基因页：HSP90B1

概括？
基因 7184
象征 HSP90B1
同义词 ECGP | GP96 | GRP94 | HEL-S-125M | HEL35 | TRA1
描述 热休克蛋白90KDA beta家族成员1
参考 MIM：191175|HGNC：HGNC：12028|ENSEMBL：ENSG00000166598|HPRD：01860|Vega：Otthumg00000170118
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12Q24.2-Q24.3
Pascal P值 0.159
Sherlock P值 0.06
胎儿β -0.665
DMG 1（＃研究）
支持 RNA和蛋白质合成
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP
Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG16721058 12 104324570 HSP90B1 4.36E-8 -0.007 1.2e-5 DMG：JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FAT1 0.77 0.87
Heatr5a 0.76 0.78
pard3b 0.74 0.74
Antxr1 0.73 0.81
PIK3C2A 0.73 0.80
FAM120C 0.73 0.78
Ston2 0.72 0.80
tbl1x 0.72 0.85
MSI2 0.72 0.78
ITGB8 0.71 0.82
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TTC9B -0.29 -0.31
IER5L -0.29 -0.20
IL32 -0.28 -0.35
AF347015.21 -0.27 -0.16
ST20 -0.26 -0.35
纳米3 -0.26 -0.31
AP003068.3 -0.26 -0.34
SLN -0.25 -0.24
SLC26A4 -0.25 -0.21
Sycp3 -0.25 -0.24

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0000166 核苷酸结合 IEA -
去：0003723 RNA结合 艾达 11958450
去：0005509 钙离子结合 塔斯 10497210
去：0005524 ATP结合 IEA -
GO：0051082 展开的蛋白质结合 IEA -
GO：0050750 低密度脂蛋白受体结合 艾达 15082773
GO：0046790 病毒座结合 IPI 11958450
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0001666 对缺氧的反应 艾达 15620698
去：0006457 蛋白质折叠 IEA -
去：0006916 抗凋亡 小鬼 10497210|15192333
去：0006916 抗凋亡 塔斯 16130169
去：0015031 蛋白质运输 nas 15845869
GO：0051208 钙离子的隔离 nas 15192333
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005792 微型体 艾达 10497210
去：0005829 细胞质 艾达 9596688
去：0005788 内质网腔 艾达 10497210
去：0005789 内质网膜 艾达 10497210
去：0005783 内质网 塔斯 16130169
GO：0048471 细胞质的核周区 艾达 10497210
GO：0042470 黑色素体 IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
APOB FLDB 载脂蛋白B（包括AG（X）抗原） - HPRD，Biogrid 12397072
ASGR1 asgpr |CLEC4H1 |HS.12056 Asialogoprotein受体1 - HPRD 12167617
CSNK2A1 CK2A1 |CKII 酪蛋白激酶2，α1多肽 - HPRD，Biogrid 11557039
CSNK2A2 CK2A2 |CSNK2A1 |FLJ43934 酪蛋白激酶2，α素多肽 - HPRD，Biogrid 11557039
EIF2AK3 DKFZP781H1925 |hri |佩克|PERK |WRS 真核翻译起始因子2-α激酶3 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11907036
ERBB2 CD340 |her-2 |her-2/neu |her2 |neu |ngl |TKR1 V-ERB-B2红细胞白血病病毒性癌基因同源2，神经/胶质母细胞瘤衍生的癌基因同源物（Avian） - HPRD，Biogrid 8617772
Fanca fa |FA-H |FA1 |FAA |FACA |法|Fanch |MGC75158 Fanconi贫血，互补小组A 亲和力捕获ms Biogrid 15082718
联邦 FA3 |FAC |FACC |FLJ14675 Fanconi贫血，互补组C 两个杂交 Biogrid 14499622
HSPA9 CSA |GRP75 |HSPA9B |MGC4500 |mot |Mot2 |MTHSP75 |PBP74 |MOT-2 热休克70KDA蛋白9（lortalin） - HPRD 12470827
LRP1 A2MR |apoer |APR |CD91 |FLJ16451 |IGFBP3R |LRP |MGC88725 |TGFBR5 低密度脂蛋白相关蛋白1（Alpha-2-巨球蛋白受体） - HPRD 11861214
Smarca4 BAF190 |BRG1 |FLJ39786 |SNF2 |snf2-beta |snf2l4 |SNF2LB |swi2 |HSNF2B SWI/SNF相关，矩阵相关，染色质的肌动蛋白依赖性调节剂，亚家族A，成员4 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11726552
Smarcc1 BAF155 |cracc1 |RSC8 |srg3 |SWI3 SWI/SNF相关，矩阵相关，染色质的肌动蛋白依赖性调节剂，亚家族C，成员1 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11726552
Smarcc2 BAF170 |cracc2 |RSC8 SWI/SNF相关，矩阵相关，染色质的肌动蛋白依赖性调节剂，亚家族C，成员2 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11726552
TG AITD3 |TGN 甲状腺球蛋白 - HPRD，Biogrid 10049727
TLR2 CD282 |til4 Toll样受体2 - HPRD 11912201
TLR4 ARMD10 |CD284 |收费|htoll Toll样受体4 - HPRD 11912201
vwf f8vwf |vwd 冯·威勒布兰德因素 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 10887119


V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
kegg点头喜欢受体信号通路 62 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
癌症中的KEGG途径 328 259 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG前列腺癌 89 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL6 7途径 47 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome贩运和内体TLR的处理 14 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome糖尿病途径 133 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ATF6 Alpha对伴侣的反应组激活 13 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome展开的蛋白质反应 80 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ATF6α对伴侣基因的反应组激活 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome先天免疫系统 279 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome收费受体级联 118 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌，LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标DN 431 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
thum收缩性心力衰竭 423 283 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LMO4靶向 372 227 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌 404 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoebeke淋巴干细胞DN 86 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tien肠益生菌24小时DN 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chiaradonna肿瘤转化cdc25 120 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 283 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori EMU Myc淋巴瘤发作时间DN 17 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与B淋巴细胞向上 78 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stanelle E2F1目标 29 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Peng Leucine剥夺DN 187 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭雷帕霉素反应dn 245 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭谷氨酰胺剥夺DN 337 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Munshi多发性骨髓瘤 81 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basso CD40信号向上 101 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
卫生部对干扰素beta的反应 71 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee衰老的新皮层 89 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江缺氧正常 311 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王顺铂响应和XPC向上 202 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WELCSH BRCA1靶向DN 141 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁尼trabectedin抗性DN 49 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肺癌和成纤维细胞的钟分泌组 132 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
抗原表现中的Pellicciotta HDAC 64 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
de yy1靶向DN 92 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞DN 145 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对Salirasib的反应 245 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性 374 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Takeer吉西他滨抗性DN 122 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chauhan对甲氧基雌二醇DN的反应 102 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标60小时DN 277 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨髓瘤与成熟B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 101 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
浆细胞与成熟B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 67 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shaffer IRF4在活化的树突状细胞中的目标 65 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fournier腺泡开发2 277 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应11 103 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li DCP2绑定mRNA 89 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN 448 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成pparg rxra绑定36小时 152 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
phong tnf响应不是通过p38 337 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vanoevelen肌发生SIN3A靶标 220 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-1/206 172 178 M8 HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
mir-148/152 107 113 M8 HSA-MIR-148A ucagugcacuacaacuuugu
HSA-MIR-152脑 UCAGUGCAUGACACUUGGG
HSA-MIR-148B ucagugcaucacacaacuuugu
mir-181 182 189 1A，M8 HSA-MIR-181A脑 aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C脑 aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D脑 aacauucauuguugucggggguggguu
mir-223 204 210 M8 HSA-MIR-223 ugucuuugucaauacccc
mir-23 38 45 1A，M8 HSA-MIR-23A脑 aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B脑 aucacauugccagggauuacc
mir-323 38 44 1a HSA-MIR-323脑 gcacauuacggucgaccucu
mir-409-3p 171 177 M8 HSA-MIR-409-3P cgauauguugcucggugaaccccu
mir-496 185 191 1a HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc