/ serine-rich | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10352183 |
TP53 | FLJ92943 | LFS1 | TRP53 | p53 | 肿瘤蛋白质p53 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10468612 |
UBE2I | C358B7.1 | P18 | UBC9 | ubiquitin-conjugating酶E2I (UBC9同系物、酵母) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10759568 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
PID半胱天冬酶通路 | 52 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
森古普塔和LMP1鼻咽癌 | 408年 | 247年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迪亚兹慢性MEYLOGENOUS白血病 | 1382年 | 904年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
王LMO4 DN的目标 | 352年 | 225年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
奥斯曼膀胱癌了 | 404年 | 246年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BILBAN B CLL LPL | 63年 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MULLIGHAN NPM1突变签名1 | 276年 | 165年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MULLIGHAN NPM1签名3 | 341年 | 197年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SENESE HDAC1目标了 | 457年 | 269年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SENESE HDAC3目标了 | 501年 | 327年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
长岛NRG1信号了 | 176年 | 123年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金正日WT1目标8小时 | 164年 | 122年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
WAMUNYOKOLI卵巢癌LMP | 265年 | 158年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
罗德里格斯甲状腺未分化癌 | 722年 | 443年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
HAHTOLA SEZARY通气了 | 98年 | 58 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
HAHTOLA蕈样了 | 19 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KOKKINAKIS蛋氨酸剥夺48小时DN | 64年 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KOKKINAKIS蛋氨酸不足96小时DN | 75年 | 50 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CHIARADONNA肿瘤转化喀斯特 | 126年 | 72年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
转换CDC25 CHIARADONNA肿瘤 | 120年 | 73年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
滑落紫外线反应通过ERCC3运输大亨DN | 84年 | 63年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李在肺癌放大 | 178年 | 108年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
在软组织癌症HEIDENBLAD放大 | 13 | 7 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
通过ERCC3 DN滑落紫外线反应 | 855年 | 609年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GRUETZMANN胰腺癌起来 | 358年 | 245年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA XPRSS INT网络 | 168年 | 103年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652年 | 1023年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA BRCA2 PCC网络 | 423年 | 265年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA ATM PCC网络 | 1442年 | 892年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779年 | 480年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA BRCA为中心的网络 | 117年 | 72年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
FALVELLA吸烟与肺癌 | 80年 | 52 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
魏MYCN目标与E箱 | 795年 | 478年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GOTZMANN上皮间充质转变 | 69年 | 55 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH MYC和上述目标 | 230年 | 156年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH自行车基因 | 648年 | 385年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
AMIT EGF响应240海拉 | 60 | 43 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
乔治细胞周期MIR192目标 | 62年 | 46 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
乔治MIR192和MIR215的目标 | 893年 | 528年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
考夫曼DNA修复基因 | 230年 | 137年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
史密斯叔目标了 | 145年 | 91年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
挞挞浆细胞VS PLASMABLAST DN | 309年 | 206年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
费尔南德斯受MYC | 182年 | 116年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NEMETH炎症反应有限合伙人 | 88年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿尔茨海默病DN布莱洛克的 | 1237年 | 837年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SESTO应对紫外线C2 | 54 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
霁应对FSH DN | 58 | 43 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
击倒老化肌肉DN | 123年 | 76年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
布朗感染血巨细胞病毒14人力资源 | 156年 | 101年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
预告BRCA1目标了 | 21 | 16 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
千叶应对TSA DN | 23 | 14 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿尔茨海默病早期布莱洛克的DN | 165年 | 106年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
布朗感染血巨细胞病毒10人力资源 | 101年 | 69年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
伯顿脂肪形成峰值在8小时 | 39 | 31日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马丁内斯应对TRABECTEDIN DN | 271年 | 175年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
《图片报》极品致癌签名 | 261年 | 166年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
《图片报》CTNNB1致癌签名 | 82年 | 52 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
郑FOXP3在胸腺的目标 | 196年 | 137年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由喀斯特IWANAGA致癌PTEN | 181年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
营地结肠癌拷贝数 | 92年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GRESHOCK癌症拷贝数 | 323年 | 240年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
了吉西他滨阻力DN | 122年 | 84年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BOHN原发性免疫缺陷症侯群DN | 40 | 31日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
LINDSTEDT树突状细胞成熟D | 68年 | 44 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
公园维甲酸反应和PML RARA融合 | 30. | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA乳腺癌与BRCA1突变的DN | 9 | 5 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
HAHTOLA CTCL皮肤 | 26 | 19 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
党由MYC | 72年 | 53 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
党MYC目标了 | 143年 | One hundred. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
党受MYC | 1103年 | 714年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
WHITFIELD细胞周期G1 | 148年 | 95年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
国外RB1目标衰老 | 572年 | 352年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
若林史江脂肪生成PPARG 8 d | 658年 | 397年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |