基因页面:TPH1
总结吗?
GeneID | 7166年 |
象征 | TPH1 |
同义词 | TPRH | TRPH |
描述 | 色氨酸羟化酶1 |
参考 | MIM: 191060|HGNC: HGNC: 12008|HPRD: 01846| |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 11 p15.3-p14 |
帕斯卡假定值 | 0.006 |
胎儿β | -0.202 |
支持 | 神经递质代谢 5 -羟色胺 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
协会 | 综合优势比方法(太阳et al . 2008),协会研究 | 2 | 链接到SZGene |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,精神分裂症患者,神经 | 点击显示详细信息 |
GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 | |
网络 | 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 | 贡献在PPI网络最短路径:31 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TPH1_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005506 | 铁离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0004497 | 单氧酶活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0004510 | 色氨酸5-monooxygenase活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016597 | 氨基酸绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0046872 | 金属离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0006587 | 5 -羟色胺从色氨酸生物合成的过程 | 国际能源机构 | 5 -羟色胺神经递质(术语层面:10) | - - - - - - |
去:0009072 | 芳香族氨基酸家庭代谢过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0008152 | 代谢过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0055114 | 氧化还原 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG色氨酸代谢 | 40 | 33 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA神经递质通路 | 6 | 5 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME氨基酸代谢和衍生品 | 200年 | 136年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME胺衍生的激素 | 15 | 12 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
萨瓦特结直肠腺瘤DN | 291年 | 176年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MARKEY RB1慢性LOF DN | 118年 | 78年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
桑塞姆APC DN的目标 | 366年 | 238年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
AFFAR YY1目标了 | 214年 | 133年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
近藤H3K27ME3前列腺癌 | 196年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
甜蜜的肺癌喀斯特DN | 435年 | 289年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |