基因页:C2
概括?
基因 | 717 |
象征 | C2 |
同义词 | ARMD14 | CO2 |
描述 | 补体组件2 |
参考 | MIM:613927|HGNC:HGNC:1248|ENSEMBL:ENSG00000166278|HPRD:08939|Vega:Otthumg00000031190 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6p21.3 |
Pascal P值 | 1E-12 |
胎儿β | -1.03 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.033 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG16414425 | 6 | 31865522 | C2 | 5.22e-10 | -0.03 | 8.72E-7 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/C2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C4A | 0.82 | 0.57 |
ITGB4 | 0.80 | 0.71 |
GFAP | 0.76 | 0.67 |
ENTPD2 | 0.70 | 0.63 |
C9orf61 | 0.68 | 0.65 |
plin | 0.68 | 0.55 |
aplnr | 0.68 | 0.37 |
AC015908.2 | 0.66 | 0.43 |
EFEMP1 | 0.65 | 0.60 |
RASL12 | 0.64 | 0.59 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
DPP4 | -0.28 | -0.35 |
BZW2 | -0.28 | -0.35 |
khdrbs3 | -0.28 | -0.35 |
arl4d | -0.27 | -0.26 |
NOL4 | -0.27 | -0.30 |
NR2C2AP | -0.27 | -0.32 |
SRPK1 | -0.27 | -0.31 |
plekho1 | -0.27 | -0.27 |
STMN1 | -0.27 | -0.32 |
PAK7 | -0.27 | -0.29 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004252 | 丝氨酸型内肽酶活性 | IEA | 谷氨酸(GO期限:7) | - |
去:0008233 | 肽酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006508 | 蛋白水解 | IEA | - | |
去:0006957 | 补体激活,替代途径 | 经验 | 162484 | |
去:0006958 | 补体激活,经典途径 | 塔斯 | 8621452 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | 经验 | 6019133|12878586|15199963 |
|
去:0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
去:0005615 | 细胞外空间 | 塔斯 | 8621452 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg补充和凝结级联 | 69 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg系统性狼疮红斑 | 140 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta经典途径 | 14 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Comp Pathway | 19 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
生物卡塔尔凝集素途径 | 12 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组的补体级联 | 14 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome先天免疫系统 | 279 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome补充级联 | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome初始触发补充 | 16 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤 | 205 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
渡边直肠癌放疗反应能力 | 108 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN | 463 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
chebotaev gr目标dn | 120 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Markey RB1急性lof | 215 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gruetzmann胰腺癌 | 358 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cervera SDHB目标2 | 114 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ross AML带有MLL融合 | 78 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕色髓样细胞的发育 | 165 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HSIAO肝特异性基因 | 244 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
纳德勒肥胖DN | 48 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1的Verhaak AML突变 | 183 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bennett系统性狼疮红斑 | 31 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nielsen Gist和滑膜肉瘤DN | 20 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McClung可卡因奖励4WK | 75 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ABE VEGFA目标30分钟 | 29 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肺癌和巨噬细胞的钟分泌组 | 77 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肺癌和内皮的钟分泌组 | 66 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肺癌和成纤维细胞的钟分泌组 | 132 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN | 373 | 196 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KRAS和STK11 DN的JI致癌作用 | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaurnier PSMD4目标 | 73 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2 CDC25A的射线肿瘤发生 | 104 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李肝癌的生存 | 185 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang MLL目标 | 289 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |