基因页：TPM2
概括？
| 基因 | 7169 |
| 象征 | TPM2 |
| 同义词 | AMCD1 | DA1 | DA2B | HEL-S-273 | NEM4 | TMSB |
| 描述 | 肌球蛋白2（beta） |
| 参考 | MIM：190990|HGNC：HGNC：12011|Ensembl：ENSG00000198467|HPRD：11768|Vega：Otthumg0000000019878 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 9P13 |
| Pascal P值 | 0.32 |
| Sherlock P值 | 0.002 |
| 胎儿β | -1.147 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马 伏隔核基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | G2CDB.HUMAN_CLATHRIN g2cdb.human_synaptosom |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 | 2 |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：0.0044 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG12876594 | 9 | 35791798 | TPM2 | 5.541E-4 | 3.568 | DMG：Vaneijk_2014 | |
| CG12876594 | 9 | 35791798 | TPM2 | 9.201E-4 | 3.347 | DMG：Vaneijk_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS13293550 | Chr9 | 34983189 | TPM2 | 7169 | 0.01 | 顺式 | ||
| RS6434664 | CHR2 | 195031931 | TPM2 | 7169 | 0.01 | 反式 | ||
| RS4307179 | CHR6 | 98484452 | TPM2 | 7169 | 0.17 | 反式 | ||
| RS9488462 | CHR6 | 115053997 | TPM2 | 7169 | 0.17 | 反式 | ||
| RS17135547 | Chr11 | 77037398 | TPM2 | 7169 | 0.04 | 反式 | ||
| RS7303819 | CHR12 | 33990776 | TPM2 | 7169 | 0.07 | 反式 | ||
| RS10879027 | CHR12 | 70237156 | TPM2 | 7169 | 0.01 | 反式 | ||
| RS933577 | CHR17 | 53452334 | TPM2 | 7169 | 0.13 | 反式 | ||
| RS2838518 | CHR21 | 45614801 | TPM2 | 7169 | 0.12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003779 | 肌动蛋白结合 | 艾达 | 17194691 | |
| 去：0008307 | 肌肉的结构成分 | 塔斯 | 7606936 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0043462 | ATPase活性调节 | 艾达 | 17194691 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005856 | 细胞骨架 | IEA | - | |
| 去：0005862 | 肌肉薄丝对肌球蛋白 | 塔斯 | 7606936 | |
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Kegg心肌收缩 | 80 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG肥厚性心肌病HCM | 85 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG扩张心肌病 | 92 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组横纹的肌肉收缩 | 27 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组肌肉收缩 | 48 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome平滑肌收缩 | 25 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 刘前列腺癌DN | 481 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bertucci髓质与导管乳腺癌DN | 169 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Provenzani转移 | 194 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal乳房5 6WK | 116 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LUI甲状腺癌PAX8 PPARG UP | 44 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal TGFB1靶向 | 169 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mahadevan GIST形态开关 | 15 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 悍马皮肤癌进度DN | 100 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇2B | 392 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LUI甲状腺癌簇2 | 42 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 UP | 309 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Tomlins前列腺癌DN | 40 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 狮子转移 | 539 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 里克曼头颈癌F | 54 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WU细胞迁移 | 184 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath MYC带Ebox的目标 | 230 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee肝癌ACOX1 DN | 65 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿斯顿主要抑郁症 | 49 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 费尔南德斯（Fernandez）由迈克（Myc）约束 | 182 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 宁慢性阻塞性肺疾病 | 157 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ferrando T与MLL融合一起 | 87 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Haslinger B Cll，有13Q14删除 | 24 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Petrova内皮淋巴与血液DN | 162 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML生存 | 129 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kaab失败的心房DN | 141 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染24小时DN | 148 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染14小时DN | 298 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 卫星对干扰素βdn的响应 | 52 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhu CMV 24小时DN | 91 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhu CMV全部DN | 128 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kuninger IGF1与PDGFB的目标 | 82 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 common | 77 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rizki肿瘤侵入性3D DN | 270 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boquest干细胞培养与新鲜 | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chang Core血清反应 | 212 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner NPC HCP，含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 | 269 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| cro骨基质刺激 | 60 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Croonquist NRA与基质刺激DN | 99 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Valk AML群集10 | 33 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Poola侵入性乳腺癌DN | 134 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| woo肝癌复发 | 105 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoshida肝癌亚类S1 | 237 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sasson对促性腺营养蛋白DN的反应 | 87 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sasson对Forskolin DN的反应 | 88 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染2小时DN | 49 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hirsch细胞转化特征dn | 103 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wierenga Stat5a靶向DN | 213 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pasini suz12靶向DN | 315 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Delacroix Rarg Bound MEF | 367 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Delacroix RAR目标DN | 24 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 前列腺癌模型DN中的Acevedo FGFR1靶标 | 308 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 林乳腺干细胞向上 | 489 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chemello Moleus vs Edl肌纤维向上 | 35 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |