基因页:TTPA
概括?
基因 | 7274 |
象征 | TTPA |
同义词 | attp | aved | ttp1 | alphattp |
描述 | 生育酚(α)转移蛋白 |
参考 | MIM:600415|HGNC:HGNC:12404|ENSEMBL:ENSG00000137561|HPRD:02685|Vega:Otthumg00000164367 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8Q12.3 |
Pascal P值 | 0.349 |
TADA P值 | 0.008 |
胎儿β | -1.648 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
DNM:Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
TTPA | CHR8 | 63978636 | 一种 | C | NM_000370 | p.127f> v | 错过 | 精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 |
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG16231500 | 8 | 63998736 | TTPA | 6.06e-9 | -0.018 | 3.22E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TTPA_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AP1M1 | 0.95 | 0.95 |
ZNF574 | 0.95 | 0.96 |
FAM40A | 0.95 | 0.96 |
TUBGCP2 | 0.94 | 0.97 |
EDC4 | 0.94 | 0.94 |
TRO | 0.94 | 0.95 |
RUSC1 | 0.94 | 0.95 |
VPS16A | 0.94 | 0.96 |
RIC8A | 0.94 | 0.94 |
MAGED1 | 0.94 | 0.96 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.80 | -0.88 |
MT-CO2 | -0.80 | -0.89 |
AF347015.27 | -0.79 | -0.88 |
AF347015.33 | -0.78 | -0.87 |
AF347015.8 | -0.77 | -0.88 |
mt-cyb | -0.76 | -0.85 |
AF347015.21 | -0.75 | -0.92 |
FXYD1 | -0.74 | -0.83 |
S100B | -0.73 | -0.82 |
AF347015.15 | -0.73 | -0.84 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
McBryan Pubertal乳房4 5WK | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌8Q12 Q22 AMPLICON | 132 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML生存 | 129 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 | 681 | 420 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李肝癌的生存 | 185 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标36小时DN | 185 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标60小时DN | 277 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标DN | 89 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌子类CTNNB1 UP | 176 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类增殖DN | 179 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Woo肝癌复发DN | 80 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝脏发展DN | 222 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verhaak胶质母细胞瘤神经 | 129 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHYLA CBFA2T3靶向 | 387 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vandesluis Commd1目标组4 DN | 16 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Madan DPPA4目标 | 46 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |