总结吗?
GeneID 7257年
象征 TSNAX
同义词 TRAX
描述 translin-associated因子X
参考 MIM: 602964|HGNC: HGNC: 12380|运用:ENSG00000116918|HPRD: 04270|织女:OTTHUMG00000039486
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 1 q42.1
这样假定值 0.008
胎儿β -0.628
eGene
支持 CompositeSet

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
认为:Fromer_2014 全外显子组测序分析 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
协会 综合优势比方法(太阳et al . 2008),协会研究 2 链接到SZGene
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,神经 点击显示详细信息

部分即遗传学和表观遗传学注释

@认为表

基因 染色体 位置 裁判 Alt 成绩单 AA变化 突变类型 筛选 CG46 特征 研究
TSNAX chr1 231678346 C G NM_005999
NR_028393
NR_028394
NR_028395
NR_028396
NR_028397
NR_028398
NR_028399
NR_028400
p.119A > G







错义
npcRNA
npcRNA
npcRNA
npcRNA
npcRNA
intronic
npcRNA
npcRNA
精神分裂症 认为:Fromer_2014


第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

没有大脑中的基因区域


第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0008565 转运蛋白活性 助教 9013868
去:0043565 sequence-specific DNA结合 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0007283 精子发生 国际能源机构 - - - - - -
去:0007275 多细胞有机体的发展 国际能源机构 - - - - - -
去:0030154 细胞分化 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005634 国际能源机构 - - - - - -
去:0005737 细胞质 国际能源机构 - - - - - -

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
迪亚兹慢性MEYLOGENOUS白血病 1382年 904年 所有SZGR 2.0基因通路
DN HORIUCHI WTAP目标 310年 188年 所有SZGR 2.0基因通路
奥斯曼膀胱癌了 404年 246年 所有SZGR 2.0基因通路
角化细胞DN ENK紫外线反应 485年 334年 所有SZGR 2.0基因通路
DN SCHLOSSER血清反应 712年 443年 所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652年 1023年 所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA ATM PCC网络 1442年 892年 所有SZGR 2.0基因通路
NUYTTEN NIPP1的目标了 769年 437年 所有SZGR 2.0基因通路
小山SEMA3B DN的目标 411年 249年 所有SZGR 2.0基因通路
沈SMARCA2目标了 424年 268年 所有SZGR 2.0基因通路
MORI PRE BI淋巴细胞DN 77年 49 所有SZGR 2.0基因通路
阿尔茨海默病DN布莱洛克的 1237年 837年 所有SZGR 2.0基因通路
击倒卡路里限制肌肉DN 87年 59 所有SZGR 2.0基因通路
WELCSH BRCA1目标了 198年 132年 所有SZGR 2.0基因通路
江缺氧正常 311年 205年 所有SZGR 2.0基因通路
ACEVEDO肝癌了 973年 570年 所有SZGR 2.0基因通路
ACEVEDO肝脏肿瘤与邻近正常组织 863年 514年 所有SZGR 2.0基因通路
阿塞维多甲基化在肝癌DN 940年 425年 所有SZGR 2.0基因通路
迈斯纳和H3 UNMETHYLATED人大HCP 536年 296年 所有SZGR 2.0基因通路
金所有障碍少突细胞数量。柯尔 756年 494年 所有SZGR 2.0基因通路
金双相情感障碍少突细胞密度相关系数 682年 440年 所有SZGR 2.0基因通路
金所有障碍CALB1 CORR 548年 370年 所有SZGR 2.0基因通路
VERHAAK胶质母细胞瘤神经 129年 85年 所有SZGR 2.0基因通路
gabriele MIR21目标 289年 187年 所有SZGR 2.0基因通路
DN PILON KLF1目标 1972年 1213年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 137 1334年 1340年 1 hsa - mir - 137 UAUUGCUUAAGAAUACGCGUAG
mir - 182 1304年 1311年 1、m8 hsa - mir - 182 UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA
miR-9 1307年 1313年 1 hsa-miR-9深圳 UCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGA
mir - 96 1305年 1311年 1 hsa - mir - 96大脑 UUUGGCACUAGCACAUUUUUGC