基因页：D2HGDH

Summary？
基因 728294
象征 D2HGDH
同义词 D2HGD
描述 D-2-羟基戊二酸脱氢酶
参考 MIM：609186|HGNC: HGNC:28358|ENSEMBL：ENSG00000180902|HPRD：14502|Vega：Otthumg00000151474
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q37.3
Pascal P值 0.101
Sherlock P值 0.52
胎儿β -0.11
DMG 1(#研究)
主持人 前扣带回皮层BA24
尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
Frontal Cortex BA9
Hypothalamus
伏隔核基底神经节
梭子基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别
元

Gene in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 2

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG00795812 2 242802009 D2HGDH 9.87E-5 -3.522 DMG：Vaneijk_2014
CG16173109 2 242945447 D2HGDH 0.001 -4.167 DMG：Vaneijk_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10497672 0 D2HGDH 728294 0.07 反式
RS6733823 2 242695900 D2HGDH ENSG00000180902.12 2.239E-6 0 21906 gtex_brain_ba24
RS35350837 2 242696329 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.76E-6 0 22335 gtex_brain_ba24
RS4425108 2 242697998 D2HGDH ENSG00000180902.12 9.154e-9 0 24004 gtex_brain_ba24
RS71430384 2 242700052 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.75E-6 0 26058 gtex_brain_ba24
RS71430385 2 242700960 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.234E-6 0 26966 gtex_brain_ba24
RS34762429 2 242701415 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.236E-6 0 27421 gtex_brain_ba24
RS6740752 2 242703183 D2HGDH ENSG00000180902.12 2.078E-6 0 29189 gtex_brain_ba24
RS6747623 2 242704061 D2HGDH ENSG00000180902.12 2.063 e-6 0 30067 gtex_brain_ba24
RS6756901 2 242707101 D2HGDH ENSG00000180902.12 2.011E-6 0 33107 gtex_brain_ba24
RS60611916 2 242680019 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.647E-9 0 6025 gtex_brain_putamen_basal
RS62191982 2 242680030 D2HGDH ENSG00000180902.12 3.736E-9 0 6036 gtex_brain_putamen_basal
RS4073890 2 242680366 D2HGDH ENSG00000180902.12 2.179E-9 0 6372 gtex_brain_putamen_basal
RS4073889 2 242680430 D2HGDH ENSG00000180902.12 8.288e-9 0 6436 gtex_brain_putamen_basal
RS62192001 2 242681588 D2HGDH ENSG00000180902.12 7.21E-10 0 7594 gtex_brain_putamen_basal
RS6756399 2 242682533 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.062E-9 0 8539 gtex_brain_putamen_basal
RS113611133 2 242682555 D2HGDH ENSG00000180902.12 2.534E-7 0 8561 gtex_brain_putamen_basal
RS62192002 2 242682844 D2HGDH ENSG00000180902.12 4.288e-10 0 8850 gtex_brain_putamen_basal
RS62192003 2 242683374 D2HGDH ENSG00000180902.12 7.367E-10 0 9380 gtex_brain_putamen_basal
RS62192004 2 242683471 D2HGDH ENSG00000180902.12 7.336e-10 0 9477 gtex_brain_putamen_basal
RS62192005 2 242683522 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.343E-9 0 9528 gtex_brain_putamen_basal
RS4366942 2 242683992 D2HGDH ENSG00000180902.12 4.981E-10 0 9998 gtex_brain_putamen_basal
rs4234097 2 242684115 D2HGDH ENSG00000180902.12 7.21E-10 0 10121 gtex_brain_putamen_basal
RS62192009 2 242684574 D2HGDH ENSG00000180902.12 7.21E-10 0 10580 gtex_brain_putamen_basal
RS35532480 2 242684945 D2HGDH ENSG00000180902.12 7.21E-10 0 10951 gtex_brain_putamen_basal
RS34293993 2 242685109 D2HGDH ENSG00000180902.12 5.801E-10 0 11115 gtex_brain_putamen_basal
RS62192013 2 242686171 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.087E-9 0 12177 gtex_brain_putamen_basal
RS35070043 2 242686529 D2HGDH ENSG00000180902.12 8.588E-10 0 12535 gtex_brain_putamen_basal
RS6715894 2 242687015 D2HGDH ENSG00000180902.12 8.824e-10 0 13021 gtex_brain_putamen_basal
RS6721985 2 242687154 D2HGDH ENSG00000180902.12 9.279E-10 0 13160 gtex_brain_putamen_basal
RS34647532 2 242687579 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.958e-11 0 13585 gtex_brain_putamen_basal
RS34519321 2 242688203 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.097E-9 0 14209 gtex_brain_putamen_basal
RS34767042 2 242688292 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.115E-9 0 14298 gtex_brain_putamen_basal
RS35386923 2 242688366 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.967E-9 0 14372 gtex_brain_putamen_basal
RS34077392 2 242688434 D2HGDH ENSG00000180902.12 2.176E-6 0 14440 gtex_brain_putamen_basal
RS35249772 2 242688442 D2HGDH ENSG00000180902.12 2.43e-6 0 14448 gtex_brain_putamen_basal
RS78280775 2 242688672 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.196E-9 0 14678 gtex_brain_putamen_basal
RS113047262 2 242688870 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.24e-9 0 14876 gtex_brain_putamen_basal
RS4675883 2 242689185 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.192 e-9 0 15191 gtex_brain_putamen_basal
RS4075957 2 242689263 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.591E-9 0 15269 gtex_brain_putamen_basal
RS4675882 2 242689957 D2HGDH ENSG00000180902.12 7.21E-10 0 15963 gtex_brain_putamen_basal
RS4073694 2 242691021 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.806E-6 0 17027 gtex_brain_putamen_basal
RS35061832 2 242692490 D2HGDH ENSG00000180902.12 4.235E-7 0 18496 gtex_brain_putamen_basal
RS34337830 2 242693824 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.043E-9 0 19830 gtex_brain_putamen_basal
RS62192024 2 242695497 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.923E-6 0 21503 gtex_brain_putamen_basal
RS6733823 2 242695900 D2HGDH ENSG00000180902.12 6.834e-12 0 21906 gtex_brain_putamen_basal
RS35350837 2 242696329 D2HGDH ENSG00000180902.12 7.758e-12 0 22335 gtex_brain_putamen_basal
RS62192027 2 242697106 D2HGDH ENSG00000180902.12 2.077E-6 0 23112 gtex_brain_putamen_basal
RS4425108 2 242697998 D2HGDH ENSG00000180902.12 4.704e-10 0 24004 gtex_brain_putamen_basal
RS34290285 2 242698640 D2HGDH ENSG00000180902.12 3.074E-6 0 24646 gtex_brain_putamen_basal
RS71430382 2 242699290 D2HGDH ENSG00000180902.12 5.093E-7 0 25296 gtex_brain_putamen_basal
RS71430384 2 242700052 D2HGDH ENSG00000180902.12 3.227e-12 0 26058 gtex_brain_putamen_basal
RS35305862 2 242700770 D2HGDH ENSG00000180902.12 2.69E-6 0 26776 gtex_brain_putamen_basal
RS71430385 2 242700960 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.938e-12 0 26966 gtex_brain_putamen_basal
RS34762429 2 242701415 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.749E-12 0 27421 gtex_brain_putamen_basal
RS2002092 2 242701647 D2HGDH ENSG00000180902.12 2.706E-6 0 27653 gtex_brain_putamen_basal
RS4538241 2 242702013 D2HGDH ENSG00000180902.12 3.486e-7 0 28019 gtex_brain_putamen_basal
RS4449174 2 242702538 D2HGDH ENSG00000180902.12 2.716E-6 0 28544 gtex_brain_putamen_basal
RS62192037 2 242702812 D2HGDH ENSG00000180902.12 2.714E-6 0 28818 gtex_brain_putamen_basal
RS6740752 2 242703183 D2HGDH ENSG00000180902.12 7.148e-12 0 29189 gtex_brain_putamen_basal
RS6754066 2 242703363 D2HGDH ENSG00000180902.12 2.694E-6 0 29369 gtex_brain_putamen_basal
RS5839764 2 242703618 D2HGDH ENSG00000180902.12 4.497E-7 0 29624 gtex_brain_putamen_basal
RS6747623 2 242704061 D2HGDH ENSG00000180902.12 2.613e-12 0 30067 gtex_brain_putamen_basal
RS6756901 2 242707101 D2HGDH ENSG00000180902.12 2.629e-12 0 33107 gtex_brain_putamen_basal
rs6707874 2 242709363 D2HGDH ENSG00000180902.12 2.527E-8 0 35369 gtex_brain_putamen_basal
RS7599470 2 242709807 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.361E-6 0 35813 gtex_brain_putamen_basal
RS7582582 2 242710079 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.295E-9 0 36085 gtex_brain_putamen_basal
RS7582691 2 242710197 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.163E-9 0 36203 gtex_brain_putamen_basal
RS7608524 2 242710236 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.581E-7 0 36242 gtex_brain_putamen_basal
rs10755057 2 242710662 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.971E-9 0 36668 gtex_brain_putamen_basal
RS10933568 2 242710935 D2HGDH ENSG00000180902.12 6.561e-11 0 36941 gtex_brain_putamen_basal
RS10933569 2 242710954 D2HGDH ENSG00000180902.12 6.617e-11 0 36960 gtex_brain_putamen_basal
RS12998967 2 242711227 D2HGDH ENSG00000180902.12 7.089e-11 0 37233 gtex_brain_putamen_basal
RS62192043 2 242711282 D2HGDH ENSG00000180902.12 2.241E-7 0 37288 gtex_brain_putamen_basal
RS28631456 2 242711353 D2HGDH ENSG00000180902.12 4.133E-8 0 37359 gtex_brain_putamen_basal
RS28605921 2 242711364 D2HGDH ENSG00000180902.12 5.031E-9 0 37370 gtex_brain_putamen_basal
RS71820871 2 242711550 D2HGDH ENSG00000180902.12 3.663e-12 0 37556 gtex_brain_putamen_basal
RS13408030 2 242711574 D2HGDH ENSG00000180902.12 5.293e-12 0 37580 gtex_brain_putamen_basal
rs7563672 2 242712870 D2HGDH ENSG00000180902.12 2.916E-7 0 38876 gtex_brain_putamen_basal
RS62193062 2 242728009 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.809E-7 0 54015 gtex_brain_putamen_basal
RS62193063 2 242728098 D2HGDH ENSG00000180902.12 8.72E-7 0 54104 gtex_brain_putamen_basal
rs62193065 2 242728617 D2HGDH ENSG00000180902.12 8.72E-7 0 54623 gtex_brain_putamen_basal
rs62193068 2 242730333 D2HGDH ENSG00000180902.12 6.639E-7 0 56339 gtex_brain_putamen_basal
RS28433874 2 242733486 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.335E-6 0 59492 gtex_brain_putamen_basal
rs62193075 2 242735841 D2HGDH ENSG00000180902.12 7.53e-7 0 61847 gtex_brain_putamen_basal
rs62193076 2 242735848 D2HGDH ENSG00000180902.12 2.394E-6 0 61854 gtex_brain_putamen_basal
rs62193077 2 242736221 D2HGDH ENSG00000180902.12 1.117E-6 0 62227 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
反应组丙酮酸代谢和柠檬酸TCA循环 48 32 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome TCA循环和呼吸电子传输 141 85 All SZGR 2.0 genes in this pathway
中村肿瘤区周围与中央DN 634 384 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781 1082 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dairkee Tert目标 380 213 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Sansom APC目标需要MYC 210 123 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CADWELL ATG16L1 TARGETS DN 70 43 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bredemeyer抹布通过ATM而不是通过NFKB DN发出的信号 38 23 All SZGR 2.0 genes in this pathway