基因页:ttr
概括?
基因 | 7276 |
象征 | ttr |
同义词 | CTS | CTS1 | HEL111 | HST2651 | PALB | TBPA |
描述 | 经硫代蛋白 |
参考 | MIM:176300|HGNC:HGNC:12405|ENSEMBL:ENSG00000118271|HPRD:01447|Vega:Otthumg00000131984 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 18Q12.1 |
Pascal P值 | 0.075 |
Sherlock P值 | 0.864 |
胎儿β | 0.923 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS734994 | CHR1 | 30796504 | ttr | 7276 | 0.14 | 反式 | ||
RS17091285 | CHR1 | 71957915 | ttr | 7276 | 0.17 | 反式 | ||
RS11162132 | CHR1 | 76833107 | ttr | 7276 | 2.341E-4 | 反式 | ||
RS6688662 | CHR1 | 76842132 | ttr | 7276 | 2.702E-6 | 反式 | ||
RS421660 | CHR1 | 91633187 | ttr | 7276 | 0.14 | 反式 | ||
SNP_A-1965574 | 0 | ttr | 7276 | 0.06 | 反式 | |||
RS1891733 | CHR1 | 164807829 | ttr | 7276 | 7.315e-5 | 反式 | ||
RS12118136 | CHR1 | 164812580 | ttr | 7276 | 5.331E-4 | 反式 | ||
RS17392895 | CHR1 | 164814782 | ttr | 7276 | 2.307E-4 | 反式 | ||
RS512189 | CHR1 | 182632586 | ttr | 7276 | 0 | 反式 | ||
RS16823145 | CHR1 | 184397914 | ttr | 7276 | 0.11 | 反式 | ||
RS16849110 | CHR1 | 201567374 | ttr | 7276 | 0.03 | 反式 | ||
RS17163777 | CHR1 | 223468731 | ttr | 7276 | 0.15 | 反式 | ||
RS6666913 | CHR1 | 237092144 | ttr | 7276 | 4.156E-8 | 反式 | ||
RS7528464 | CHR1 | 246272686 | ttr | 7276 | 0.03 | 反式 | ||
RS1377421 | CHR2 | 35213051 | ttr | 7276 | 0.08 | 反式 | ||
RS10209546 | CHR2 | 53408320 | ttr | 7276 | 2.155E-4 | 反式 | ||
RS3755119 | CHR2 | 53957339 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS13401483 | CHR2 | 84219167 | ttr | 7276 | 0.09 | 反式 | ||
RS260675 | CHR2 | 109600118 | ttr | 7276 | 0 | 反式 | ||
RS7596511 | CHR2 | 120010898 | ttr | 7276 | 4.693E-4 | 反式 | ||
RS7574824 | CHR2 | 130696073 | ttr | 7276 | 0.06 | 反式 | ||
RS10176716 | CHR2 | 151596595 | ttr | 7276 | 0.02 | 反式 | ||
RS10195263 | CHR2 | 151725791 | ttr | 7276 | 0.07 | 反式 | ||
RS12694629 | CHR2 | 157312146 | ttr | 7276 | 0.17 | 反式 | ||
RS10515928 | CHR2 | 160074898 | ttr | 7276 | 0.1 | 反式 | ||
RS9287785 | CHR2 | 160075008 | ttr | 7276 | 0.1 | 反式 | ||
RS10490004 | CHR2 | 160076139 | ttr | 7276 | 0.1 | 反式 | ||
RS11903200 | CHR2 | 160076308 | ttr | 7276 | 0.1 | 反式 | ||
RS2241023 | CHR2 | 160081335 | ttr | 7276 | 0.1 | 反式 | ||
RS10490003 | CHR2 | 160082889 | ttr | 7276 | 0.1 | 反式 | ||
RS10189317 | CHR2 | 160123106 | ttr | 7276 | 0.1 | 反式 | ||
RS8179587 | CHR2 | 160187588 | ttr | 7276 | 0.18 | 反式 | ||
RS13035414 | CHR2 | 166304918 | ttr | 7276 | 0.15 | 反式 | ||
RS7600169 | CHR2 | 167080978 | ttr | 7276 | 0.07 | 反式 | ||
RS7589313 | CHR2 | 174771910 | ttr | 7276 | 0.15 | 反式 | ||
RS4453654 | CHR2 | 189185130 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS1983539 | CHR3 | 9736740 | ttr | 7276 | 0.07 | 反式 | ||
SNP_A-2312022 | 0 | ttr | 7276 | 0.07 | 反式 | |||
RS17015415 | CHR3 | 24933888 | ttr | 7276 | 0.08 | 反式 | ||
RS7646474 | CHR3 | 46011068 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS11923953 | CHR3 | 64365756 | ttr | 7276 | 0 | 反式 | ||
RS6548978 | CHR3 | 68139529 | ttr | 7276 | 0.03 | 反式 | ||
RS17011179 | CHR3 | 73501887 | ttr | 7276 | 0.04 | 反式 | ||
RS7609917 | CHR3 | 76094301 | ttr | 7276 | 3.598E-7 | 反式 | ||
RS2324466 | CHR3 | 76100753 | ttr | 7276 | 4.359e-12 | 反式 | ||
RS17013713 | CHR3 | 76105150 | ttr | 7276 | 1.824e-13 | 反式 | ||
RS17013724 | CHR3 | 76107684 | ttr | 7276 | 4.359e-12 | 反式 | ||
RS301930 | CHR3 | 97348309 | ttr | 7276 | 0.06 | 反式 | ||
RS2705554 | CHR3 | 112273545 | ttr | 7276 | 0.07 | 反式 | ||
RS4312656 | CHR3 | 115157721 | ttr | 7276 | 0.03 | 反式 | ||
RS16859029 | CHR3 | 146759514 | ttr | 7276 | 0.17 | 反式 | ||
RS16831155 | CHR3 | 173574763 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS9882442 | CHR3 | 173644484 | ttr | 7276 | 3.282E-4 | 反式 | ||
RS4686772 | CHR3 | 186126448 | ttr | 7276 | 0.04 | 反式 | ||
RS1403709 | CHR3 | 187472811 | ttr | 7276 | 0.04 | 反式 | ||
RS10015205 | CHR4 | 26144278 | ttr | 7276 | 0.06 | 反式 | ||
RS16991886 | CHR4 | 36048970 | ttr | 7276 | 0 | 反式 | ||
RS12646252 | 0 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | |||
RS17148160 | CHR4 | 70974564 | ttr | 7276 | 0.19 | 反式 | ||
RS1389042 | CHR4 | 82973241 | ttr | 7276 | 0.03 | 反式 | ||
RS11734196 | CHR4 | 102796071 | ttr | 7276 | 0.03 | 反式 | ||
RS10212684 | CHR4 | 102822506 | ttr | 7276 | 0.03 | 反式 | ||
RS17007390 | CHR4 | 124705927 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS11937178 | CHR4 | 148847598 | ttr | 7276 | 0.02 | 反式 | ||
RS11934409 | CHR4 | 148848884 | ttr | 7276 | 0.02 | 反式 | ||
RS2605050 | CHR4 | 180362144 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS4301163 | CHR4 | 187861271 | ttr | 7276 | 0.08 | 反式 | ||
RS9986296 | CHR5 | 3199318 | ttr | 7276 | 0 | 反式 | ||
RS16875617 | CHR5 | 5483721 | ttr | 7276 | 0.13 | 反式 | ||
RS16875618 | CHR5 | 5484079 | ttr | 7276 | 0.13 | 反式 | ||
RS16875619 | CHR5 | 5487310 | ttr | 7276 | 0.13 | 反式 | ||
RS4702271 | CHR5 | 5491289 | ttr | 7276 | 0.13 | 反式 | ||
RS2937812 | CHR5 | 5540693 | ttr | 7276 | 0.18 | 反式 | ||
RS16876290 | CHR5 | 5790694 | ttr | 7276 | 0.16 | 反式 | ||
RS10755251 | CHR5 | 31789357 | ttr | 7276 | 0.16 | 反式 | ||
RS2455248 | CHR5 | 36478729 | ttr | 7276 | 9.987E-4 | 反式 | ||
RS2648734 | CHR5 | 52068572 | ttr | 7276 | 0 | 反式 | ||
RS6897533 | CHR5 | 72660099 | ttr | 7276 | 0.17 | 反式 | ||
RS12658469 | CHR5 | 72670113 | ttr | 7276 | 0.16 | 反式 | ||
RS920385 | CHR5 | 124490714 | ttr | 7276 | 0.04 | 反式 | ||
RS2895773 | CHR5 | 148114635 | ttr | 7276 | 0.03 | 反式 | ||
RS17077791 | CHR5 | 176616523 | ttr | 7276 | 0.14 | 反式 | ||
RS2281351 | CHR6 | 187343 | ttr | 7276 | 0.08 | 反式 | ||
RS9396617 | CHR6 | 15924214 | ttr | 7276 | 0 | 反式 | ||
RS726836 | CHR6 | 25843925 | ttr | 7276 | 0.05 | 反式 | ||
RS16899778 | CHR6 | 27390149 | ttr | 7276 | 0.15 | 反式 | ||
RS7740062 | CHR6 | 27705597 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS200470 | CHR6 | 27762186 | ttr | 7276 | 5.129E-4 | 反式 | ||
RS201005 | CHR6 | 27804159 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS200955 | CHR6 | 27839311 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS200959 | CHR6 | 27842046 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS839777 | CHR6 | 27909656 | ttr | 7276 | 0 | 反式 | ||
RS149898 | CHR6 | 27958071 | ttr | 7276 | 0 | 反式 | ||
RS156741 | CHR6 | 27962383 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS156742 | CHR6 | 27963191 | ttr | 7276 | 0 | 反式 | ||
RS175955 | CHR6 | 28059733 | ttr | 7276 | 0 | 反式 | ||
RS1225593 | CHR6 | 28150518 | ttr | 7276 | 0 | 反式 | ||
RS16894180 | CHR6 | 28628465 | ttr | 7276 | 0.09 | 反式 | ||
RS3130602 | CHR6 | 32972206 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS16895035 | CHR6 | 34839096 | ttr | 7276 | 0.13 | 反式 | ||
RS9380466 | CHR6 | 34869223 | ttr | 7276 | 0.15 | 反式 | ||
RS195749 | CHR6 | 37253745 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS4435942 | CHR6 | 37694937 | ttr | 7276 | 0.02 | 反式 | ||
RS16896683 | CHR6 | 43687846 | ttr | 7276 | 0.03 | 反式 | ||
RS9463383 | CHR6 | 48260637 | ttr | 7276 | 0.14 | 反式 | ||
RS16875134 | CHR6 | 85489519 | ttr | 7276 | 0.02 | 反式 | ||
RS16875178 | CHR6 | 85516099 | ttr | 7276 | 0.11 | 反式 | ||
RS7762250 | CHR6 | 144475063 | ttr | 7276 | 0.05 | 反式 | ||
RS3735131 | CHR7 | 2962292 | ttr | 7276 | 0.06 | 反式 | ||
RS7808764 | CHR7 | 10297264 | ttr | 7276 | 0.08 | 反式 | ||
RS1005524 | CHR7 | 20596813 | ttr | 7276 | 0.18 | 反式 | ||
RS17145334 | CHR7 | 21808409 | ttr | 7276 | 0.09 | 反式 | ||
RS17148638 | CHR7 | 24065071 | ttr | 7276 | 0.03 | 反式 | ||
RS895578 | CHR7 | 35410694 | ttr | 7276 | 0.02 | 反式 | ||
RS340406 | CHR7 | 35418631 | ttr | 7276 | 0.16 | 反式 | ||
RS2197617 | CHR7 | 35504198 | ttr | 7276 | 0.16 | 反式 | ||
RS2013491 | CHR7 | 91946015 | ttr | 7276 | 0.05 | 反式 | ||
RS992435 | CHR7 | 97050802 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS7810149 | CHR7 | 111899363 | ttr | 7276 | 0.06 | 反式 | ||
RS1047551 | CHR7 | 111983277 | ttr | 7276 | 0.14 | 反式 | ||
RS1528356 | CHR7 | 121121454 | ttr | 7276 | 0.02 | 反式 | ||
RS12532261 | CHR7 | 132264028 | ttr | 7276 | 0.02 | 反式 | ||
RS12533690 | CHR7 | 132265977 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS6952992 | CHR7 | 139421473 | ttr | 7276 | 0.15 | 反式 | ||
RS7810706 | CHR7 | 150831288 | ttr | 7276 | 1.663E-4 | 反式 | ||
RS11769541 | CHR7 | 154373157 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS4504596 | CHR8 | 11111891 | ttr | 7276 | 0.14 | 反式 | ||
RS8190856 | CHR8 | 18079123 | ttr | 7276 | 0.18 | 反式 | ||
RS16920368 | CHR8 | 55392852 | ttr | 7276 | 6.068E-4 | 反式 | ||
RS16927318 | CHR8 | 62365911 | ttr | 7276 | 3.254e-7 | 反式 | ||
RS348150 | CHR8 | 73371619 | ttr | 7276 | 0 | 反式 | ||
RS16938220 | CHR8 | 73377940 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS7843769 | CHR8 | 83608406 | ttr | 7276 | 8.283E-4 | 反式 | ||
RS7830923 | CHR8 | 83608478 | ttr | 7276 | 8.283E-4 | 反式 | ||
RS16910790 | CHR8 | 83621808 | ttr | 7276 | 2.313E-4 | 反式 | ||
RS16910793 | CHR8 | 83621841 | ttr | 7276 | 8.283E-4 | 反式 | ||
RS16910802 | CHR8 | 83622265 | ttr | 7276 | 8.283E-4 | 反式 | ||
RS16910804 | CHR8 | 83622540 | ttr | 7276 | 0 | 反式 | ||
RS1969215 | CHR8 | 108644706 | ttr | 7276 | 0.18 | 反式 | ||
RS16904520 | CHR8 | 132774255 | ttr | 7276 | 0.06 | 反式 | ||
RS12547258 | CHR8 | 133456995 | ttr | 7276 | 0.05 | 反式 | ||
RS1448721 | CHR8 | 136924784 | ttr | 7276 | 0.14 | 反式 | ||
RS16908622 | CHR8 | 139231604 | ttr | 7276 | 0.05 | 反式 | ||
RS4545144 | CHR8 | 139689307 | ttr | 7276 | 8.061E-4 | 反式 | ||
RS3780045 | 0 | ttr | 7276 | 0.17 | 反式 | |||
RS10815658 | Chr9 | 7709422 | ttr | 7276 | 1.43E-4 | 反式 | ||
RS1410387 | Chr9 | 89359203 | ttr | 7276 | 0.11 | 反式 | ||
RS180038 | Chr9 | 101514415 | ttr | 7276 | 0.02 | 反式 | ||
RS4742740 | Chr9 | 101524552 | ttr | 7276 | 0 | 反式 | ||
RS4743277 | Chr9 | 101557528 | ttr | 7276 | 0 | 反式 | ||
RS10119434 | Chr9 | 110944789 | ttr | 7276 | 7.613E-4 | 反式 | ||
RS10983187 | Chr9 | 119238934 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS2448377 | Chr10 | 274223 | ttr | 7276 | 0.2 | 反式 | ||
RS11251091 | Chr10 | 2249852 | ttr | 7276 | 0.03 | 反式 | ||
RS11007809 | Chr10 | 30209705 | ttr | 7276 | 0.1 | 反式 | ||
RS11238503 | Chr10 | 43781090 | ttr | 7276 | 0.13 | 反式 | ||
RS16916915 | Chr10 | 63785368 | ttr | 7276 | 0.16 | 反式 | ||
RS7906330 | Chr10 | 87372192 | ttr | 7276 | 0.13 | 反式 | ||
RS11193467 | Chr10 | 109217296 | ttr | 7276 | 0.16 | 反式 | ||
RS7920992 | Chr10 | 130402940 | ttr | 7276 | 0.08 | 反式 | ||
RS6578423 | Chr11 | 3969443 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS16929438 | Chr11 | 4104006 | ttr | 7276 | 0.05 | 反式 | ||
RS16907878 | Chr11 | 10518250 | ttr | 7276 | 0.11 | 反式 | ||
RS17233214 | Chr11 | 21367388 | ttr | 7276 | 0.03 | 反式 | ||
RS11823843 | Chr11 | 21376537 | ttr | 7276 | 0.18 | 反式 | ||
RS16911034 | Chr11 | 23302320 | ttr | 7276 | 0.03 | 反式 | ||
RS10734372 | Chr11 | 26090747 | ttr | 7276 | 0.03 | 反式 | ||
RS12224887 | Chr11 | 37400374 | ttr | 7276 | 0.04 | 反式 | ||
RS11034154 | Chr11 | 37481053 | ttr | 7276 | 0.17 | 反式 | ||
RS1002405 | Chr11 | 85572958 | ttr | 7276 | 0.08 | 反式 | ||
RS11569358 | CHR12 | 6553503 | ttr | 7276 | 0.11 | 反式 | ||
RS7311343 | CHR12 | 21228780 | ttr | 7276 | 0.06 | 反式 | ||
RS11177887 | CHR12 | 41093631 | ttr | 7276 | 0.07 | 反式 | ||
RS12305552 | CHR12 | 41797385 | ttr | 7276 | 0.11 | 反式 | ||
RS2069410 | CHR12 | 56364644 | ttr | 7276 | 4.62E-14 | 反式 | ||
RS17120736 | CHR12 | 58785277 | ttr | 7276 | 0.1 | 反式 | ||
RS11115597 | CHR12 | 83509142 | ttr | 7276 | 2.005e-4 | 反式 | ||
RS10746278 | CHR12 | 83789575 | ttr | 7276 | 0 | 反式 | ||
RS7979024 | CHR12 | 84506011 | ttr | 7276 | 0.19 | 反式 | ||
RS11105124 | CHR12 | 89375908 | ttr | 7276 | 0.07 | 反式 | ||
RS17837122 | CHR12 | 92660211 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS7972610 | CHR12 | 93486183 | ttr | 7276 | 0 | 反式 | ||
RS10859541 | CHR12 | 94010186 | ttr | 7276 | 0.03 | 反式 | ||
RS17021407 | CHR12 | 94013807 | ttr | 7276 | 0.13 | 反式 | ||
RS17031683 | CHR12 | 102005385 | ttr | 7276 | 0.14 | 反式 | ||
RS825045 | CHR12 | 102045030 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS6539020 | CHR12 | 102308189 | ttr | 7276 | 0.15 | 反式 | ||
RS4770243 | CHR13 | 22662276 | ttr | 7276 | 0.06 | 反式 | ||
RS1885898 | CHR13 | 22676828 | ttr | 7276 | 0.18 | 反式 | ||
RS1885900 | CHR13 | 22676939 | ttr | 7276 | 0.18 | 反式 | ||
RS1125957 | CHR13 | 22693170 | ttr | 7276 | 0.18 | 反式 | ||
RS17078563 | CHR13 | 23864835 | ttr | 7276 | 6.011E-4 | 反式 | ||
RS9670212 | CHR13 | 29070572 | ttr | 7276 | 0 | 反式 | ||
RS17053321 | CHR13 | 36577034 | ttr | 7276 | 0.16 | 反式 | ||
RS17834315 | CHR13 | 37991091 | ttr | 7276 | 3.047E-7 | 反式 | ||
RS17072833 | CHR13 | 49914392 | ttr | 7276 | 0.19 | 反式 | ||
RS575555 | CHR13 | 52437620 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS343134 | CHR13 | 60204988 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS11841288 | CHR13 | 60215833 | ttr | 7276 | 1.56E-4 | 反式 | ||
RS987035 | CHR13 | 106274330 | ttr | 7276 | 0.08 | 反式 | ||
RS16967008 | CHR13 | 106287437 | ttr | 7276 | 0.06 | 反式 | ||
RS16975617 | CHR13 | 110867407 | ttr | 7276 | 0.12 | 反式 | ||
RS10498433 | CHR14 | 52289530 | ttr | 7276 | 0 | 反式 | ||
RS17091014 | CHR14 | 56562713 | ttr | 7276 | 2.379E-4 | 反式 | ||
RS10483833 | CHR14 | 71165243 | ttr | 7276 | 0.04 | 反式 | ||
RS1642278 | CHR14 | 87273027 | ttr | 7276 | 0.09 | 反式 | ||
RS1743505 | CHR14 | 96143407 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS6576402 | CHR15 | 25310439 | ttr | 7276 | 0.16 | 反式 | ||
RS16946329 | CHR15 | 63324362 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS16946913 | CHR15 | 63653889 | ttr | 7276 | 0.13 | 反式 | ||
RS17694187 | CHR15 | 91881259 | ttr | 7276 | 0.02 | 反式 | ||
RS17524193 | CHR15 | 93222971 | ttr | 7276 | 0.07 | 反式 | ||
RS920567 | CHR15 | 98248480 | ttr | 7276 | 0.06 | 反式 | ||
RS931891 | CHR15 | 98293206 | ttr | 7276 | 0.03 | 反式 | ||
RS6598553 | CHR15 | 99339208 | ttr | 7276 | 0.08 | 反式 | ||
RS17634236 | CHR16 | 5067148 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS17142983 | CHR16 | 7294508 | ttr | 7276 | 0.03 | 反式 | ||
RS8056710 | CHR16 | 7447629 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS16972025 | CHR16 | 19461881 | ttr | 7276 | 0.14 | 反式 | ||
RS1557515 | CHR16 | 19462965 | ttr | 7276 | 0.12 | 反式 | ||
RS12596831 | CHR16 | 23385256 | ttr | 7276 | 0.03 | 反式 | ||
RS17666993 | CHR16 | 72146665 | ttr | 7276 | 0.03 | 反式 | ||
RS17667053 | CHR16 | 72147430 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS8051077 | CHR16 | 75036432 | ttr | 7276 | 0.16 | 反式 | ||
RS935931 | CHR16 | 8120821 | ttr | 7276 | 0 | 反式 | ||
RS1391765 | CHR17 | 8297465 | ttr | 7276 | 0.12 | 反式 | ||
RS8077034 | CHR17 | 12145884 | ttr | 7276 | 0.14 | 反式 | ||
SNP_A-2072200 | 0 | ttr | 7276 | 0.07 | 反式 | |||
RS4796760 | CHR17 | 40178214 | ttr | 7276 | 0.09 | 反式 | ||
RS4799294 | CHR18 | 38002283 | ttr | 7276 | 0.19 | 反式 | ||
RS17798004 | CHR18 | 70665382 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS17736134 | CHR18 | 70665805 | ttr | 7276 | 3.988e-4 | 反式 | ||
RS2469060 | CHR18 | 70673106 | ttr | 7276 | 3.988e-4 | 反式 | ||
RS2469009 | CHR18 | 70713334 | ttr | 7276 | 1.007E-4 | 反式 | ||
RS9962412 | CHR18 | 73427437 | ttr | 7276 | 0.13 | 反式 | ||
RS9965745 | CHR18 | 73429162 | ttr | 7276 | 0.12 | 反式 | ||
RS1943200 | CHR18 | 73462540 | ttr | 7276 | 0.18 | 反式 | ||
RS166727 | CHR19 | 30470254 | ttr | 7276 | 0.11 | 反式 | ||
RS8110995 | CHR19 | 40863841 | ttr | 7276 | 0.01 | 反式 | ||
RS2288529 | CHR19 | 55665688 | ttr | 7276 | 0.08 | 反式 | ||
RS12461195 | CHR19 | 55688575 | ttr | 7276 | 0.19 | 反式 | ||
RS1022791 | CHR20 | 10730770 | ttr | 7276 | 0.16 | 反式 | ||
RS6514759 | 0 | ttr | 7276 | 0.05 | 反式 | |||
RS409642 | CHR20 | 54250273 | ttr | 7276 | 0.03 | 反式 | ||
SNP_A-2019049 | 0 | ttr | 7276 | 0.07 | 反式 | |||
RS2835891 | CHR21 | 39056226 | ttr | 7276 | 0.2 | 反式 | ||
RS7275460 | CHR21 | 41447057 | ttr | 7276 | 0.03 | 反式 | ||
RS16993260 | CHR22 | 34300774 | ttr | 7276 | 0.12 | 反式 | ||
RS16993271 | CHR22 | 34307850 | ttr | 7276 | 0 | 反式 | ||
RS140059 | CHR22 | 37977417 | ttr | 7276 | 0.07 | 反式 | ||
RS17003586 | CHR22 | 43667457 | ttr | 7276 | 9.781E-4 | 反式 | ||
RS2269667 | CHR22 | 43699291 | ttr | 7276 | 0.03 | 反式 | ||
RS6008434 | CHR22 | 46665669 | ttr | 7276 | 0.08 | 反式 | ||
RS6007794 | CHR22 | 46685016 | ttr | 7276 | 0.04 | 反式 | ||
RS7290732 | CHR22 | 46691902 | ttr | 7276 | 0 | 反式 | ||
RS5961111 | Chrx | 54659538 | ttr | 7276 | 0.1 | 反式 | ||
RS5920627 | Chrx | 97385064 | ttr | 7276 | 0.03 | 反式 | ||
SNP_A-2027825 | 0 | ttr | 7276 | 6.667E-5 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
commd9 | 0.81 | 0.80 |
prkag1 | 0.80 | 0.76 |
gabarapl2 | 0.80 | 0.80 |
COPS4 | 0.79 | 0.75 |
ARPC4 | 0.79 | 0.76 |
ube2d2 | 0.78 | 0.77 |
ATP5B | 0.78 | 0.75 |
ube2e1 | 0.77 | 0.77 |
FAM54B | 0.77 | 0.73 |
POP4 | 0.77 | 0.73 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.18 | -0.64 | -0.62 |
AF347015.2 | -0.62 | -0.53 |
AF347015.8 | -0.62 | -0.53 |
AF347015.26 | -0.61 | -0.54 |
MT-ATP8 | -0.57 | -0.51 |
AF347015.15 | -0.57 | -0.49 |
mt-cyb | -0.57 | -0.49 |
AC100783.1 | -0.57 | -0.57 |
MT-CO2 | -0.56 | -0.47 |
AC016705.1 | -0.55 | -0.58 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005179 | 激素活性 | IEA | - | |
去:0005496 | 类固醇结合 | IEA | - | |
GO:0019841 | 视黄醇结合 | IEA | - | |
GO:0016918 | 视网膜结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006810 | 运输 | nas | 10841549 | |
去:0006590 | 甲状腺激素产生 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | nas | 14718574 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ATF4 | CREB-2 |creb2 |TAXREB67 |txreb | 激活转录因子4(税收响应增强子元素B67) | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
C7orf20 | CEE |CGI-20 | 染色体7开放阅读框20 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
CHD3 | Mi-2a |mi2-alpha |ZFH | 染色体群酶DNA结合蛋白3 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
DDR1 | cak |CD167 |DDR |EDDR1 |MCK10 |NEP |ntrk4 |ptk3 |ptk3a |RTK6 | TRKE | 盘状蛋白结构域受体酪氨酸激酶1 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
EEF1A1 | CCS-3 |CCS3 |EEF-1 |EEF1A |ef-tu |EF1A |FLJ25721 |graf-1ef |HNGC:16303 |leng7 | MGC102687 | MGC131894 | MGC16224 | PTI1 | eEF1A-1 | 真核翻译伸长因子1 alpha 1 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
Fez1 | - | 魅力和伸长蛋白Zeta 1(Zygin I) | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
hnrnph3 | 2H9 |FLJ34092 |HNRPH3 | 异质核核糖核蛋白H3(2H9) | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
HSPG2 | PLC |prcan |sja |SJS |SJS1 | 硫酸乙酰肝素蛋白聚糖2 | - | HPRD,Biogrid | 9307034 |
ikbkap | DKFZP781H1425 |dys |ELP1 |fd |FLJ12497 |ikap |iki3 |TOT1 | B细胞中Kappa光多肽基因增强子的抑制剂,激酶复合物相关蛋白 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
LRP2 | DBS |GP330 | 低密度脂蛋白相关蛋白2 | - | HPRD | 10982792 |
标记3 | ctak1 |KP78 |par1a | 地图/微管亲和调节激酶3 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
植物 | dyrk1ap3 |KIAA0273 |pahx-ap |pahxap1 | Phytanoyl-COA 2-羟化酶相互作用蛋白 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
RBP4 | - | 视黄醇结合蛋白4,血浆 | - | HPRD,Biogrid | 574085|8089102 |11853533|12593674 |
setDB1 | eset |kg1t |KIAA0067 |KMT1E | 设定域,分叉1 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
ttr | HST2651 |palb |TBPA | 经硫代蛋白 | 共晶结构 | Biogrid | 11243784 |
vim | FLJ36605 | 波形蛋白 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID HNF3B途径 | 45 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组淀粉样蛋白 | 83 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
剑麻结肠直肠腺瘤DN | 291 | 176 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
近代缺氧 | 8 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cervera SDHB目标2 | 114 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿斯顿主要抑郁症 | 49 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wong IFNA2电阻DN | 34 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HSIAO肝特异性基因 | 244 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血晚期祖先 | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yamazaki TCEB3靶向 | 175 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Col13a1 DN抑制Tuomisto肿瘤 | 17 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lein脉络丛标记 | 103 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李肝癌 | 49 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rizki肿瘤侵入性2D DN | 64 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Labbe Wnt3a靶向DN | 97 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TGFB1和WNT3A DN的LABBE目标 | 108 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CADWELL ATG16L1靶向DN | 70 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yauch刺猬信号传导旁分泌DN | 264 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CXCR6和PTCH1的SASAI目标 | 13 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌生存DN | 113 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向 | 504 | 321 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vandesluis Commd1目标4 | 19 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Servitja Islet HNF1A靶向DN | 109 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标 | 289 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-141/200a | 78 | 84 | M8 | HSA-MIR-141 | uaacacugucugugugugugaugg |
HSA-MIR-200A | uaacacugucuguguguguaaacgaugu |