概括
基因 7179
象征 tpte
同义词 CT44 | PTEN2
描述 跨膜磷酸酶,具有长素同源性
参考 MIM:604336|HGNC:HGNC:12023|ENSEMBL:ENSG00000274391|HPRD:05064|Vega:Otthumg0000000074127
基因类型 蛋白质编码
地图位置 21p11
胎儿β -0.44
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS11682393 CHR2 47804496 tpte 7179 0.15 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C1orf127 0.79 0.34
帕帕 0.74 0.44
引用 0.73 0.50
PTPN3 0.73 0.46
tuba8 0.72 0.39
GRM4 0.72 0.65
inpp5a 0.72 0.70
BTBD11 0.72 0.43
PCP4 0.72 0.36
VWC2 0.71 0.45
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
WDR86 -0.23 -0.13
AL139819.3 -0.22 -0.45
AF347015.2 -0.21 -0.37
FAM159B -0.20 -0.34
Plac9 -0.20 -0.38
fthl16 -0.20 -0.19
C2orf84 -0.20 -0.19
AF347015.21 -0.19 -0.38
AP000679.1 -0.19 -0.32
EMX2 -0.19 -0.35

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kim WT1靶向DN 459 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yegnasubramanian前列腺癌 128 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
韦伯甲基化的HCP成纤维细胞DN 42 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
精子中的韦伯甲基化的HCP 20 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen Hoxa5靶向9小时 223 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因