概括
基因 717
象征 C2
同义词 ARMD14 | CO2
描述 补体组件2
参考 MIM:613927|HGNC:HGNC:1248|ENSEMBL:ENSG00000166278|HPRD:08939|Vega:Otthumg00000031190
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6p21.3
Pascal P值 1E-12
胎儿β -1.03
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.033
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG16414425 6 31865522 C2 5.22e-10 -0.03 8.72E-7 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C4A 0.82 0.57
ITGB4 0.80 0.71
GFAP 0.76 0.67
ENTPD2 0.70 0.63
C9orf61 0.68 0.65
plin 0.68 0.55
aplnr 0.68 0.37
AC015908.2 0.66 0.43
EFEMP1 0.65 0.60
RASL12 0.64 0.59
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
DPP4 -0.28 -0.35
BZW2 -0.28 -0.35
khdrbs3 -0.28 -0.35
arl4d -0.27 -0.26
NOL4 -0.27 -0.30
NR2C2AP -0.27 -0.32
SRPK1 -0.27 -0.31
plekho1 -0.27 -0.27
STMN1 -0.27 -0.32
PAK7 -0.27 -0.29

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004252 丝氨酸型内肽酶活性 IEA 谷氨酸(GO期限:7) -
去:0008233 肽酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006508 蛋白水解 IEA -
去:0006957 补体激活,替代途径 经验 162484
去:0006958 补体激活,经典途径 塔斯 8621452
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 经验 6019133|12878586|15199963
去:0005576 细胞外区域 IEA -
去:0005615 细胞外空间 塔斯 8621452

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg补充和凝结级联 69 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg系统性狼疮红斑 140 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta经典途径 14 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Comp Pathway 19 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
生物卡塔尔凝集素途径 12 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组的补体级联 14 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome先天免疫系统 279 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome补充级联 32 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome初始触发补充 16 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤 205 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
渡边直肠癌放疗反应能力 108 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN 463 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chebotaev gr目标dn 120 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Markey RB1急性lof 215 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gruetzmann胰腺癌 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cervera SDHB目标2 114 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ross AML带有MLL融合 78 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕色髓样细胞的发育 165 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HSIAO肝特异性基因 244 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
纳德勒肥胖DN 48 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1的Verhaak AML突变 183 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bennett系统性狼疮红斑 31 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nielsen Gist和滑膜肉瘤DN 20 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung可卡因奖励4WK 75 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ABE VEGFA目标30分钟 29 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肺癌和巨噬细胞的钟分泌组 77 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肺癌和内皮的钟分泌组 66 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肺癌和成纤维细胞的钟分泌组 132 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN 373 196 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRAS和STK11 DN的JI致癌作用 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaurnier PSMD4目标 73 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2 CDC25A的射线肿瘤发生 104 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李肝癌的生存 185 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang MLL目标 289 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因