基因页：TRPC6
概括？
| 基因 | 7225 |
| 象征 | TRPC6 |
| 同义词 | FSGS2 | TRP6 |
| 描述 | 瞬态受体潜在阳离子通道亚家族C成员6 |
| 参考 | MIM：603652|HGNC：HGNC：12338|ENSEMBL：ENSG00000137672|HPRD：04710|Vega：Otthumg00000167483 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 11q22.1 |
| Pascal P值 | 0.619 |
| 胎儿β | -0.421 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| CSTF1 | 0.90 | 0.90 |
| RNF34 | 0.90 | 0.89 |
| PRPF4 | 0.89 | 0.90 |
| SMU1 | 0.89 | 0.89 |
| WBP11 | 0.89 | 0.87 |
| KIAA0406 | 0.89 | 0.91 |
| SLBP | 0.89 | 0.86 |
| SLC30A5 | 0.88 | 0.87 |
| eftud2 | 0.88 | 0.89 |
| gorasp2 | 0.88 | 0.87 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-CO2 | -0.84 | -0.84 |
| AF347015.31 | -0.81 | -0.82 |
| AF347015.21 | -0.81 | -0.85 |
| AF347015.8 | -0.81 | -0.83 |
| mt-cyb | -0.80 | -0.81 |
| AF347015.33 | -0.80 | -0.81 |
| AF347015.27 | -0.79 | -0.81 |
| AF347015.2 | -0.77 | -0.79 |
| AF347015.15 | -0.76 | -0.81 |
| FXYD1 | -0.75 | -0.79 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| Fyn | MGC45350 |SLK |syn | Fyn Oncogene与SRC，FGR，是的 | - | HPRD，Biogrid | 14761972 |
| ITPR1 | insp3r1 |IP3R |IP3R1 |SCA15 |SCA16 | 肌醇1,4,5-三磷酸受体，1型 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 14505576 |
| ITPR3 | FLJ36205 |IP3R |IP3R3 | 肌醇1,4,5-三磷酸受体，3型 | - | HPRD，Biogrid | 11290752 |
| MX1 | ifi-78k |ifi78 |MX |MXA | 粘液病毒（流感病毒）抗性1，干扰素诱导蛋白P78（小鼠） | MXA与TRPC6相互作用。 | 绑定 | 15757897 |
| src | ASV |src1 |C-SRC |P60-SRC | V-SRC肉瘤（Schmidt-Ruppin A-2）病毒癌基因同源物（Avian） | - | HPRD，Biogrid | 14761972 |
| TRPC1 | HTRP-1 |MGC133334 |MGC133335 |TRP1 | 瞬态受体电位阳离子通道，亚家族C，成员1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12857742 |
| TRPC2 | - | 瞬态受体电势阳离子通道，亚家族C，成员2（伪男） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 14699131 |
| TRPC3 | trp3 | 瞬态受体电位阳离子通道，亚家族C，成员3 | - | HPRD，Biogrid | 12032305 |
| TRPC3 | trp3 | 瞬态受体电位阳离子通道，亚家族C，成员3 | - | HPRD | 15623527 |
| TRPC4 | htrp4 |MGC119570 |MGC119571 |MGC119572 |MGC119573 |TRP4 | 瞬态受体电势阳离子通道，亚家族C，成员4 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12857742 |
| TRPC5 | TRP5 | 瞬态受体电位阳离子通道，亚家族C，成员5 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12857742 |
| TRPC6 | FLJ11098 |FLJ14863 |FSGS2 |TRP6 | 瞬态受体电位阳离子通道，亚家族C，成员6 | - | HPRD，Biogrid | 12032305 |
| TRPC7 | TRP7 | 瞬态受体电势阳离子通道，亚家族C，成员7 | 烦恼 | Biogrid | 12032305 |
| TRPM2 | EREG1 |knp3 |ltrpc2 |MGC133383 |nudt9h |nudt9l1 |TRPC7 | 瞬态受体电势阳离子通道，亚家族M，成员2 | - | HPRD | 12032305 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID内皮素路径 | 63 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID肾素Neph1途径 | 31 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID EPO途径 | 34 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID凝血酶PAR1途径 | 43 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome胃胃CREB信号传导途径通过PKC和MAPK | 205 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 胞质Ca2水平的反应组升高 | 10 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Axon指导 | 251 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome G alpha Q信号事件 | 184 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PIP2水解的反应组作用 | 25 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 第二使者在netrin1信号传导中的作用 | 11 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Netrin1信号传导 | 41 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome血小板稳态 | 78 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome血小板钙稳态 | 18 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome血小板激活信号传导和聚集 | 208 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Basaki YBX1靶向DN | 384 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche皮肤肿瘤启动子DN | 185 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche Papilloma风险低 | 162 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche Papilloma风险高DN | 180 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| darwiche鳞状细胞癌DN | 181 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| darwiche乳头状瘤进度风险 | 74 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche Papilloma风险高与低DN | 32 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sheth肝癌与TXNIP损失PAM1 | 229 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发48小时DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML Fab标记 | 191 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 | 246 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 | 341 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |