基因页：TRPC3
概括？
| 基因 | 7222 |
| 象征 | TRPC3 |
| 同义词 | sca41 | trp3 |
| 描述 | 瞬态受体潜在阳离子通道亚家族C成员3 |
| 参考 | MIM：602345|HGNC：HGNC：12335|ENSEMBL：ENSG00000138741|HPRD：15999|Vega：Otthumg00000133069 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 4Q27 |
| Pascal P值 | 0.044 |
| 胎儿β | -0.119 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG08769300 | 4 | 122871735 | TRPC3 | 7.85e-8 | -0.01 | 1.85e-5 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Cacybp | 0.90 | 0.92 |
| OCIAD1 | 0.84 | 0.84 |
| atp6v1d | 0.84 | 0.87 |
| MRPS22 | 0.84 | 0.86 |
| nkiras1 | 0.84 | 0.86 |
| Rheb | 0.83 | 0.85 |
| DNAJB9 | 0.82 | 0.83 |
| COPS4 | 0.82 | 0.82 |
| CALM2 | 0.81 | 0.86 |
| NDUFAF4 | 0.81 | 0.81 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.18 | -0.46 | -0.21 |
| SMTN | -0.42 | -0.45 |
| RP4-697K14.1 | -0.42 | -0.46 |
| AC100783.1 | -0.42 | -0.35 |
| AC010300.1 | -0.41 | -0.36 |
| AF347015.2 | -0.41 | -0.20 |
| hhipl2 | -0.40 | -0.42 |
| C10orf108 | -0.39 | -0.40 |
| EGFL8 | -0.38 | -0.38 |
| WDR86 | -0.37 | -0.38 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| FKBP1A | FKBP-12 |FKBP1 |FKBP12 |FKBP12C |PKC12 |PKCI2 |PPIASE | FK506结合蛋白1A，12KDA | - | HPRD | 15199065 |
| GNA11 | GNA-11 | 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白（G蛋白），α11（GQ类） | - | HPRD | 15623527 |
| GNA11 | GNA-11 | 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白（G蛋白），α11（GQ类） | - | HPRD | 11524429 |
| ITPR1 | insp3r1 |IP3R |IP3R1 |SCA15 |SCA16 | 肌醇1,4,5-三磷酸受体，1型 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 14505576 |
| ITPR3 | FLJ36205 |IP3R |IP3R3 | 肌醇1,4,5-三磷酸受体，3型 | - | HPRD | 15623527 |
| ITPR3 | FLJ36205 |IP3R |IP3R3 | 肌醇1,4,5-三磷酸受体，3型 | 重构的复合物 | Biogrid | 11290752 |
| ITPR3 | FLJ36205 |IP3R |IP3R3 | 肌醇1,4,5-三磷酸受体，3型 | - | HPRD | 11524429 |
| MX1 | ifi-78k |ifi78 |MX |MXA | 粘液病毒（流感病毒）抗性1，干扰素诱导蛋白P78（小鼠） | MXA与TRPC3相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人类MXA和TRPC3之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 15757897 |
| 纳帕 | Snapa | N-乙基马来酰亚胺敏感因子附着蛋白，α | TRPC3与alpha-SNAP相互作用。 | 绑定 | 15327778 |
| 纳帕 | Snapa | N-乙基马来酰亚胺敏感因子附着蛋白，α | - | HPRD | 15327778 |
| PLCB1 | FLJ45792 |pi-plc |PLC-154 |Plc-i |PLC154 | 磷脂酶C，β1（磷酸肌醇特异性） | - | HPRD | 15623527 |
| PLCB2 | FLJ38135 | 磷脂酶C，β2 | - | HPRD | 15623527 |
| PLCB3 | FLJ37084 | 磷脂酶C，β3（磷脂酰肌醇特异性） | - | HPRD | 15623527 |
| PLCG1 | PLC-II |PLC1 |PLC148 |Plcgamma1 | 磷脂酶C，伽马1 | PLCG1与TRPC3相互作用。这种相互作用是在大鼠PLCG1和人类TRPC3之间的相互作用上建模的。 | 绑定 | 15744307 |
| PLCG1 | PLC-II |PLC1 |PLC148 |Plcgamma1 | 磷脂酶C，伽马1 | - | HPRD | 15744307|15766521 |
| SLC8A1 | DKFZP779F0871 |FLJ37694 |FLJ43417 |MGC119581 |NCX1 | 溶质载体家族8（钠/钙交换器），成员1 | - | HPRD | 14736881 |
| STX3 | STX3A | 语法3 | - | HPRD | 15623527 |
| TRPC1 | HTRP-1 |MGC133334 |MGC133335 |TRP1 | 瞬态受体电位阳离子通道，亚家族C，成员1 | - | HPRD | 9215637|12032305 |
| TRPC1 | HTRP-1 |MGC133334 |MGC133335 |TRP1 | 瞬态受体电位阳离子通道，亚家族C，成员1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 体内 |
Biogrid | 9215637|12857742 |
| TRPC3 | trp3 | 瞬态受体电位阳离子通道，亚家族C，成员3 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 烦恼 |
Biogrid | 12032305 |
| TRPC4 | htrp4 |MGC119570 |MGC119571 |MGC119572 |MGC119573 |TRP4 | 瞬态受体电势阳离子通道，亚家族C，成员4 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12857742 |
| TRPC5 | TRP5 | 瞬态受体电位阳离子通道，亚家族C，成员5 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12857742 |
| TRPC6 | FLJ11098 |FLJ14863 |FSGS2 |TRP6 | 瞬态受体电位阳离子通道，亚家族C，成员6 | - | HPRD，Biogrid | 12032305 |
| TRPC6 | FLJ11098 |FLJ14863 |FSGS2 |TRP6 | 瞬态受体电位阳离子通道，亚家族C，成员6 | - | HPRD | 15623527 |
| TRPC7 | TRP7 | 瞬态受体电势阳离子通道，亚家族C，成员7 | 烦恼 | Biogrid | 12032305 |
| VAMP2 | FLJ11460 |SYB2 |VAMP-2 | 囊泡相关的膜蛋白2（突触纤维2） | - | HPRD | 15327778 |
| VAMP2 | FLJ11460 |SYB2 |VAMP-2 | 囊泡相关的膜蛋白2（突触纤维2） | TRPC3与VAMP2相互作用。 | 绑定 | 15327778 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID PI3K PLC TRK途径 | 36 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome胃胃CREB信号传导途径通过PKC和MAPK | 205 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 胞质Ca2水平的反应组升高 | 10 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Axon指导 | 251 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome G alpha Q信号事件 | 184 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PIP2水解的反应组作用 | 25 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 第二使者在netrin1信号传导中的作用 | 11 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Netrin1信号传导 | 41 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome血小板稳态 | 78 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome血小板钙稳态 | 18 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome血小板激活信号传导和聚集 | 208 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| XU AKT1目标48小时 | 9 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PTCH1和SUFU DN的Lee目标 | 83 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yauch刺猬信号传导旁分泌 | 149 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES HCP与H3未甲基化 | 63 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF HCP与H3未甲基化 | 228 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |