基因页：Trip6
概括？
| 基因 | 7205 |
| 象征 | Trip6 |
| 同义词 | OIP-1 | OIP1 | Trip-6 | Trip6i2 | Zrp-1 |
| 描述 | 甲状腺激素受体相互作用6 |
| 参考 | MIM：602933|HGNC：HGNC：12311|Ensembl：ENSG00000087077|HPRD：04242|Vega：Otthumg00000157029 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 7q22 |
| Pascal P值 | 0.002 |
| Sherlock P值 | 0.635 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：0.0561 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS6879593 | CHR5 | 75253310 | Trip6 | 7205 | 0.18 | 反式 | ||
| RS12677010 | CHR8 | 72609894 | Trip6 | 7205 | 0.15 | 反式 | ||
| RS1111195 | CHR16 | 51416325 | Trip6 | 7205 | 0.16 | 反式 | ||
| RS9944345 | CHR16 | 51419164 | Trip6 | 7205 | 0.16 | 反式 | ||
| RS11080561 | CHR18 | 12257229 | Trip6 | 7205 | 0.02 | 反式 | ||
| RS2692986 | Chrx | 31412008 | Trip6 | 7205 | 0.15 | 反式 | ||
| RS6527524 | 0 | Trip6 | 7205 | 0.17 | 反式 | |||
| RS4501739 | Chrx | 35960848 | Trip6 | 7205 | 0.01 | 反式 | ||
| RS16983508 | Chrx | 99747940 | Trip6 | 7205 | 0.11 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C22orf30 | 0.94 | 0.96 |
| KIAA1409 | 0.94 | 0.96 |
| KDM2A | 0.94 | 0.96 |
| ZNF318 | 0.93 | 0.95 |
| MBD5 | 0.93 | 0.95 |
| NCOR1 | 0.93 | 0.94 |
| 莱斯特 | 0.92 | 0.94 |
| ubn1 | 0.92 | 0.94 |
| atxn7 | 0.92 | 0.94 |
| ZSCAN29 | 0.92 | 0.94 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.73 | -0.78 |
| MT-CO2 | -0.71 | -0.76 |
| higd1b | -0.71 | -0.79 |
| AF347015.21 | -0.70 | -0.81 |
| FXYD1 | -0.70 | -0.74 |
| ifi27 | -0.69 | -0.74 |
| CST3 | -0.69 | -0.76 |
| HSD17B14 | -0.68 | -0.72 |
| S100A16 | -0.68 | -0.73 |
| AF347015.27 | -0.68 | -0.72 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005149 | 白介素-1受体结合 | 艾达 | 15657077 | |
| 去：0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
| 去：0019900 | 激酶结合 | IPI | 15657077 | |
| GO：0042802 | 相同的蛋白质结合 | IPI | 17353931 | |
| GO：0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
| GO：0046966 | 甲状腺激素受体结合 | nas | 9598321 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0008588 | 释放细胞质隔离的NF-kappab | 艾达 | 15657077 | |
| GO：0048041 | 局灶性粘附形成 | nas | 14688263 | |
| 去：0030335 | 细胞迁移的阳性调节 | 小鬼 | 14688263 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005925 | 局灶性粘附 | 艾达 | 14688263 | |
| GO：0045323 | 白介素-1受体复合物 | 艾达 | 15657077 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| acta1 | Acta |Asma |CFTD |CFTD1 |CFTDM |mpfd |Nem1 |Nem2 |NEM3 | 肌动蛋白，α1，骨骼肌 | 共定位 | Biogrid | 14688263 |
| AFAP1L1 | FLJ36748 |MGC149773 | 肌动蛋白丝相关蛋白1类样1 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| AQP1 | aqp-chip |chip28 |CO |MGC26324 | Aquaporin 1（Colton Blood群） | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| BCAR1 | cas |cas1 |Cass1 |crkas |P130CAS | 乳腺癌抗雌激素抵抗1 | - | HPRD，Biogrid | 11782456|14688263 |
| catsper1 | 猫|MGC33335 |MGC33368 | 阳离子通道，精子相关1 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| FAM124B | FLJ22746 | 序列相似性124b的家族 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| FAM46C | FLJ20202 | 具有序列相似性的家庭46，成员C | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| FHL3 | MGC19547 |MGC23614 |MGC8696 |Slim2 | 四个半域3 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| Hoxa1 | BSA |HOX1 |HOX1F |MGC45232 | Homeobox A1 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| Hoxa9 | ABD-B |HOX1 |HOX1.7 |Hox1g |MGC1934 | Homeobox A9 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 两个杂交 |
Biogrid | 16189514 |
| ILF3 | CBTF |drbf |DRBP76 |mmp4 |mphosph4 |mpp4 |NF-AT-90 |NF110 |NF90 |nfar | NFAR-1 | NFAR2 | TCP110 | TCP80 | 白介素增强子结合因子3，90kDa | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| KCTD5 | FLJ20040 | 含5个钾通道四聚化域 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| KIAA1683 | MGC131731 | KIAA1683 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| LOC116349 | - | 假设蛋白BC014011 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| LPAR2 | EDG-4 |EDG4 |FLJ93869 |LPA2 | 溶物磷酸受体2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 14688263 |
| mobkl1b | C2orf6 |FLJ10788 |FLJ11595 |MATS1 |mob1 |mobk1b |mob4b | MOB1，MPS一个粘合激酶激活剂样1B（酵母） | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| NCK2 | grb4 |NCKBETA | NCK适配器蛋白2 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| nedd9 | CAS-L |cas2 |卡斯尔|Cass2 |hef1 |DJ49G10.2 |DJ761I2.1 | 神经前体细胞表达，发育下调9 | - | HPRD，Biogrid | 11782456 |
| NUP210 | FLJ22389 |GP210 |KIAA0906 |POM210 | 核孔蛋白210KDA | - | HPRD，Biogrid | 11782456 |
| ODF1 | HSPB10 |MGC129928 |MGC129929 |ODF |ODF2 |ODF27 |ODFP |ODFPG |ODFPGA |ODFPGB | RT7 | SODF | 精子尾的外部密集纤维1 | - | HPRD，Biogrid | 12533418 |
| P4HB | DSI |ERBA2L |git |PDI |PDIA1 |PHDB |PO4DB |PO4HB |prohb | Procollagen-丙啉，2-氧基谷物4-二氧酶（脯氨酸4-羟化酶），β多肽 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| PDLIM4 | 里尔 | PDZ和LIM域4 | - | HPRD，Biogrid | 10826496 |
| POM121 | DKFZP586G1822 |DKFZP586P2220 |FLJ41820 |KIAA0618 |MGC3792 |POM121A | POM121膜糖蛋白（大鼠） | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| PPP1R16A | MGC14333 |mypt3 | 蛋白质磷酸酶1，调节（抑制剂）亚基16A | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| PTK2 | Fadk |fak |fak1 |pp125fak | PTK2蛋白酪氨酸激酶2 | - | HPRD，Biogrid | 14688263 |
| PTPN13 | DKFZP686J1497 |FAP-1 |PNP1 |PTP-BAS |ptp-bl |ptp1e |ptpl1 |ptple | 蛋白酪氨酸磷酸酶，非受体13型（APO-1/CD95（FAS）相关磷酸酶） | - | HPRD，Biogrid | 10826496 |
| PXN | FLJ16691 | 帕西林 | - | HPRD，Biogrid | 14688263 |
| RNMTL1 | FLJ10581 |HC90 | RNA甲基转移酶像1 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| RPS14 | EMTB | 核糖体蛋白S14 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| 儿子 | Bass1 |C21orf50 |DBP-5 |FLJ21099 |FLJ33914 |KIAA1019 |NREBP |Son3 | 儿子DNA结合蛋白 | - | HPRD | 11782456 |
| src | ASV |src1 |C-SRC |P60-SRC | V-SRC肉瘤（Schmidt-Ruppin A-2）病毒癌基因同源物（Avian） | - | HPRD，Biogrid | 14688263 |
| 斯托姆 | BND7 |EPB7 |EPB72 | 墨水 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| thrap3 | FLJ22082 |MGC133082 |MGC133083 |陷阱150 | 甲状腺激素受体相关蛋白3 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
| TPM4 | - | 肌球蛋白4 | - | HPRD，Biogrid | 11782456 |
| VCL | CMD1W |MVCL | Vinculin | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg点头喜欢受体信号通路 | 62 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID溶物磷脂途径 | 66 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID AP1途径 | 70 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过CD40 DN的Hollmann凋亡 | 267 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 刘前列腺癌DN | 481 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KIM对TSA和Decitabine的反应 | 129 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Davicioni分子臂与ERMS DN | 182 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| turashvili乳房导管癌与导管正常DN | 198 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HOOI ST7靶向 | 94 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| runx1 runx1t1融合单核细胞的TONKS目标 | 204 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jaatinen造血干细胞向上 | 316 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Provenzani转移DN | 136 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇3 DN | 229 | 142 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tomida转移DN | 18 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hatada甲基化在肺癌中 | 390 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| UEDA PERIFERAL CHICK | 169 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LEI MYB目标 | 318 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chiaretti急性淋巴细胞白血病ZAP70 | 67 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ramalho Stemness | 206 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kaab心脏中心与心室 | 249 | 170 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chiba对TSA的反应 | 52 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 村上紫外线响应6小时 | 37 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 海勒被甲基化沉默 | 282 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向 | 317 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN | 274 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Qi Plasmacytoma dn | 100 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vantveer乳腺癌BRCA1 UP | 36 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jison Sickle细胞疾病 | 181 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄胚胎干细胞核心 | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng对H2O2的响应通过ERCC6 UP | 40 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Verhaak胶质母细胞瘤经典 | 162 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lu eszh2靶向 | 295 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Alfano MYC目标 | 239 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| boudoukha由IGF2BP2绑定 | 111 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |