基因页:TPO
概括?
基因 | 7173 |
象征 | TPO |
同义词 | MSA | TDH2A | TPX |
描述 | 甲状腺过氧化物酶 |
参考 | MIM:606765|HGNC:HGNC:12015|ENSEMBL:ENSG00000115705|HPRD:06000|Vega:Otthumg0000000090271 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2P25 |
Pascal P值 | 0.621 |
胎儿β | -0.111 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG08946720 | 2 | 1416855 | TPO | 7.65e-5 | 0.47 | 0.025 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TPO_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FAM40A | 0.94 | 0.96 |
VPS16A | 0.94 | 0.96 |
UBA1 | 0.94 | 0.95 |
PARP6 | 0.93 | 0.94 |
GLT25D1 | 0.93 | 0.94 |
mast2 | 0.92 | 0.95 |
WDR6 | 0.92 | 0.92 |
GPR173 | 0.92 | 0.96 |
FGD1 | 0.92 | 0.94 |
RIC8A | 0.92 | 0.94 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.27 | -0.82 | -0.91 |
MT-CO2 | -0.81 | -0.89 |
AF347015.33 | -0.81 | -0.89 |
AF347015.31 | -0.81 | -0.88 |
AF347015.8 | -0.79 | -0.90 |
mt-cyb | -0.79 | -0.87 |
AF347015.15 | -0.77 | -0.87 |
FXYD1 | -0.76 | -0.84 |
AF347015.2 | -0.75 | -0.87 |
S100B | -0.75 | -0.83 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg酪氨酸代谢 | 42 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 | 267 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg jak stat信号通路 | 155 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG造血细胞谱系 | 88 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG自身免疫性甲状腺疾病 | 53 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
氨基酸和衍生物的反应组代谢 | 200 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组胺衍生的激素 | 15 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌DN | 232 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LastOwska与MYCN二式增长 | 43 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
瓦特自动甲状腺腺瘤 | 73 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈神经母细胞瘤副本编号收益 | 50 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
克莱因原发性积液淋巴瘤 | 51 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha线粒体 | 447 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA分泌因素 | 344 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |