基因页面:TSNAX
总结吗?
GeneID | 7257年 |
象征 | TSNAX |
同义词 | TRAX |
描述 | translin-associated因子X |
参考 | MIM: 602964|HGNC: HGNC: 12380|运用:ENSG00000116918|HPRD: 04270|织女:OTTHUMG00000039486 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 1 q42.1 |
这样假定值 | 0.008 |
胎儿β | -0.628 |
eGene | 元 |
支持 | CompositeSet |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
认为:Fromer_2014 | 全外显子组测序分析 | 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。 | |
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
协会 | 综合优势比方法(太阳et al . 2008),协会研究 | 2 | 链接到SZGene |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
TSNAX | chr1 | 231678346 | C | G | NM_005999 NR_028393 NR_028394 NR_028395 NR_028396 NR_028397 NR_028398 NR_028399 NR_028400 |
p.119A > G 。 。 。 。 。 。 。 。 |
错义 npcRNA npcRNA npcRNA npcRNA npcRNA intronic npcRNA npcRNA |
精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TSNAX_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0008565 | 转运蛋白活性 | 助教 | 9013868 | |
去:0043565 | sequence-specific DNA结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0007283 | 精子发生 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0007275 | 多细胞有机体的发展 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0030154 | 细胞分化 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
迪亚兹慢性MEYLOGENOUS白血病 | 1382年 | 904年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN HORIUCHI WTAP目标 | 310年 | 188年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
奥斯曼膀胱癌了 | 404年 | 246年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
角化细胞DN ENK紫外线反应 | 485年 | 334年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN SCHLOSSER血清反应 | 712年 | 443年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652年 | 1023年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA ATM PCC网络 | 1442年 | 892年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NUYTTEN NIPP1的目标了 | 769年 | 437年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
小山SEMA3B DN的目标 | 411年 | 249年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
沈SMARCA2目标了 | 424年 | 268年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MORI PRE BI淋巴细胞DN | 77年 | 49 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿尔茨海默病DN布莱洛克的 | 1237年 | 837年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
击倒卡路里限制肌肉DN | 87年 | 59 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
WELCSH BRCA1目标了 | 198年 | 132年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
江缺氧正常 | 311年 | 205年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝癌了 | 973年 | 570年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝脏肿瘤与邻近正常组织 | 863年 | 514年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿塞维多甲基化在肝癌DN | 940年 | 425年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迈斯纳和H3 UNMETHYLATED人大HCP | 536年 | 296年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金所有障碍少突细胞数量。柯尔 | 756年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金双相情感障碍少突细胞密度相关系数 | 682年 | 440年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金所有障碍CALB1 CORR | 548年 | 370年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
VERHAAK胶质母细胞瘤神经 | 129年 | 85年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
gabriele MIR21目标 | 289年 | 187年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN PILON KLF1目标 | 1972年 | 1213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir - 137 | 1334年 | 1340年 | 1 | hsa - mir - 137 | UAUUGCUUAAGAAUACGCGUAG |
mir - 182 | 1304年 | 1311年 | 1、m8 | hsa - mir - 182 | UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA |
miR-9 | 1307年 | 1313年 | 1 | hsa-miR-9深圳 | UCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGA |
mir - 96 | 1305年 | 1311年 | 1 | hsa - mir - 96大脑 | UUUGGCACUAGCACAUUUUUGC |