基因页:FAM155A
概括?
基因 | 728215 |
象征 | FAM155A |
同义词 | - |
描述 | 具有序列相似性的家庭155成员a |
参考 | HGNC:HGNC:33877| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 13Q33.3 |
Pascal P值 | 0.003 |
胎儿β | -0.323 |
主持人 | 前扣带回皮层BA24 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2806519 | 13 | 107819097 | FAM155A | ENSG00000204442.2 | 8.9379E-7 | 0.02 | 699986 | gtex_brain_ba24 |
RS1927767 | 13 | 107820190 | FAM155A | ENSG00000204442.2 | 1.08502E-6 | 0.02 | 698893 | gtex_brain_ba24 |
RS2769916 | 13 | 107820389 | FAM155A | ENSG00000204442.2 | 1.08502E-6 | 0.02 | 698694 | gtex_brain_ba24 |
RS60334773 | 13 | 107821309 | FAM155A | ENSG00000204442.2 | 7.42832E-7 | 0.02 | 697774 | gtex_brain_ba24 |
RS138254583 | 13 | 107821767 | FAM155A | ENSG00000204442.2 | 1.13745E-6 | 0.02 | 697316 | gtex_brain_ba24 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FAM155A_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Corre多发性骨髓瘤 | 74 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 XPCS DN | 88 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 TTD DN | 84 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 | 681 | 420 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 349 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen IPS带有HCP H3K27Me3 | 102 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |