基因页:TRPC4
概括?
基因 | 7223 |
象征 | TRPC4 |
同义词 | htrp-4 | htrp4 | trp4 |
描述 | 瞬态受体潜在阳离子通道亚家族C成员4 |
参考 | MIM:603651|HGNC:HGNC:12336|ENSEMBL:ENSG00000133107|HPRD:09154|Vega:Otthumg0000000016752 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 13Q13.3 |
Pascal P值 | 2.184E-4 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TRPC4_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AFG3L2 | 0.88 | 0.81 |
slc4a1ap | 0.87 | 0.80 |
DDX1 | 0.86 | 0.85 |
grpel1 | 0.86 | 0.77 |
纳尔 | 0.85 | 0.81 |
nudt9 | 0.85 | 0.82 |
DLD | 0.85 | 0.85 |
Klraq1 | 0.85 | 0.79 |
DDX24 | 0.84 | 0.77 |
PSMD7 | 0.84 | 0.77 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.76 | -0.44 |
MT-CO2 | -0.68 | -0.44 |
AF347015.2 | -0.68 | -0.45 |
AF347015.8 | -0.68 | -0.44 |
AF347015.31 | -0.66 | -0.45 |
higd1b | -0.66 | -0.46 |
AF347015.18 | -0.65 | -0.42 |
ifi27 | -0.65 | -0.50 |
AF347015.33 | -0.64 | -0.43 |
mt-cyb | -0.64 | -0.41 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Axon指导 | 251 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第二使者在netrin1信号传导中的作用 | 11 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Netrin1信号传导 | 41 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘前列腺癌DN | 481 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
威尔科克斯对孕酮的反应 | 152 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riz红细胞分化6小时 | 40 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang Smarce1靶向DN | 371 | 218 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McClung Creb1靶向 | 100 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦凯布(McCabe)由HOXC6绑定 | 469 | 239 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞培养与新鲜 | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zembutsu对顺铂的敏感性 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |