基因页:tpte
概括?
基因 | 7179 |
象征 | tpte |
同义词 | CT44 | PTEN2 |
描述 | 跨膜磷酸酶,具有长素同源性 |
参考 | MIM:604336|HGNC:HGNC:12023|ENSEMBL:ENSG00000274391|HPRD:05064|Vega:Otthumg0000000074127 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 21p11 |
胎儿β | -0.44 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS11682393 | CHR2 | 47804496 | tpte | 7179 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TPTE_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C1orf127 | 0.79 | 0.34 |
帕帕 | 0.74 | 0.44 |
引用 | 0.73 | 0.50 |
PTPN3 | 0.73 | 0.46 |
tuba8 | 0.72 | 0.39 |
GRM4 | 0.72 | 0.65 |
inpp5a | 0.72 | 0.70 |
BTBD11 | 0.72 | 0.43 |
PCP4 | 0.72 | 0.36 |
VWC2 | 0.71 | 0.45 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
WDR86 | -0.23 | -0.13 |
AL139819.3 | -0.22 | -0.45 |
AF347015.2 | -0.21 | -0.37 |
FAM159B | -0.20 | -0.34 |
Plac9 | -0.20 | -0.38 |
fthl16 | -0.20 | -0.19 |
C2orf84 | -0.20 | -0.19 |
AF347015.21 | -0.19 | -0.38 |
AP000679.1 | -0.19 | -0.32 |
EMX2 | -0.19 | -0.35 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kim WT1靶向DN | 459 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yegnasubramanian前列腺癌 | 128 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
韦伯甲基化的HCP成纤维细胞DN | 42 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
精子中的韦伯甲基化的HCP | 20 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chen Hoxa5靶向9小时 | 223 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |