基因页：TP53BP1
概括？
| 基因 | 7158 |
| 象征 | TP53BP1 |
| 同义词 | 53BP1 | TDRD30 | TP53 | P202 | P53BP1 |
| 描述 | 肿瘤蛋白p53结合蛋白1 |
| 参考 | MIM：605230|HGNC：HGNC：11999|Ensembl：ENSG0000000067369|HPRD：05569|Vega：Otthumg0000000059757 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 15Q15-Q21 |
| Pascal P值 | 4.038E-4 |
| Sherlock P值 | 0.038 |
| 胎儿β | 0.318 |
| 支持 | G2CDB.HUMANNRC G2CDB.HUMANPSP Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| OCM | 0.60 | 0.33 |
| IGSF10 | 0.54 | 0.61 |
| TACR3 | 0.54 | 0.53 |
| arhgap6 | 0.53 | 0.30 |
| ODZ1 | 0.48 | 0.68 |
| luzp2 | 0.48 | 0.52 |
| SLC41A2 | 0.47 | 0.65 |
| RP3-402H5.1 | 0.47 | 0.56 |
| SCN9A | 0.47 | 0.65 |
| CSMD3 | 0.47 | 0.68 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-CO2 | -0.26 | -0.50 |
| higd1b | -0.26 | -0.51 |
| AC098691.2 | -0.26 | -0.49 |
| AF347015.2 | -0.26 | -0.47 |
| C11orf67 | -0.25 | -0.45 |
| CSAG1 | -0.25 | -0.42 |
| mt-cyb | -0.25 | -0.47 |
| AF347015.8 | -0.24 | -0.48 |
| AF347015.33 | -0.24 | -0.46 |
| AF347015.31 | -0.24 | -0.47 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| ATM | AT1 |ata |ATC |ATD |ATDC |吃饭|DKFZP781A0353 |MGC74674 |Tel1 |Telo1 | 毛细血管炎突变 | 生化活动 重构的复合物 |
Biogrid | 12447390|12697768 |
| BLM | BS |MGC126616 |MGC131618 |MGC131620 |recq2 |recql2 |RECQL3 | 布卢姆综合症 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 共定位 |
Biogrid | 15364958 |
| BRCA1 | Brcai |BRCC1 |虹膜|PSCP |RNF53 | 乳腺癌1，早发 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 17525332 |
| CHEK1 | CHK1 | CHK1检查点同源物（S. Pombe） | 共定位 | Biogrid | 15364958 |
| CHEK2 | CDS1 |chk2 |hucds1 |LFS2 |pp1425 |RAD53 | CHK2检查点同源物（S. Pombe） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 17525332 |
| dclre1a | KIAA0086 |PSO2 |SNM1 |snm1a |HSNM1 | DNA交叉链接修复1A（PSO2同源物，S。cerevisiae） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12446782 |
| dclre1c | a-scid |dclrec1c |FLJ11360 |FLJ36438 |RS-SCID |Scida |SNM1C | DNA交叉链接修复1C（PSO2同源物，S。cerevisiae） | Artemis与53BP1相互作用。 | 绑定 | 15574327 |
| DCTN1 | DAP-150 |DP-150 |HMN7B |P135 | Dynactin 1（P150，胶合同源物，果蝇） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 15611139 |
| dynll1 | DLC1 |DLC8 |DNCL1 |DNClc1 |LC8 |LC8A |MGC126137 |MGC126138 |PIN |HDLC1 | Dynein，轻链，LC8型1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 蛋白质肽 两个杂交 |
Biogrid | 15611139 |
| E2F1 | E2F-1 |RBAP1 |rbbp3 |rbp3 | E2F转录因子1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 8896460 |
| H2AFX | h2a.x |H2A/X |H2AX | H2A组蛋白家族，成员X | - | HPRD，Biogrid | 12697768 |
| MDC1 | DKFZP781A0122 |KIAA0170 |MGC166888 |NFBD1 | DNA损伤检查点1 | - | HPRD | 12607005 |
| NEK1 | DKFZP686D06121 |DKFZP686K12169 |KIAA1901 |MGC138800 |NY-REN-55 | NIMA（从不在有丝分裂基因A）相关激酶1 | NEK1与53BP1相互作用。 | 绑定 | 14690447 |
| NFKB1 | DKFZP686C01211 |EBP-1 |kbf1 |MGC54151 |nf-kappa-b |NFKB-P105 |NFKB-P50 |P105 | B细胞中Kappa光多肽基因增强子的核因子1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10646849 |
| PAXIP1 | CAGF28 |CAGF29 |FLJ41049 |PACIP1 |paxip1l |ptip |TNRC2 | PAX相互作用（与转录激活结构域）蛋白1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 14576432|15456759 |
| RPA1 | HSSB |repa1 |RF-A |RP-A |RPA70 | 复制蛋白A1，70KDA | 亲和力捕获ms 亲和力捕获 - 韦斯特恩 |
Biogrid | 15856006 |
| RPA2 | repa2 |RPA32 | 复制蛋白A2，32KDA | 亲和力捕获ms 亲和力捕获 - 韦斯特恩 |
Biogrid | 15856006 |
| TFDP1 | DP1 |drtf1 |DP-1 | 转录因子DP-1 | 重构的复合物 | Biogrid | 8896460 |
| TP53 | FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 | 肿瘤蛋白p53 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 共晶结构 共定位 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 8016121|11877378 |12110597|12351827 |14978302|15364958 |15611139 |
| TP53 | FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 | 肿瘤蛋白p53 | - | HPRD | 8016121|12110597 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID ATM路径 | 34 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome同源重组修复复制独立双链断裂 | 17 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Double Strand Break修复 | 24 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome DNA修复 | 112 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马丁与HDAC互动 | 44 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana乳腺癌点燃int网络 | 101 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 里克曼转移 | 344 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kauffmann DNA修复基因 | 230 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HOXA9和MEIS1的赫斯目标 | 65 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chiaretti急性淋巴细胞白血病ZAP70 | 67 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhu CMV 8小时DN | 53 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Takao对UVB辐射DN的响应 | 98 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhu CMV全部DN | 128 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张乳腺癌祖细胞 | 425 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yauch刺猬信号传导旁分泌DN | 264 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoshida肝癌亚类S1 | 237 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rao由Sall4绑定 | 227 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |