基因页面:TPM3

总结吗?
GeneID 7170年
象征 TPM3
同义词 CAPM1 | CFTD | hel - 189 |帮助- s - 82 p | NEM1 | OK / SW-cl.5 | TM-5 | TM3 | TM30 | TM30nm | TM5 | TPMsk3 |载重汽车| hscp30
描述 原肌球蛋白3
参考 MIM: 191030|HGNC: HGNC: 12012|运用:ENSG00000143549|HPRD: 01840|织女:OTTHUMG00000035853
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 1 q21.2
夏洛克假定值 0.951
胎儿β 2.778
DMG 1(#研究)
eGene 元
支持 G2Cdb.humanPSD
G2Cdb.humanPSP
CompositeSet

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 1
GSMA_I 基因组扫描分析 Psr: 0.0235
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) Psr: 0.00814
GO_Annotation neuro-related关键字映射到基因本体论注释 支安打与neuro-related关键词:2

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg24546083 1 154155925 TPM3 2.81 e-5 -0.339 0.018 DMG: Wockner_2014


第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

没有大脑中的基因区域


第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0003779 肌动蛋白结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0003674 molecular_function ND - - - - - -
去:0005515 蛋白结合 新闻学会 17353931
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0006937 调节肌肉收缩 NAS - - - - - -
去:0006928 细胞运动 助教 16130169
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0043005 神经元投射 国际能源机构 神经元,轴突、轴突、树突(术语层面:5) - - - - - -
去:0030426 生长锥 国际能源机构 轴突、树突(术语层面:5) - - - - - -
去:0002102 podosome 国际能源机构 - - - - - -
去:0005856 细胞骨架 NAS 3418707
去:0005856 细胞骨架 助教 16130169
去:0005862 肌肉薄丝原肌球蛋白 助教 3018581
去:0005737 细胞质 国际能源机构 - - - - - -
去:0032154 卵裂沟 国际能源机构 - - - - - -
去:0031941 丝状肌动蛋白 国际能源机构 - - - - - -
去:0030863 皮层细胞骨架 国际能源机构 - - - - - -

第四部分,注释蛋白质间交互作用

扶少团团员 别名B 官方全名B 实验 源 PubMed ID
ACTB PS1TP5BP1 肌动蛋白,β - - - - - - HPRD 9108196
C19orf50 FLJ25480 | MGC2749 | MST096 | MSTP096 19号染色体50开放阅读框 2台混合动力 BioGRID 16189514
柷 IKBKA | IKK-alpha | IKK1 | IKKA | NFKBIKA | TCF16 守恒helix-loop-helix无处不在的激酶 - - - - - - HPRD 14743216
CNN1 SMCC | Sm-Calp calponin 1基本平滑肌 - - - - - - HPRD 2161834|2455687
EIF4A2 bm - 010 | DDX2B | EIF4A | EIF4F 真核翻译起始因子4,同种型2 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
IKBKE IKK-i | IKKE | IKKI | KIAA0151 | MGC125294 | MGC125295 | MGC125297 在b细胞抑制剂kappa光多肽基因的增强剂,激酶ε - - - - - - HPRD 14743216
世纪挑战集团 DKFZp762O1615 | FLJ38893 | FLJ46755 | MCC1 突变在结肠直肠癌 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
RIPK3 RIP3 receptor-interacting serine-threonine激酶3 - - - - - - HPRD 14743216
S100A4 18 42 a2 | | CAPL | FSP1 | MTS1 | P9KA | PEL98 S100钙结合蛋白A4 - - - - - - HPRD 8120097
TFPT FB1 | INO80F |阿弥陀佛 TCF3 (ea2)融合伙伴(在儿童期白血病) 2台混合动力 BioGRID 16189514
TPM3 FLJ41118 | MGC14582 | MGC3261 | MGC72094 | NEM1 |好吧/ SW-cl。5 | TM-5 | TM3 | TM30 | TM30nm | TPMsk3 |载重汽车| hscp30 原肌球蛋白3 - - - - - - HPRD 2161834|2455687
TPM3 FLJ41118 | MGC14582 | MGC3261 | MGC72094 | NEM1 |好吧/ SW-cl。5 | TM-5 | TM3 | TM30 | TM30nm | TPMsk3 |载重汽车| hscp30 原肌球蛋白3 亲和力Capture-Western BioGRID 7568216


部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
KEGG心脏肌肉收缩 80年 51 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG通路在癌症 328年 259年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG甲状腺癌 29日 26 所有SZGR 2.0基因通路
HCM KEGG肥厚性心肌病 85年 65年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG扩张型心肌病 92年 68年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME横纹肌收缩 27 12 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME肌肉收缩 48 24 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME平滑肌收缩 25 14 所有SZGR 2.0基因通路
ODONNELL TFRC目标了 456年 228年 所有SZGR 2.0基因通路
通过血清剥夺DN GRAESSMANN细胞凋亡 234年 147年 所有SZGR 2.0基因通路
GRAESSMANN MC和血清剥夺DN 84年 54 所有SZGR 2.0基因通路
由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 1781年 1082年 所有SZGR 2.0基因通路
GRAESSMANN MC和阿霉素DN 770年 415年 所有SZGR 2.0基因通路
DARWICHE皮肤肿瘤促进剂DN 185年 115年 所有SZGR 2.0基因通路
DARWICHE乳头状瘤风险低的DN 165年 107年 所有SZGR 2.0基因通路
DARWICHE乳头状瘤风险高的DN 180年 110年 所有SZGR 2.0基因通路
DARWICHE鳞状细胞癌DN 181年 107年 所有SZGR 2.0基因通路
MYLLYKANGAS放大热点17 25 12 所有SZGR 2.0基因通路
MYLLYKANGAS放大热点24 14 7 所有SZGR 2.0基因通路
留置权乳腺癌组织转化的 35 25 所有SZGR 2.0基因通路
洛佩兹MBD的目标 957年 597年 所有SZGR 2.0基因通路
洛克伍德在肺癌放大 214年 139年 所有SZGR 2.0基因通路
拉赫曼TP53目标磷酸化 21 18 所有SZGR 2.0基因通路
魏MYCN目标与E箱 795年 478年 所有SZGR 2.0基因通路
SCHAEFFER前列腺癌发展6小时DN 514年 330年 所有SZGR 2.0基因通路
里克曼头部和颈部癌症F 54 32 所有SZGR 2.0基因通路
GOTZMANN上皮间充质转变DN 206年 136年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH SOX2目标 734年 436年 所有SZGR 2.0基因通路
ROZANOV MMP14目标了 266年 171年 所有SZGR 2.0基因通路
通过NOVA2 ULE拼接 43 38 所有SZGR 2.0基因通路
RODWELL肾脏老化了 487年 303年 所有SZGR 2.0基因通路
伊万诺娃造血干细胞和祖 681年 420年 所有SZGR 2.0基因通路
道格拉斯BMI1 DN的目标 314年 188年 所有SZGR 2.0基因通路
KRIGE TOSEDOSTAT反应6小时DN 911年 527年 所有SZGR 2.0基因通路
KRIGE应对TOSEDOSTAT 24小时DN 1011年 592年 所有SZGR 2.0基因通路
检查参与组成分泌腺中肺癌和内皮 66年 47 所有SZGR 2.0基因通路
CREIGHTON内分泌治疗抵抗1 528年 324年 所有SZGR 2.0基因通路
近藤EZH2的目标 245年 148年 所有SZGR 2.0基因通路
结肠癌年级了 871年 505年 所有SZGR 2.0基因通路
王肿瘤侵袭性DN 210年 128年 所有SZGR 2.0基因通路
GRESHOCK癌症拷贝数 323年 240年 所有SZGR 2.0基因通路
BOYLAN多发性骨髓瘤C集群 38 26 所有SZGR 2.0基因通路
BOYLAN多发性骨髓瘤C D 139年 95年 所有SZGR 2.0基因通路
张核心血清反应 212年 128年 所有SZGR 2.0基因通路
陈代谢症侯群网络 1210年 725年 所有SZGR 2.0基因通路
非政府组织的恶性神经胶质瘤1 p LOH 17 13 所有SZGR 2.0基因通路
VERHAAK胶质母细胞瘤神经 129年 85年 所有SZGR 2.0基因通路
DN WIERENGA STAT5A目标 213年 127年 所有SZGR 2.0基因通路
DN PILON KLF1目标 1972年 1213年 所有SZGR 2.0基因通路
IKEDA MIR1目标了 53 39 所有SZGR 2.0基因通路
施泰纳红血球膜基因 15 10 所有SZGR 2.0基因通路
KRIEG KDM3A目标不缺氧 208年 107年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 433 - 5 - p 4 10 m8 hsa - mir - 433 - 5 - p UACGGUGAGCCUGUCAUUAUUC