基因页面:TSSC1
总结吗?
| GeneID | 7260年 |
| 象征 | TSSC1 |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | 肿瘤抑制subtransferable候选人1 |
| 参考 | MIM: 608998|HGNC: HGNC: 12383|运用:ENSG00000032389|HPRD: 10287|织女:OTTHUMG00000090329 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 2 p25.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.113 |
| 夏洛克假定值 | 0.532 |
| 胎儿β | -0.596 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg27420005 | 2 | 3197996 | TSSC1 | 1.782的军医 | 0.528 | 0.034 | DMG: Wockner_2014 |
| cg23666856 | 2 | 3200801 | TSSC1 | 5.905的军医 | 0.567 | 0.05 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs9729667 | chr1 | 78349213 | TSSC1 | 7260年 | 0.2 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DN SENESE HDAC1目标 | 260年 | 143年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH NANOG目标 | 988年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陈神经母细胞瘤拷贝数收益 | 50 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝脏肿瘤旁正常组织DN | 354年 | 216年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝脏肿瘤与邻近正常组织 | 863年 | 514年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SHEDDEN肺癌生存A6差 | 456年 | 285年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |